基因页面:CBR1
总结吗?
| GeneID | 873年 |
| 象征 | CBR1 |
| 同义词 | CBR | SDR21C1 | hCBR1 |
| 描述 | 羰基还原酶1 |
| 参考 | MIM: 114830|HGNC: HGNC: 1548|运用:ENSG00000159228|HPRD: 00267|织女:OTTHUMG00000086618 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 21 q22.13 |
| 帕斯卡假定值 | 0.039 |
| 夏洛克假定值 | 0.308 |
| 度假定值 | 度:Zhao_2015: p = 2.25 e-04: q = 0.0860 |
| 胎儿β | -1.841 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
| 支持 | CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 度:Zhao_2015 | 核糖核酸测序分析 | 转录组测序和全基因组关联分析揭示溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑精神分裂症和双相情感障碍。 | |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.0044 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16906244 | chr8 | 137720394 | CBR1 | 873年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs3911702 | chr8 | 137751039 | CBR1 | 873年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs7842167 | chr8 | 137841733 | CBR1 | 873年 | 0.07 | 反式 | ||
| rs2845741 | 21 | 37365053 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 1.788 e-6 | 0.01 | -77186年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2845742 | 21 | 37365056 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 1.788 e-6 | 0.01 | -77183年 | gtex_brain_ba24 |
| rs112953000 | 21 | 37365315 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 9.587 e - | 0.01 | -76924年 | gtex_brain_ba24 |
| rs77372912 | 21 | 37366070 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 1.572 e-6 | 0.01 | -76169年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7280453 | 21 | 37373027 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 6.781 e - | 0.01 | - 69212. | gtex_brain_ba24 |
| rs7280598 | 21 | 37373146 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 6.663 e - | 0.01 | -69093年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2032319 | 21 | 37373722 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 6.166 e - | 0.01 | -68517年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2835228 | 21 | 37375643 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 2.539 e - | 0.01 | -66596年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7282699 | 21 | 37376765 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.134 e - | 0.01 | -65474年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2276228 | 21 | 37377890 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.153 e - | 0.01 | -64349年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2254446 | 21 | 37378153 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.081 e - | 0.01 | -64086年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2013780 | 21 | 37378434 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 3.799 e - | 0.01 | -63805年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6517324 | 21 | 37398616 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -43623年 | gtex_brain_ba24 |
| rs13047144 | 21 | 37399433 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -42806年 | gtex_brain_ba24 |
| rs8132145 | 21 | 37401581 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.304 e - | 0.01 | -40658年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4817762 | 21 | 37405265 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.304 e - | 0.01 | -36974年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2835237 | 21 | 37406085 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -36154年 | gtex_brain_ba24 |
| rs743422 | 21 | 37406678 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -35561年 | gtex_brain_ba24 |
| rs762364 | 21 | 37406849 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -35390年 | gtex_brain_ba24 |
| rs72138966 | 21 | 37408608 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 1.74 e-6 | 0.01 | -33631年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2835248 | 21 | 37417489 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -24750年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2835250 | 21 | 37419207 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -23032年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2835254 | 21 | 37419786 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -22453年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2835255 | 21 | 37419844 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -22395年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1811076 | 21 | 37420102 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 1.83 e - | 0.01 | -22137年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2018721 | 21 | 37422966 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -19273年 | gtex_brain_ba24 |
| rs762360 | 21 | 37425955 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 8.537 e - | 0.01 | -16284年 | gtex_brain_ba24 |
| rs762361 | 21 | 37425971 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 8.537 e - | 0.01 | -16268年 | gtex_brain_ba24 |
| rs11701298 | 21 | 37431719 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.326 e - | 0.01 | -10520年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7281482 | 21 | 37433156 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 4.328 e - | 0.01 | -9083年 | gtex_brain_ba24 |
| rs8133454 | 21 | 37437063 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 1.78 e-6 | 0.01 | -5176年 | gtex_brain_ba24 |
| rs8134917 | 21 | 37437249 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 1.07 e-6 | 0.01 | -4990年 | gtex_brain_ba24 |
| rs8130498 | 21 | 37438282 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 1.026 e-6 | 0.01 | -3957年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6517327 | 21 | 37440892 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 1.352 e-6 | 0.01 | -1347年 | gtex_brain_ba24 |
| rs3787728 | 21 | 37443893 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 1.787 e-6 | 0.01 | 1654年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4239798 | 21 | 37446452 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 8.961 e - | 0.01 | 4213年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2156407 | 21 | 37447711 | CBR1 | ENSG00000159228.8 | 8.961 e - | 0.01 | 5472年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004090 | 羰基还原酶(NADPH)活动 | 助教 | 9740676 | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17353931 | |
| 去:0050221 | prostaglandin-E2 9-reductase活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016491 | 氧化还原酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0047021 | 15-hydroxyprostaglandin脱氢酶(辅酶ii +)活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0055114 | 氧化还原 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG花生四烯酸代谢 | 58 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘SOX4 DN的目标 | 309年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 | 783年 | 507年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN | 455年 | 304年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标G | 238年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRUETZMANN胰腺癌起来 | 358年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN | 517年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL CIS | 128年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肝癌MYC TGFA | 61年 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肝癌ACOX1 | 64年 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 史密斯叔DN的目标 | 87年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 任肺泡横纹肌肉瘤DN | 408年 | 274年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 对紫外线C7 SESTO回应 | 68年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伯顿脂肪生成6 | 189年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MCGARVEY甲基化沉默的结肠癌 | 42 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYAULT肝癌子类G6 | 65年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| S3 HOSHIDA肝癌子类 | 266年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 么时间响应黄体酮集群9 | 76年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过甲基化NOUSHMEHR GBM沉默 | 50 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆EZH2的目标了 | 295年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王SIRT1紧脂肪形成的基因 | 28 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SERVITJA肝脏HNF1A目标 | 135年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |