基因页:MBTPS1
概括?
基因 | 8720 |
象征 | MBTPS1 |
同义词 | PCSK8 | S1P | SKI-1 |
描述 | 膜结合转录因子肽酶,位点1 |
参考 | MIM:603355|HGNC:HGNC:15456|Ensembl:ENSG00000140943|HPRD:04522|Vega:Otthumg00000137639 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q24 |
Pascal P值 | 0.07 |
Sherlock P值 | 0.716 |
TADA P值 | 0.018 |
胎儿β | 0.651 |
支持 | COMPOSITESET Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MBTPS1 | CHR16 | 84104320 | G | 一个 | NM_003791 | p.552s> f | 错过 | 精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MBTPS1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SDPR | 0.61 | 0.64 |
fgr | 0.61 | 0.57 |
GATA2 | 0.59 | 0.57 |
CXORF36 | 0.57 | 0.60 |
C1QTNF1 | 0.57 | 0.53 |
HLA-E | 0.57 | 0.57 |
FAM38A | 0.57 | 0.57 |
TGM2 | 0.57 | 0.58 |
mmrn2 | 0.57 | 0.57 |
尔格 | 0.56 | 0.57 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TCTEX1D2 | -0.42 | -0.46 |
Med19 | -0.42 | -0.43 |
COQ3 | -0.41 | -0.42 |
UCHL3 | -0.41 | -0.42 |
FRG1 | -0.40 | -0.45 |
OCIAD2 | -0.40 | -0.43 |
C18orf21 | -0.40 | -0.43 |
PSMB7 | -0.40 | -0.42 |
ZNF613 | -0.40 | -0.41 |
C12orf45 | -0.39 | -0.44 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | 塔斯 | 谷氨酸(GO期限:7) | 9809072 |
去:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | 塔斯 | 9809072 | |
去:0008202 | 类固醇代谢过程 | IEA | - | |
去:0008203 | 胆固醇代谢过程 | IEA | - | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0005788 | 内质网腔 | 塔斯 | 9809072 | |
去:0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005783 | 内质网 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome糖尿病途径 | 133 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ATF6 Alpha对伴侣的反应组激活 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome展开的蛋白质反应 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP | 117 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN | 137 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向DN | 62 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AIYAR COBRA1靶向 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo卡路里限制肌肉DN | 87 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gratias视网膜细胞瘤16Q24 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |