SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因ID	8737
Symbol	RIPK1
同义词	RIP \| RIP-1 \| RIP1
描述	受体相互作用丝氨酸/苏氨酸激酶1
参考	MIM:603453\|HGNC:HGNC:10019\|Ensembl:ENSG00000137275\|HPRD:04583\|Vega：Otthumg0000000014134
基因type	protein-coding
地图位置	6p25.2
Pascal P值	0.053
Fetal beta	0.457
DMG	1（＃研究）
eGene	小脑半球 Cerebellum 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG:Jaffe_2016	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05.	1
GSMA_I	基因组扫描荟萃分析	Psr: 0.0159

第一节遗传学和表观遗传学注释

差异甲基化基因

探测	Chromosome	Position	最近的基因	P (dis)	beta（dis）	FDR (dis)	Study
CG12534777	6	3064469	RIPK1	2.56E-9	-0.011	1.88E-6	DMG:Jaffe_2016

EQTL注释

SNP ID	Chromosome	Position	eGene	基因Entrez ID	PVALUE	qvalue	TSS distance	eQTL type
rs9501885	chr6	2741186	RIPK1	8737		0.15		cis
RS4864466	chr4	54403975	RIPK1	8737		0.16		trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
C3orf49	0.77	0.77
Plekha1	0.74	0.74
MAPK10	0.74	0.70
man1c1	0.74	0.77
TBRG1	0.73	0.75
SMYD2	0.73	0.72
PIK3R1	0.73	0.75
IQWD1	0.73	0.72
SESN1	0.73	0.71
PIP4K2C	0.72	0.73

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
RAB13	-0.42	-0.50
CLEC3B	-0.40	-0.51
AF347015.21	-0.39	-0.29
AF347015.18	-0.37	-0.27
IL32	-0.37	-0.33
BTBD17	-0.37	-0.43
GPR39	-0.35	-0.39
MPST	-0.35	-0.34
NME4	-0.34	-0.36
apoe	-0.34	-0.26

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function	去的术语	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0000166	核苷酸结合	IEA		-
GO:0005515	protein binding	新闻学会		10356400
GO:0005524	ATP结合	IEA		-
GO:0004674	蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性	塔斯		8612133
去：0004713	protein tyrosine kinase activity	IEA		-
GO:0016740	transferase activity	IEA		-
Biological process	去的术语	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0006468	蛋白氨基酸磷酸化	IEA		-
去：0007165	signal transduction	塔斯		8612133
GO:0008633	activation of pro-apoptotic gene products	EXP		14644197
去：0006915	apoptosis	塔斯		8612133
GO：0043123	I-kappab激酶/NF-kappab级联的积极调节	IEP		12761501
细胞分量	去的术语	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
去：0005829	cytosol	EXP		7758105\|12692549\|12887920 \|15064760
GO:0005737	细胞质	IEA		-

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
CASP10	Alps2 \|flice2 \|MCH4	caspase 10, apoptosis-related cysteine peptidase	Affinity Capture-Western	BioGRID	11002417
CASP8	ALPS2B \| CAP4 \| FLICE \| FLJ17672 \| MACH \| MCH5 \| MGC78473	caspase 8，与凋亡相关的半胱氨酸肽酶	-	HPRD，Biogrid	11002417
CFLAR	CASH \| CASP8AP1 \| CLARP \| Casper \| FLAME \| FLAME-1 \| FLAME1 \| FLIP \| I-FLICE \| MRIT \| c-FLIP \| c-FLIPL \| c-FLIPR \| c-FLIPS	CASP8and FADD-like apoptosis regulator	-	HPRD，Biogrid	10837247
克拉德	MGC9163 \|RAIDD	CASP2 and RIPK1 domain containing adaptor with death domain	-	HPRD，Biogrid	8985253\|9044836
EGFR	ERBB \| ERBB1 \| HER1 \| PIG61 \| mENA	epidermal growth factor receptor (erythroblastic leukemia viral (v-erb-b) oncogene homolog, avian)	-	HPRD，Biogrid	11116146
fadd	Gig3 \|MGC8528 \|Mort1	FAS（TNFRSF6）通过死亡域关联	两个杂交	BioGRID	11854271
fadd	Gig3 \|MGC8528 \|Mort1	FAS（TNFRSF6）通过死亡域关联	-	HPRD	11002422
fas	ALPS1A \| APO-1 \| APT1 \| CD95 \| FAS1 \| FASTM \| TNFRSF6	Fas (TNF receptor superfamily, member 6)	-	HPRD，Biogrid	7538908\|9740801
HSP90AA1	FLJ31884 \| HSP86 \| HSP89A \| HSP90A \| HSP90N \| HSPC1 \| HSPCA \| HSPCAL1 \| HSPCAL4 \| HSPN \| Hsp89 \| Hsp90 \| LAP2	热休克蛋白90KDAα（胞质），A类成员1	-	HPRD	10744744
HSPA8	HSC54 \| HSC70 \| HSC71 \| HSP71 \| HSP73 \| HSPA10 \| LAP1 \| MGC131511 \| MGC29929 \| NIP71	热休克70KDA蛋白8	-	HPRD	14743216
IKBKG	AMCBX1 \|FIP-3 \|fip3 \|fip3p \|ikk-gamma \|IP \|IP1 \|IP2 \|IPD2 \|Nemo	inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase gamma	-	HPRD，Biogrid	10880512
MAP3K14	FTDCR1B \| HS \| HSNIK \| NIK	有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶14	-	HPRD，Biogrid	11116146
MAP3K3	MAPKKK3 \| MEKK3	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3	-	HPRD，Biogrid	11429546
PTK2	Fadk \|fak \|fak1 \|pp125fak	PTK2蛋白酪氨酸激酶2	FAK interacts with RIP.	BIND	15121855
RIPK3	RIP3	receptor-interacting serine-threonine kinase 3	-	HPRD，Biogrid	10339433
RNF216	TRIAD3 \| U7I1 \| UBCE7IP1 \| ZIN	ring finger protein 216	-	HPRD，Biogrid	11854271
SQSTM1	A170 \|OSIL \|PDB3 \|zip3 \|p60 \|p62 \|p62b	隔离1	-	HPRD，Biogrid	10356400
TICAM1	MGC35334 \| PRVTIRB \| TICAM-1 \| TRIF	toll-like receptor adaptor molecule 1	Affinity Capture-Western	BioGRID	15064760
tnfaip3	A20 \|MGC104522 \|MGC138687 \|MGC138688 \|otud7c \|TNFA1P2	肿瘤坏死因子，α诱导的蛋白3	A20泛素化和去泛素化。	BIND	15258597
TNFRSF10A	APO2 \| CD261 \| DR4 \| MGC9365 \| TRAILR-1 \| TRAILR1	肿瘤坏死因子受体超家族，成员10a	-	HPRD	9430227
TNFRSF10B	CD262 \| DR5 \| KILLER \| KILLER/DR5 \| TRAIL-R2 \| TRAILR2 \| TRICK2 \| TRICK2A \| TRICK2B \| TRICKB \| ZTNFR9	肿瘤坏死因子受体超家族，成员10b	-	HPRD，Biogrid	9430227
TNFRSF1A	CD120a \| FPF \| MGC19588 \| TBP1 \| TNF-R \| TNF-R-I \| TNF-R55 \| TNFAR \| TNFR1 \| TNFR55 \| TNFR60 \| p55 \| p55-R \| p60	肿瘤坏死因子受体超家族，成员1a	-	HPRD，Biogrid	8612133
TRADD	Hs.89862 \| MGC11078	通过死亡域与TNFRSF1A相关	-	HPRD，Biogrid	8612133
TRAF1	EBI6 \| MGC:10353	TNF受体相关因子1	-	HPRD，Biogrid	8612133
TRAF2	MGC:45012 \| TRAP \| TRAP3	TNF受体相关因子2	-	HPRD，Biogrid	8612133\|8702708
TRAF2	MGC:45012 \| TRAP \| TRAP3	TNF受体相关因子2	TRAF2 ubiquitinates RIP.	BIND	15258597
TRAF2	MGC:45012 \| TRAP \| TRAP3	TNF受体相关因子2	TRAF2与RIP相互作用。	BIND	8702708
TRAF3	CAP-1 \| CD40bp \| CRAF1 \| LAP1	TNF受体相关因子3	-	HPRD，Biogrid	8612133
TRAF5	MGC：39780 \|RNF84	TNF受体相关因子5	-	HPRD，Biogrid	11479302
TRIM38	MGC8946 \|RNF15 \|roret	tripartite motif-containing 38	-	HPRD	11854271
trpc4ap	C20orf188 \| TRRP4AP \| TRUSS	transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 4 associated protein	Affinity Capture-Western	BioGRID	14585990
TUBA3C	tuba2 \|BA408E5.3	微管蛋白，α3C	-	HPRD	14743216
ZFAND5	ZA20D2 \| ZFAND5A \| ZNF216	锌指AN1型域5	ZNF216与RIP相互作用。	BIND	14754897

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
kegg凋亡	88	62	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TOLL LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY	102	88	该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg钻机我喜欢受体信号通路	71	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg胞质DNA感应途径	56	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA RELA PATHWAY	16	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CERAMIDE PATHWAY	22	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA HIVNEF PATHWAY	58	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔尔死亡道路	33	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA KERATINOCYTE PATHWAY	46	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MAPK途径	87	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NFKB途径	23	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA P38MAPK PATHWAY	40	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA SODD PATHWAY	10	7	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA应力路径	25	18	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA TNFR1 PATHWAY	29	21	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TNFR2途径	18	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST TUMOR NECROSIS FACTOR PATHWAY	29	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
St FAS信号通路	65	54	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID p38 alpha beta途径	31	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRAIL PATHWAY	28	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAS PATHWAY	38	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TNF途径	46	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CERAMIDE PATHWAY	48	37	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIV NEF途径	35	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CASPASE PATHWAY	52	39	该途径中的所有SZGR 2.0基因
凋亡的反应组外途径	13	8	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trif介导的TLR3信号传导	74	54	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RIP MEDIATED NFKB ACTIVATION VIA DAI	18	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NFKB ACTIVATION THROUGH FADD RIP1 PATHWAY MEDIATED BY CASPASE 8 AND10	12	9	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导	72	53	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RIG I MDA5 MEDIATED INDUCTION OF IFN ALPHA BETA PATHWAYS	73	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IKK复合物由RIP1介导	10	7	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡	148	94	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INNATE IMMUNE SYSTEM	279	178	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ACTIVATED TLR4 SIGNALLING	93	69	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统	933	616	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TOLL RECEPTOR CASCADES	118	84	该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSMAN BLADDER CANCER DN	406	230	该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up	431	237	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN	1781年	1082	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN	770	415	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scheidereit IKK相互作用蛋白	58	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标	988	594	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SOX2 TARGETS	734	436	该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞	225	163	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS EARLY PROGENITOR	532	309	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV ALL UP	120	89	该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN	312	203	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 6HR UP	71	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zamora NOS2靶向DN	96	71	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE RESPONSE CLUSTER D3	61	39	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 8小时	47	39	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RESPONSE TO TRABECTEDIN DN	271	175	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MAHAJAN RESPONSE TO IL1A UP	81	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DURCHDEWALD SKIN CARCINOGENESIS DN	264	168	该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激	1229	713	该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村掺杂早期	66	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 4HR UP	55	41	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN	1972年	1213	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上	1839年	928	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：RIPK1