基因页：NOL4
概括？
| 基因 | 8715 |
| 象征 | NOL4 |
| 同义词 | CT125 | HRIHFB2255 | NOLP |
| 描述 | 核仁蛋白4 |
| 参考 | MIM：603577|HGNC：HGNC：7870|ENSEMBL：ENSG00000101746|HPRD：04657|Vega：Otthumg00000132291 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 18Q12 |
| Pascal P值 | 2.661E-5 |
| Sherlock P值 | 0.559 |
| 胎儿β | 1.218 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12911428 | 18 | 31804742 | NOL4 | 1.06E-10 | -0.011 | 4.65e-7 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG21016956 | 18 | 31802419 | NOL4 | 2E-8 | -0.018 | 6.95e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6586487 | CHR1 | 18339747 | NOL4 | 8715 | 0.1 | 反式 | ||
| RS17472583 | CHR1 | 18340024 | NOL4 | 8715 | 0.18 | 反式 | ||
| RS17432613 | CHR1 | 18346091 | NOL4 | 8715 | 0.12 | 反式 | ||
| RS6902183 | CHR6 | 121963786 | NOL4 | 8715 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| sidt1 | 0.85 | 0.76 |
| RASSF5 | 0.84 | 0.73 |
| KCNC2 | 0.84 | 0.74 |
| TRPM2 | 0.83 | 0.77 |
| PPM1H | 0.83 | 0.75 |
| NDRG4 | 0.82 | 0.75 |
| OLFM3 | 0.81 | 0.71 |
| sts | 0.81 | 0.69 |
| 引用 | 0.81 | 0.67 |
| GPR123 | 0.81 | 0.69 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Bcl7c | -0.45 | -0.59 |
| C9orf46 | -0.42 | -0.52 |
| FAM36A | -0.41 | -0.45 |
| GTF3C6 | -0.41 | -0.49 |
| AC006276.2 | -0.40 | -0.45 |
| RPL23A | -0.40 | -0.51 |
| exosc8 | -0.40 | -0.45 |
| Dynlt1 | -0.40 | -0.55 |
| AC135586.1 | -0.39 | -0.46 |
| RPLP1 | -0.39 | -0.46 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| H3K27me3 | 97 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF ICP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 38 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS ICP带有H3K27Me3 | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 137 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |