基因页：snap23
概括？
| 基因 | 8773 |
| 象征 | snap23 |
| 同义词 | HST17016 | snap-23 | snap23a | snap23b |
| 描述 | 突触体相关蛋白23KDA |
| 参考 | MIM：602534|HGNC：HGNC：11131|Ensembl：ENSG0000000092531|HPRD：03962|Vega：Otthumg00000130625 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q14 |
| Pascal P值 | 0.001 |
| Sherlock P值 | 0.345 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 胞吞作用 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0308 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16894557 | CHR6 | 28999825 | snap23 | 8773 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| add3 | 0.92 | 0.91 |
| PMP2 | 0.90 | 0.90 |
| cybrd1 | 0.89 | 0.87 |
| gramd3 | 0.88 | 0.83 |
| aldh6a1 | 0.88 | 0.88 |
| SLC9A9 | 0.87 | 0.86 |
| Ahcyl1 | 0.87 | 0.87 |
| SSFA2 | 0.87 | 0.89 |
| SLC4A4 | 0.86 | 0.91 |
| SSPN | 0.86 | 0.88 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NR2C2AP | -0.52 | -0.55 |
| AC011491.1 | -0.51 | -0.57 |
| Med19 | -0.49 | -0.53 |
| ZNF821 | -0.49 | -0.44 |
| mpp3 | -0.49 | -0.41 |
| 塔布 | -0.49 | -0.41 |
| BZW2 | -0.49 | -0.46 |
| Gmip | -0.49 | -0.39 |
| IGFBP2 | -0.49 | -0.52 |
| mycn | -0.48 | -0.37 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16189514 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006944 | 膜融合 | 塔斯 | 10839363 | |
| 去：0006903 | 囊泡靶向 | 塔斯 | 8663154 | |
| 去：0006892 | 高尔基囊泡介导的转运 | 塔斯 | 9727496 | |
| 去：0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0019717 | 突触体 | IEA | 突触，大脑（GO期限：7） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005792 | 微型体 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005886 | 质膜 | 塔斯 | 9727496 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ABI2 | Abi-2 |ABI2B |AIP-1 |ablbp3 |SSH3BP2 |argbpia |argbpib | ABL Interactor 2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| ABI3 | nesh |SSH3BP3 | 阿比家族，成员3 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| CFTR | ABC35 |ABCC7 |CF |CFTR/MRP |MRP7 |TNR-CFTR |DJ760C5.1 | 囊性纤维化跨膜电导调节剂（ATP结合盒子亚家族C，成员7） | - | HPRD，Biogrid | 12209004 |
| FXR2 | FMR1L2 | 脆弱的X心理迟缓，常染色体同源物2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| ITSN1 | 它的|MGC134948 |MGC134949 |SH3D1A |SH3P17 | 相交1（SH3结构蛋白） | - | HPRD，Biogrid | 10373452 |
| kif5b | Kinh |KNS |KNS1 |UKHC | 动机家庭成员5B | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12475239 |
| 纳帕 | Snapa | N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白，α | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 16189514 |
| SCAMP1 | Scamp |SCAMP37 | 分泌载体膜蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 12124380 |
| SCAMP2 | - | 分泌载体膜蛋白2 | - | HPRD，Biogrid | 12124380 |
| scgn | calbl |DJ501N12.8 |秘密|segn |setagin | 促毒素，EF手钙结合蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| Snapin | 快照 | 快速相关的蛋白质 | SNAP23与Snapin相互作用。 | 绑定 | 15635093 |
| Snapin | 快照 | 快速相关的蛋白质 | - | HPRD，Biogrid | 12877659 |
| SNTG1 | g1syn |SYN4 | Syntrophin，伽马1 | 重构的复合物 | Biogrid | 12877659 |
| STX11 | FHL4 |HLH4 |HPLH4 | 语法11 | - | HPRD，Biogrid | 10036234 |
| STX12 | MGC51957 |STX13 |STX14 | 语法12 | - | HPRD，Biogrid | 9507000 |
| STX18 | DKFZP686O15149 |UFE1 | 语法18 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15029241 |
| STX1A | HPC-1 |STX1 |P35-1 | 语法1A（大脑） | - | HPRD | 12209004 | 12651853 |
| STX1A | HPC-1 |STX1 |P35-1 | 语法1A（大脑） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 8663154|9168999 |9852078|12651853 |12828989 |
| STX1B | STX1B1 |STX1B2 | 语法1B | 重构的复合物 | Biogrid | 12651853 |
| STX2 | EPIM |EPM |MGC51014 |STX2A |STX2B |STX2C | 语法2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 8663154|9168999 |12651853|12828989 |
| STX3 | STX3A | 语法3 | - | HPRD | 9701566 |
| STX3 | STX3A | 语法3 | - | HPRD，Biogrid | 12828989 |
| STX4 | STX4A |P35-2 | 语法4 | - | HPRD，Biogrid | 9168999 |
| STX5 | sed5 |STX5A | 语法5 | 重构的复合物 | Biogrid | 12651853 |
| STX6 | - | 语法6 | - | HPRD，Biogrid | 11001914 |
| STXBP2 | Hunc18b |munc18-2 |UNC18-2 |UNC18B |PP10122 | 语法素结合蛋白2 | - | HPRD | 12773094 |
| STXBP3 | munc18-3 |munc18c |PSP |UNC-18C | 语法素结合蛋白3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12773094 |
| STXBP5 | FLJ30922 |lgl3 |llgl3 |MGC141942 |MGC141968 |NBLA04300 | 语法素结合蛋白5（tomosyn） | - | HPRD，Biogrid | 12832401 |
| SYN2 | Synii |Syriia |Syniib | 突触II | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10820264 |
| TLK1 | KIAA0137 |pku-beta | 塔式类似激酶1 | - | HPRD | 10588641 |
| VAMP1 | DKFZP686H12131 |SYB1 |VAMP-1 | 囊泡相关的膜蛋白1（突触纤维1） | - | HPRD | 8663154 |
| VAMP2 | FLJ11460 |SYB2 |VAMP-2 | 囊泡相关的膜蛋白2（突触纤维2） | SNAP23与VAMP2相互作用。 | 绑定 | 15610015 |
| VAMP2 | FLJ11460 |SYB2 |VAMP-2 | 囊泡相关的膜蛋白2（突触纤维2） | - | HPRD，Biogrid | 10713150 |
| VAMP3 | CEB | 囊泡相关的膜蛋白3（Cellubrevin） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10820264|12828989 |
| VAMP3 | CEB | 囊泡相关的膜蛋白3（Cellubrevin） | - | HPRD | 12130530 |
| VAMP3 | CEB | 囊泡相关的膜蛋白3（Cellubrevin） | SNAP23与VAMP3相互作用。 | 绑定 | 15610015 |
| VAMP7 | Sybl1 |ti-vamp |VAMP-7 | 囊泡相关的膜蛋白7 | SNAP23与VAMP7相互作用。 | 绑定 | 15610015 |
| VAMP7 | Sybl1 |ti-vamp |VAMP-7 | 囊泡相关的膜蛋白7 | - | HPRD，Biogrid | 9614185 |
| VAMP8 | EDB | 囊泡相关的膜蛋白8（内折） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10820264|12828989 |
| VAMP8 | EDB | 囊泡相关的膜蛋白8（内折） | - | HPRD | 10820264|12130530 |12828989 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 囊泡运输中的kegg圈圈相互作用 | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 | 60 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC2靶向 | 114 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向8小时 | 164 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Petretto心脏肥大 | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布鲁诺造血 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JI对FSH DN的响应 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由组蛋白乙酰化调节的玛丽亚达森 | 83 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chung水泡细胞毒性DN | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Croonquist NRAS与基质刺激 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hirsch细胞转换签名 | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| Let-7/98 | 1205 | 1211 | 1a | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
| HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
| HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
| HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
| HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
| HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
| HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
| HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
| HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
| mir-141/200a | 1447 | 1453 | 1a | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
| HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
| mir-182 | 309 | 316 | 1A，M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-186 | 15 | 21 | 1a | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
| mir-330 | 1277 | 1284 | 1A，M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
| mir-9 | 312 | 318 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
| mir-96 | 310 | 316 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |