基因页:RIPK2
概括?
基因 | 8767 |
象征 | RIPK2 |
同义词 | card3 | cardiak | cck | gig30 | rick | rip2 |
描述 | 受体相互作用丝氨酸/苏氨酸激酶2 |
参考 | MIM:603455|HGNC:HGNC:10020|ENSEMBL:ENSG00000104312|HPRD:04585|Vega:Otthumg00000163809 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q21 |
Pascal P值 | 0.958 |
胎儿β | -1.167 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG18123581 | 8 | 90772386 | RIPK2 | 5.032E-4 | -0.688 | 0.047 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RIPK2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KDM2A | 0.93 | 0.94 |
BICD2 | 0.93 | 0.95 |
PRDM15 | 0.91 | 0.93 |
Rapgef1 | 0.91 | 0.92 |
TGFBRAP1 | 0.91 | 0.92 |
TSC1 | 0.91 | 0.93 |
sipa1l3 | 0.91 | 0.93 |
NCOR1 | 0.91 | 0.92 |
ZNF236 | 0.90 | 0.93 |
HERC2 | 0.90 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.72 | -0.76 |
higd1b | -0.70 | -0.76 |
MT-CO2 | -0.69 | -0.75 |
C1orf54 | -0.69 | -0.83 |
AF347015.21 | -0.68 | -0.80 |
FXYD1 | -0.68 | -0.70 |
ifi27 | -0.66 | -0.68 |
AF347015.27 | -0.66 | -0.70 |
AF347015.33 | -0.65 | -0.67 |
mt-cyb | -0.65 | -0.69 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0004871 | 信号传感器活性 | 塔斯 | 9642260 | |
去:0030274 | LIM域结合 | IPI | 15657077 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | 经验 | 17468049 | |
去:0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | 塔斯 | 9642260 | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0016301 | 激酶活性 | IEA | - | |
GO:0050700 | 卡域绑定 | IPI | 11087742 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 9642260 | |
去:0006954 | 炎症反应 | 塔斯 | 9705938 | |
去:0043065 | 凋亡的阳性调节 | IEA | - | |
去:0042098 | T细胞增殖 | IEA | - | |
去:0051092 | NF-kappab转录因子活性的正调控 | IEA | - | |
GO:0043123 | I-kappab激酶/NF-kappab级联的积极调节 | IEP | 12761501 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 经验 | 17468049 | |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BIRC2 | API1 |hiap2 |hiap-2 |mihb |RNF48 |CIAP1 | 细菌病毒IAP重复含2 | - | HPRD,Biogrid | 9642260 |
BIRC3 | AIP1 |API2 |CIAP2 |haip1 |hiap1 |MALT2 |mihc |RNF49 | 细菌病毒IAP重复含量3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9705938 |
卡16 | 警察|COP1 |伪冰 | caspase招聘域家庭,成员16 | - | HPRD | 11432859|11536016 |
卡16 | 警察|COP1 |伪冰 | caspase招聘域家庭,成员16 | - | HPRD | 11432859 |
卡6 | Cincin1 | caspase招聘域家庭,成员6 | - | HPRD,Biogrid | 12775719 |
CASP1 | 冰|IL1BC |P45 | caspase 1,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶(白介素1,β,转化酶) | - | HPRD,Biogrid | 9705938 |
CASP8 | ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 | caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD | 9575181 |
CD40 | BP50 |CDW40 |MGC9013 |tnfrsf5 |P50 | CD40分子,TNF受体超家族成员5 | - | HPRD,Biogrid | 9642260 |
Cflar | 现金|casp8ap1 |克拉普|卡斯珀|火焰|火焰1 |火焰1 |翻转|i-flice |MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS | CASP8和FADD样细胞凋亡调节剂 | - | HPRD,Biogrid | 9575181 |
警察 | 克尔托 | 网格蛋白排序的蛋白质 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11432859 |
HSPA8 | HSC54 |HSC70 |HSC71 |HSP71 |HSP73 |HSPA10 |lap1 |MGC131511 |MGC29929 |NIP71 | 热休克70KDA蛋白8 | - | HPRD | 14743216 |
ikbkg | AMCBX1 |FIP-3 |fip3 |fip3p |ikk-gamma |IP |IP1 |IP2 |IPD2 |Nemo | B细胞,激酶γ中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 | - | HPRD,Biogrid | 10880512 |
KCTD12 | C13orf2 |FLJ33073 |KIAA1778 |pfet1 |pfetin | 含12个钾通道四聚化结构域 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
NOD1 | card4 |Clr7.1 |NLRC1 | 包含1个的核苷酸结合寡聚结构域 | NOD1与Rick活性相互作用并增强。 | 绑定 | 10329646 |
NOD1 | card4 |Clr7.1 |NLRC1 | 包含1个的核苷酸结合寡聚结构域 | - | HPRD,Biogrid | 10329646 |
nod2 | Acug |Blau |card15 |CD |Clr16.3 |IBD1 |NLRC2 |nod2b |psoras1 | 包含2的核苷酸结合寡聚结构域 | - | HPRD,Biogrid | 11087742 |
nod2 | Acug |Blau |card15 |CD |Clr16.3 |IBD1 |NLRC2 |nod2b |psoras1 | 包含2的核苷酸结合寡聚结构域 | NOD2与Rick的相互作用增强了NF-kappab活动 | 绑定 | 11087742 |
PHB2 | bap |BCAP37 |BAP37 |MGC117268 |PNAS-141 |Rea |p22 | 禁止素2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPL38 | - | 核糖体蛋白L38 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
RPS14 | EMTB | 核糖体蛋白S14 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
tnfrsf1a | CD120A |FPF |MGC19588 |TBP1 |TNF-R |tnf-r-i |TNF-R55 |tnfar |TNFR1 |TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 | 肿瘤坏死因子受体超家族,成员1a | - | HPRD,Biogrid | 9642260 |
traf1 | EBI6 |MGC:10353 | TNF受体相关因子1 | - | HPRD,Biogrid | 9705938 |
traf2 | MGC:45012 |陷阱|陷阱3 | TNF受体相关因子2 | - | HPRD,Biogrid | 9705938 |
traf5 | MGC:39780 |RNF84 | TNF受体相关因子5 | - | HPRD,Biogrid | 9642260 |
traf6 | MGC:3310 |RNF85 | TNF受体相关因子6 | - | HPRD,Biogrid | 9642260 |
tuba3c | tuba2 |BA408E5.3 | 微管蛋白,α3C | - | HPRD | 14743216 |
tubb2b | DKFZP566F223 |FLJ98847 |MGC8685 |tubb-paralog |BA506K6.1 | 微管蛋白,β2B | - | HPRD | 14743216 |
ube2i | C358B7.1 |P18 |UBC9 | 泛素结合酶E2I(UBC9同源物,酵母) | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg点头喜欢受体信号通路 | 62 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 | 126 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta FAS途径 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID NFKAPPAB规范途径 | 23 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL12 2 Pathway | 63 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P75 NTR途径 | 69 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 | 74 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome TCR信号传导 | 54 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome下游TCR信号传导 | 37 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P75NTR招募信号复合物 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P75NTR信号通过NFKB | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 | 81 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Tak1通过磷酸化和激活IKKS复合物激活NFKB | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TLR级联反应组MAP激酶激活 | 50 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome JNK C Jun激酶磷酸化和激活人Tak1介导的激活 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TAK1介导P38 MAPK激活 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ILS的Reactome信号传导 | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome IL1信号传导 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TLR4信号传导 | 93 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome收费受体级联 | 118 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Nod1 2信号通路 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组核苷酸结合结构域富含受体NLR信号通路富含亮氨酸重复途径 | 46 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村癌症微环境DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹fungoides cd4 up | 64 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON | 132 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sana tnf发出信号 | 83 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEKI炎症反应LPS | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转换签名 | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |