概括
基因 8767
象征 RIPK2
同义词 card3 | cardiak | cck | gig30 | rick | rip2
描述 受体相互作用丝氨酸/苏氨酸激酶2
参考 MIM:603455|HGNC:HGNC:10020|ENSEMBL:ENSG00000104312|HPRD:04585|Vega:Otthumg00000163809
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q21
Pascal P值 0.958
胎儿β -1.167
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0259

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18123581 8 90772386 RIPK2 5.032E-4 -0.688 0.047 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KDM2A 0.93 0.94
BICD2 0.93 0.95
PRDM15 0.91 0.93
Rapgef1 0.91 0.92
TGFBRAP1 0.91 0.92
TSC1 0.91 0.93
sipa1l3 0.91 0.93
NCOR1 0.91 0.92
ZNF236 0.90 0.93
HERC2 0.90 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.72 -0.76
higd1b -0.70 -0.76
MT-CO2 -0.69 -0.75
C1orf54 -0.69 -0.83
AF347015.21 -0.68 -0.80
FXYD1 -0.68 -0.70
ifi27 -0.66 -0.68
AF347015.27 -0.66 -0.70
AF347015.33 -0.65 -0.67
mt-cyb -0.65 -0.69

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0004871 信号传感器活性 塔斯 9642260
去:0030274 LIM域结合 IPI 15657077
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 经验 17468049
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 塔斯 9642260
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0016301 激酶活性 IEA -
GO:0050700 卡域绑定 IPI 11087742
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去:0007165 信号转导 塔斯 9642260
去:0006954 炎症反应 塔斯 9705938
去:0043065 凋亡的阳性调节 IEA -
去:0042098 T细胞增殖 IEA -
去:0051092 NF-kappab转录因子活性的正调控 IEA -
GO:0043123 I-kappab激酶/NF-kappab级联的积极调节 IEP 12761501
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 17468049
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
BIRC2 API1 |hiap2 |hiap-2 |mihb |RNF48 |CIAP1 细菌病毒IAP重复含2 - HPRD,Biogrid 9642260
BIRC3 AIP1 |API2 |CIAP2 |haip1 |hiap1 |MALT2 |mihc |RNF49 细菌病毒IAP重复含量3 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 9705938
卡16 警察|COP1 |伪冰 caspase招聘域家庭,成员16 - HPRD 11432859|11536016
卡16 警察|COP1 |伪冰 caspase招聘域家庭,成员16 - HPRD 11432859
卡6 Cincin1 caspase招聘域家庭,成员6 - HPRD,Biogrid 12775719
CASP1 冰|IL1BC |P45 caspase 1,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶(白介素1,β,转化酶) - HPRD,Biogrid 9705938
CASP8 ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD 9575181
CD40 BP50 |CDW40 |MGC9013 |tnfrsf5 |P50 CD40分子,TNF受体超家族成员5 - HPRD,Biogrid 9642260
Cflar 现金|casp8ap1 |克拉普|卡斯珀|火焰|火焰1 |火焰1 |翻转|i-flice |MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS CASP8和FADD样细胞凋亡调节剂 - HPRD,Biogrid 9575181
警察 克尔托 网格蛋白排序的蛋白质 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11432859
HSPA8 HSC54 |HSC70 |HSC71 |HSP71 |HSP73 |HSPA10 |lap1 |MGC131511 |MGC29929 |NIP71 热休克70KDA蛋白8 - HPRD 14743216
ikbkg AMCBX1 |FIP-3 |fip3 |fip3p |ikk-gamma |IP |IP1 |IP2 |IPD2 |Nemo B细胞,激酶γ中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 - HPRD,Biogrid 10880512
KCTD12 C13orf2 |FLJ33073 |KIAA1778 |pfet1 |pfetin 含12个钾通道四聚化结构域 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
NOD1 card4 |Clr7.1 |NLRC1 包含1个的核苷酸结合寡聚结构域 NOD1与Rick活性相互作用并增强。 绑定 10329646
NOD1 card4 |Clr7.1 |NLRC1 包含1个的核苷酸结合寡聚结构域 - HPRD,Biogrid 10329646
nod2 Acug |Blau |card15 |CD |Clr16.3 |IBD1 |NLRC2 |nod2b |psoras1 包含2的核苷酸结合寡聚结构域 - HPRD,Biogrid 11087742
nod2 Acug |Blau |card15 |CD |Clr16.3 |IBD1 |NLRC2 |nod2b |psoras1 包含2的核苷酸结合寡聚结构域 NOD2与Rick的相互作用增强了NF-kappab活动 绑定 11087742
PHB2 bap |BCAP37 |BAP37 |MGC117268 |PNAS-141 |Rea |p22 禁止素2 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPL38 - 核糖体蛋白L38 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
RPS14 EMTB 核糖体蛋白S14 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
tnfrsf1a CD120A |FPF |MGC19588 |TBP1 |TNF-R |tnf-r-i |TNF-R55 |tnfar |TNFR1 |TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 肿瘤坏死因子受体超家族,成员1a - HPRD,Biogrid 9642260
traf1 EBI6 |MGC:10353 TNF受体相关因子1 - HPRD,Biogrid 9705938
traf2 MGC:45012 |陷阱|陷阱3 TNF受体相关因子2 - HPRD,Biogrid 9705938
traf5 MGC:39780 |RNF84 TNF受体相关因子5 - HPRD,Biogrid 9642260
traf6 MGC:3310 |RNF85 TNF受体相关因子6 - HPRD,Biogrid 9642260
tuba3c tuba2 |BA408E5.3 微管蛋白,α3C - HPRD 14743216
tubb2b DKFZP566F223 |FLJ98847 |MGC8685 |tubb-paralog |BA506K6.1 微管蛋白,β2B - HPRD 14743216
ube2i C358B7.1 |P18 |UBC9 泛素结合酶E2I(UBC9同源物,酵母) 两个杂交 Biogrid 16189514


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg点头喜欢受体信号通路 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta FAS途径 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NFKAPPAB规范途径 23 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL12 2 Pathway 63 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR途径 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 74 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TCR信号传导 54 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome下游TCR信号传导 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P75NTR招募信号复合物 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P75NTR信号通过NFKB 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 81 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Tak1通过磷酸化和激活IKKS复合物激活NFKB 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TLR级联反应组MAP激酶激活 50 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome JNK C Jun激酶磷酸化和激活人Tak1介导的激活 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TA​​K1介导P38 MAPK激活 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ILS的Reactome信号传导 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL1信号传导 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TLR4信号传导 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome收费受体级联 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Nod1 2信号通路 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组核苷酸结合结构域富含受体NLR信号通路富含亮氨酸重复途径 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村癌症微环境DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides cd4 up 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON 132 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sana tnf发出信号 83 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI炎症反应LPS 77 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转换签名 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因