概括
基因 8739
象征 hrk
同义词 DP5 | Harakiri
描述 Harakiri,Bcl2相互作用蛋白
参考 MIM:603447|HGNC:HGNC:5185|HPRD:04581|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q24.22
Pascal P值 0.146
胎儿β -1.121
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14276619 12 117319577 hrk 2.2e-8 -0.023 7.38e-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6772863 CHR3 72095174 hrk 8739 0.03 反式
RS17009330 CHR3 72096814 hrk 8739 0.11 反式
RS7677329 CHR4 21586153 hrk 8739 0.06 反式
RS4607971 Chr10 19407890 hrk 8739 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SEC24C 0.96 0.96
TNPO3 0.95 0.96
DCAF7 0.95 0.97
ZNF317 0.95 0.96
vprbp 0.95 0.96
CPSF7 0.95 0.95
TMCC1 0.95 0.96
DDX17 0.95 0.95
DHX8 0.95 0.96
CNOT1 0.94 0.96
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.79 -0.91
MT-CO2 -0.78 -0.91
AF347015.27 -0.77 -0.89
FXYD1 -0.76 -0.87
C5orf53 -0.76 -0.79
AF347015.33 -0.76 -0.87
mt-cyb -0.75 -0.87
S100B -0.74 -0.83
ifi27 -0.74 -0.85
AF347015.8 -0.74 -0.89

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID ATF2途径 59 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlesinger甲基化的癌症 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卫生部对干扰素beta的反应 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1B目标 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Asgharzadeh神经母细胞瘤生存率差DN 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn 88 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍尔曼泼尼松龙的抗性 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因