概括
基因 8772
象征 fadd
同义词 Gig3 | Mort1
描述 通过死亡域关联的FA
参考 MIM:602457|HGNC:HGNC:3573|ENSEMBL:ENSG00000168040|HPRD:03909|Vega:Otthumg00000167264
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q13.3
Pascal P值 0.342
胎儿β 0.445
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG20821095 11 70049116 fadd 1.5e-11 -0.016 2.86E-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 来源 PubMed ID
ABCA1 ABC-1 |ABC1 |CERP |FLJ14958 |HDLDT1 |MGC164864 |MGC165011 |TGD ATP结合盒,亚家族A(ABC1),成员1 - HPRD,Biogrid 12235128
Arhgdia GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha 共纯化 Biogrid 15659383
出价 FP497 |MGC15319 |MGC42355 BH3互动域死亡激动剂 共纯化 Biogrid 15659383
CASP10 Alps2 |flice2 |MCH4 caspase 10,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD 9045686|11717445 | 11717445
CASP10 Alps2 |flice2 |MCH4 caspase 10,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD,Biogrid 11717445
CASP8 ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 CASP8(caspase-8)与FADD相互作用。 绑定 15782135
CASP8 ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD,Biogrid 12107169
CASP8 ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD 11717445|12107169 | 12107169
CASP8 ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 caspase-8与FADD相互作用。 绑定 12220669
CASP8AP2 CED-4 |闪光灯|FLJ11208 |KIAA1315 |RIP25 caspase 8相关蛋白2 - HPRD,Biogrid 10235259
Cflar 现金|casp8ap1 |克拉普|卡斯珀|火焰|火焰1 |火焰1 |翻转|i-flice |MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS CASP8和FADD样细胞凋亡调节剂 MRIT-BETA-1与FADD相互作用。这种相互作用是根据未指定物种的人类MRIT-BETA-1和FADD之间的相互作用进行建模的。 绑定 9326610
Cflar 现金|casp8ap1 |克拉普|卡斯珀|火焰|火焰1 |火焰1 |翻转|i-flice |MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS CASP8和FADD样细胞凋亡调节剂 - HPRD 9208847|11965497
Cflar 现金|casp8ap1 |克拉普|卡斯珀|火焰|火焰1 |火焰1 |翻转|i-flice |MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS CASP8和FADD样细胞凋亡调节剂 C翼与FADD相互作用。 绑定 12220669
Cflar 现金|casp8ap1 |克拉普|卡斯珀|火焰|火焰1 |火焰1 |翻转|i-flice |MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS CASP8和FADD样细胞凋亡调节剂 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 9208847|9228018
|9326610
DAP3 DAP-3 |DKFZP686G12159 |MGC126058 |MGC126059 |MRP-S29 |MRPS29 |BMRP-10 死亡相关蛋白3 - HPRD,Biogrid 11376335|11753396
DAPK1 DAPK |DKFZP781I035 死亡相关蛋白激酶1 - HPRD,Biogrid 12911633
dedd casp8ip1 |dedd1 |faft |flded1 |ke05 死亡效应域含有 - HPRD,Biogrid 9774341
EZR cvil |CVL |DKFZP762H157 |FLJ26216 |MGC1584 |vil2 埃兹林 共纯化 Biogrid 15659383
fas Alps1a |apo-1 |apt1 |CD95 |fas1 |FastM |TNFRSF6 FAS(TNF受体超家族,成员6) FAS与FADD相互作用。 绑定 15383280
fas Alps1a |apo-1 |apt1 |CD95 |fas1 |FastM |TNFRSF6 FAS(TNF受体超家族,成员6) FAS的未指定同工型与FADD相互作用。 绑定 15665818
fas Alps1a |apo-1 |apt1 |CD95 |fas1 |FastM |TNFRSF6 FAS(TNF受体超家族,成员6) - HPRD,Biogrid 7538907|8967952
fas Alps1a |apo-1 |apt1 |CD95 |fas1 |FastM |TNFRSF6 FAS(TNF受体超家族,成员6) - HPRD 7536190|7538907
|8967952 | 7538907|8967952
faslg APT1LG1 |CD178 |CD95L |fasl |TNFSF6 FAS配体(TNF超家族,成员6) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
共纯化
Biogrid 12887920|15659383
hipk3 dyrk6 |Fist3 |pky |Yak1 同源域相互作用蛋白激酶3 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11034606
irak1 irak |佩尔 白介素-1受体相关激酶1 - HPRD,Biogrid 11828002
lrdd DKFZP434D229 |MGC16925 |pidd 亮氨酸丰富的重复和含有死亡域 - HPRD,Biogrid 10825539
MAPK8 jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 共纯化 Biogrid 15659383
MBD4 Med1 甲基-CPG结合结构域蛋白4 - HPRD,Biogrid 12702765
mobkl3 2c4d |CGI-95 |MGC12264 |mob1 |mob3 |prei3 MOB1,MPS一个粘合激酶激活剂样3(酵母) 两个杂交 Biogrid 16169070
MSN - Moesin 共纯化 Biogrid 15659383
myd88 myd88d 髓样分化主要反应基因(88) - HPRD,Biogrid 11828002
NACA HSD48 |MGC117224 |NACA1 新生多肽相关的复合α亚基 - HPRD,Biogrid 12684039
NOL3 弧|卡2 |MYC |myp |nop |NOP30 核仁蛋白3(带卡结构域的凋亡抑制剂) ARC与FADD相互作用。 绑定 15383280
NOL3 弧|卡2 |MYC |myp |nop |NOP30 核仁蛋白3(带卡结构域的凋亡抑制剂) 表型抑制 Biogrid 9560245
PEA15 HMAT1 |hummat1h |Mat1 |Mat1h |豌豆15 |ped 富含星形胶质细胞的磷蛋白15 - HPRD,Biogrid 10442631|10493725
Prkcz PKC-Zeta |PKC2 蛋白激酶C,Zeta - HPRD,Biogrid 11739185
Rhoa ARH12 |arha |Rho12 |RHOH12 RAS同源基因家族,成员 共纯化 Biogrid 15659383
RIPK1 FLJ39204 |RIP |RIP1 受体(TNFRSF) - 互动丝氨酸 - 硫代激酶1 两个杂交 Biogrid 11854271
RIPK1 FLJ39204 |RIP |RIP1 受体(TNFRSF) - 互动丝氨酸 - 硫代激酶1 - HPRD 11002422
RYBP AAP1 |dedaf |是的 RING1和YY1结合蛋白 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11395500
SUMO1 DAP-1 |GMP1 |OFC10 |pic1 |senp2 |SMT3 |SMT3C |SMT3H3 |Sumo-1 |UBL1 MIF的SMT3抑制器两个3同源物1(S. cerevisiae) 两个杂交 Biogrid 8906799
TNFRSF10A apo2 |CD261 |DR4 |MGC9365 |TRAILR-1 |TRAILR1 肿瘤坏死因子受体超家族,成员10a - HPRD,Biogrid 9430227|11376335
TNFRSF10B CD262 |DR5 |杀手|杀手/DR5 |trail-r2 |TRAILR2 |技巧2 |Trick2a |trick2b |技巧| ZTNFR9 肿瘤坏死因子受体超家族,成员10b - HPRD,Biogrid 9430227
tnfrsf1a CD120A |FPF |MGC19588 |TBP1 |TNF-R |tnf-r-i |TNF-R55 |tnfar |TNFR1 |TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 肿瘤坏死因子受体超家族,成员1a 亲和力捕获 - 韦斯特恩
共纯化
Biogrid 8565075|15659383
传统 HS.89862 |MGC11078 通过死亡域与TNFRSF1A相关 TRADD与FADD互动。这种相互作用是根据未指定的物种进行的,均以展示的tradd和fadd之间的相互作用进行建模 绑定 12796506
传统 HS.89862 |MGC11078 通过死亡域与TNFRSF1A相关 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 8565075|12911633
传统 HS.89862 |MGC11078 通过死亡域与TNFRSF1A相关 Fadd与Tradd互动。 绑定 11112409
传统 HS.89862 |MGC11078 通过死亡域与TNFRSF1A相关 TRADD与FADD互动。 绑定 15761471
传统 HS.89862 |MGC11078 通过死亡域与TNFRSF1A相关 - HPRD 8565075|10911999
XPO5 FLJ14239 |FLJ32057 |FLJ45606 |KIAA1291 导出5 - HPRD 12702765


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg凋亡 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Toll像受体信号通路 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg钻机我喜欢受体信号通路 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Rela途径 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta神经酰胺途径 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta FAS途径 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Hivnef途径 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔尔死亡道路 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NFKB途径 23 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta SODD途径 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TNFR1途径 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST肿瘤坏死因子途径 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St FAS信号通路 65 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID步道路径 28 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAS路径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TNF途径 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID神经酰胺途径 48 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIV NEF途径 35 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
凋亡的反应组外途径 13 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NFKB通过FADD RIP1途径激活由caspase 8和10介导 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome钻机I MDA5介导的IFNαβ途径的诱导 73 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡 148 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lau凋亡CDKN2A UP 55 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德里乳腺癌预后 50 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mattioli Mgus vs PCL 116 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在喉癌中放大了耶维宁 40 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon 158 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼细胞淋巴瘤DN 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对UV SCC DN的响应 123 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH对砷C2的反应 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D5 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林黑色素瘤复制号码 73 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 182 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因