基因页：ctnnal1
概括？
| 基因 | 8727 |
| 象征 | ctnnal1 |
| 同义词 | ACRP | Cllp | alpha-catu |
| 描述 | catenin alpha样1 |
| 参考 | MIM：604785|HGNC：HGNC：2512|Ensembl：ENSG00000119326|HPRD：09210|Vega：Otthumg00000020466 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9q31.2 |
| Pascal P值 | 0.021 |
| Sherlock P值 | 0.519 |
| 胎儿β | 0.454 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10979615 | Chr9 | 111698788 | ctnnal1 | 8727 | 0.05 | 顺式 | ||
| RS12351693 | Chr9 | 111711514 | ctnnal1 | 8727 | 0.13 | 顺式 | ||
| RS4978765 | Chr9 | 111735884 | ctnnal1 | 8727 | 0.09 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PGRMC1 | 0.76 | 0.82 |
| ZIC1 | 0.72 | 0.26 |
| CD247 | 0.71 | 0.19 |
| CHST1 | 0.70 | 0.57 |
| na | 0.70 | 0.23 |
| ZIC4 | 0.70 | 0.13 |
| PRMT6 | 0.69 | 0.72 |
| Prox1 | 0.69 | 0.42 |
| ID4 | 0.68 | 0.32 |
| ZIC2 | 0.68 | 0.27 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.41 | -0.46 |
| AF347015.2 | -0.40 | -0.45 |
| AF347015.8 | -0.40 | -0.46 |
| AF347015.21 | -0.40 | -0.42 |
| AF347015.18 | -0.39 | -0.49 |
| AF347015.31 | -0.39 | -0.45 |
| mt-cyb | -0.38 | -0.45 |
| AF347015.26 | -0.38 | -0.45 |
| AF347015.33 | -0.38 | -0.45 |
| AC098691.2 | -0.38 | -0.46 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘vmyb的目标 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2A DN | 141 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meinhold卵巢癌低级 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Furukawa Dusp6靶向PCI35 DN | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SANA TNF信号DN | 90 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿斯顿主要抑郁症 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SANA对IFNG DN的回应 | 85 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Radmacher AML预后 | 78 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahajan对IL1A DN的反应 | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bandres对Carmustin Mgmt的反应48小时 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ouyang前列腺癌进展DN | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 | 125 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| winnepenninckx黑色素瘤转移 | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 | 76 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |