基因页:fadd
概括?
基因 | 8772 |
象征 | fadd |
同义词 | Gig3 | Mort1 |
描述 | 通过死亡域关联的FA |
参考 | MIM:602457|HGNC:HGNC:3573|ENSEMBL:ENSG00000168040|HPRD:03909|Vega:Otthumg00000167264 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q13.3 |
Pascal P值 | 0.342 |
胎儿β | 0.445 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG20821095 | 11 | 70049116 | fadd | 1.5e-11 | -0.016 | 2.86E-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FADD_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 来源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABCA1 | ABC-1 |ABC1 |CERP |FLJ14958 |HDLDT1 |MGC164864 |MGC165011 |TGD | ATP结合盒,亚家族A(ABC1),成员1 | - | HPRD,Biogrid | 12235128 |
Arhgdia | GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 | RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
出价 | FP497 |MGC15319 |MGC42355 | BH3互动域死亡激动剂 | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
CASP10 | Alps2 |flice2 |MCH4 | caspase 10,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD | 9045686|11717445 | 11717445 |
CASP10 | Alps2 |flice2 |MCH4 | caspase 10,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD,Biogrid | 11717445 |
CASP8 | ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 | caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | CASP8(caspase-8)与FADD相互作用。 | 绑定 | 15782135 |
CASP8 | ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 | caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD,Biogrid | 12107169 |
CASP8 | ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 | caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD | 11717445|12107169 | 12107169 |
CASP8 | ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 | caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | caspase-8与FADD相互作用。 | 绑定 | 12220669 |
CASP8AP2 | CED-4 |闪光灯|FLJ11208 |KIAA1315 |RIP25 | caspase 8相关蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 10235259 |
Cflar | 现金|casp8ap1 |克拉普|卡斯珀|火焰|火焰1 |火焰1 |翻转|i-flice |MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS | CASP8和FADD样细胞凋亡调节剂 | MRIT-BETA-1与FADD相互作用。这种相互作用是根据未指定物种的人类MRIT-BETA-1和FADD之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 9326610 |
Cflar | 现金|casp8ap1 |克拉普|卡斯珀|火焰|火焰1 |火焰1 |翻转|i-flice |MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS | CASP8和FADD样细胞凋亡调节剂 | - | HPRD | 9208847|11965497 |
Cflar | 现金|casp8ap1 |克拉普|卡斯珀|火焰|火焰1 |火焰1 |翻转|i-flice |MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS | CASP8和FADD样细胞凋亡调节剂 | C翼与FADD相互作用。 | 绑定 | 12220669 |
Cflar | 现金|casp8ap1 |克拉普|卡斯珀|火焰|火焰1 |火焰1 |翻转|i-flice |MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS | CASP8和FADD样细胞凋亡调节剂 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9208847|9228018 |9326610 |
DAP3 | DAP-3 |DKFZP686G12159 |MGC126058 |MGC126059 |MRP-S29 |MRPS29 |BMRP-10 | 死亡相关蛋白3 | - | HPRD,Biogrid | 11376335|11753396 |
DAPK1 | DAPK |DKFZP781I035 | 死亡相关蛋白激酶1 | - | HPRD,Biogrid | 12911633 |
dedd | casp8ip1 |dedd1 |faft |flded1 |ke05 | 死亡效应域含有 | - | HPRD,Biogrid | 9774341 |
EZR | cvil |CVL |DKFZP762H157 |FLJ26216 |MGC1584 |vil2 | 埃兹林 | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
fas | Alps1a |apo-1 |apt1 |CD95 |fas1 |FastM |TNFRSF6 | FAS(TNF受体超家族,成员6) | FAS与FADD相互作用。 | 绑定 | 15383280 |
fas | Alps1a |apo-1 |apt1 |CD95 |fas1 |FastM |TNFRSF6 | FAS(TNF受体超家族,成员6) | FAS的未指定同工型与FADD相互作用。 | 绑定 | 15665818 |
fas | Alps1a |apo-1 |apt1 |CD95 |fas1 |FastM |TNFRSF6 | FAS(TNF受体超家族,成员6) | - | HPRD,Biogrid | 7538907|8967952 |
fas | Alps1a |apo-1 |apt1 |CD95 |fas1 |FastM |TNFRSF6 | FAS(TNF受体超家族,成员6) | - | HPRD | 7536190|7538907 |8967952 | 7538907|8967952 |
faslg | APT1LG1 |CD178 |CD95L |fasl |TNFSF6 | FAS配体(TNF超家族,成员6) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 |
Biogrid | 12887920|15659383 |
hipk3 | dyrk6 |Fist3 |pky |Yak1 | 同源域相互作用蛋白激酶3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11034606 |
irak1 | irak |佩尔 | 白介素-1受体相关激酶1 | - | HPRD,Biogrid | 11828002 |
lrdd | DKFZP434D229 |MGC16925 |pidd | 亮氨酸丰富的重复和含有死亡域 | - | HPRD,Biogrid | 10825539 |
MAPK8 | jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
MBD4 | Med1 | 甲基-CPG结合结构域蛋白4 | - | HPRD,Biogrid | 12702765 |
mobkl3 | 2c4d |CGI-95 |MGC12264 |mob1 |mob3 |prei3 | MOB1,MPS一个粘合激酶激活剂样3(酵母) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
MSN | - | Moesin | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
myd88 | myd88d | 髓样分化主要反应基因(88) | - | HPRD,Biogrid | 11828002 |
NACA | HSD48 |MGC117224 |NACA1 | 新生多肽相关的复合α亚基 | - | HPRD,Biogrid | 12684039 |
NOL3 | 弧|卡2 |MYC |myp |nop |NOP30 | 核仁蛋白3(带卡结构域的凋亡抑制剂) | ARC与FADD相互作用。 | 绑定 | 15383280 |
NOL3 | 弧|卡2 |MYC |myp |nop |NOP30 | 核仁蛋白3(带卡结构域的凋亡抑制剂) | 表型抑制 | Biogrid | 9560245 |
PEA15 | HMAT1 |hummat1h |Mat1 |Mat1h |豌豆15 |ped | 富含星形胶质细胞的磷蛋白15 | - | HPRD,Biogrid | 10442631|10493725 |
Prkcz | PKC-Zeta |PKC2 | 蛋白激酶C,Zeta | - | HPRD,Biogrid | 11739185 |
Rhoa | ARH12 |arha |Rho12 |RHOH12 | RAS同源基因家族,成员 | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
RIPK1 | FLJ39204 |RIP |RIP1 | 受体(TNFRSF) - 互动丝氨酸 - 硫代激酶1 | 两个杂交 | Biogrid | 11854271 |
RIPK1 | FLJ39204 |RIP |RIP1 | 受体(TNFRSF) - 互动丝氨酸 - 硫代激酶1 | - | HPRD | 11002422 |
RYBP | AAP1 |dedaf |是的 | RING1和YY1结合蛋白 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11395500 |
SUMO1 | DAP-1 |GMP1 |OFC10 |pic1 |senp2 |SMT3 |SMT3C |SMT3H3 |Sumo-1 |UBL1 | MIF的SMT3抑制器两个3同源物1(S. cerevisiae) | 两个杂交 | Biogrid | 8906799 |
TNFRSF10A | apo2 |CD261 |DR4 |MGC9365 |TRAILR-1 |TRAILR1 | 肿瘤坏死因子受体超家族,成员10a | - | HPRD,Biogrid | 9430227|11376335 |
TNFRSF10B | CD262 |DR5 |杀手|杀手/DR5 |trail-r2 |TRAILR2 |技巧2 |Trick2a |trick2b |技巧| ZTNFR9 | 肿瘤坏死因子受体超家族,成员10b | - | HPRD,Biogrid | 9430227 |
tnfrsf1a | CD120A |FPF |MGC19588 |TBP1 |TNF-R |tnf-r-i |TNF-R55 |tnfar |TNFR1 |TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 | 肿瘤坏死因子受体超家族,成员1a | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 |
Biogrid | 8565075|15659383 |
传统 | HS.89862 |MGC11078 | 通过死亡域与TNFRSF1A相关 | TRADD与FADD互动。这种相互作用是根据未指定的物种进行的,均以展示的tradd和fadd之间的相互作用进行建模 | 绑定 | 12796506 |
传统 | HS.89862 |MGC11078 | 通过死亡域与TNFRSF1A相关 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 8565075|12911633 |
传统 | HS.89862 |MGC11078 | 通过死亡域与TNFRSF1A相关 | Fadd与Tradd互动。 | 绑定 | 11112409 |
传统 | HS.89862 |MGC11078 | 通过死亡域与TNFRSF1A相关 | TRADD与FADD互动。 | 绑定 | 15761471 |
传统 | HS.89862 |MGC11078 | 通过死亡域与TNFRSF1A相关 | - | HPRD | 8565075|10911999 |
XPO5 | FLJ14239 |FLJ32057 |FLJ45606 |KIAA1291 | 导出5 | - | HPRD | 12702765 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg凋亡 | 88 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Toll像受体信号通路 | 102 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg钻机我喜欢受体信号通路 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Rela途径 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta神经酰胺途径 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta FAS途径 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Hivnef途径 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔尔死亡道路 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NFKB途径 | 23 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta SODD途径 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta TNFR1途径 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST肿瘤坏死因子途径 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St FAS信号通路 | 65 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID步道路径 | 28 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FAS路径 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TNF途径 | 46 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID神经酰胺途径 | 48 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HIV NEF途径 | 35 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
凋亡的反应组外途径 | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NFKB通过FADD RIP1途径激活由caspase 8和10介导 | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome钻机I MDA5介导的IFNαβ途径的诱导 | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组凋亡 | 148 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lau凋亡CDKN2A UP | 55 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纳德里乳腺癌预后 | 50 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mattioli Mgus vs PCL | 116 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在喉癌中放大了耶维宁 | 40 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon | 158 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼细胞淋巴瘤DN | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC DN的响应 | 123 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YIH对砷C2的反应 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线响应集群D5 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林黑色素瘤复制号码 | 73 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G2 | 182 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |