基因页面:纳帕
总结吗?
GeneID | 8775年 |
象征 | 纳帕 |
同义词 | SNAPA |
描述 | NSF附件蛋白α |
参考 | MIM: 603215|HGNC: HGNC: 7641|运用:ENSG00000105402|HPRD: 04447|织女:OTTHUMG00000183294 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 q13.33 |
帕斯卡假定值 | 0.443 |
胎儿β | -0.963 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 元 |
支持 | CANABINOID 多巴胺 胞外分泌 5 -羟色胺 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_clathrin G2Cdb.human_Synaptosome CompositeSet |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:3 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg14660446 | 19 | 48015621 | 纳帕 | 3.175的军医 | 0.427 | 0.04 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NAPA_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0019905 | 突触融合蛋白绑定 | 国际能源机构 | Synap(术语层面:5) | - - - - - - |
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 16189514 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0007420 | 大脑发育 | 国际能源机构 | 大脑(术语层面:7) | - - - - - - |
去:0030182 | 神经元分化 | 国际能源机构 | 神经元(术语层面:8) | - - - - - - |
去:0006944 | 膜融合 | 助教 | 8455721 | |
去:0006886 | 细胞内蛋白质的运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006891 | intra-Golgi vesicle-mediated运输 | 助教 | 8455721 | |
去:0016192 | vesicle-mediated运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0045176 | 顶端的蛋白质定位 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005794 | 高尔基体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005783 | 内质网 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
GOSR1 | GOLIM2 | GOS-28 | GOS28 | GOS28 / P28 | GS28 | P28 | 高尔基把受体1复杂的成员 | - - - - - - | HPRD | 9325254 |
GOSR2 | Bos1 | GS27 | 高尔基提前2受体复杂的成员 | - - - - - - | HPRD | 9349823 |
NSF | SKD2 | N-ethylmaleimide-sensitive因素 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9362506 |
RTN4 | 容易| NI220/250 |勿动蛋白| NOGO-A | NOGOC NSP | | NSP-CL | Nbla00271 | Nbla10545 | Nogo-B | Nogo-C | RTN-X | RTN4-A | RTN4-B1 | RTN4-B2 | RTN4-C | reticulon 4 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
SNAP23 | HsT17016 | SNAP23A | SNAP23B | synaptosomal-associated蛋白质,23 kda | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 16189514 |
SNAP25 | FLJ23079 | RIC-4 | RIC4 | SEC9 |弹簧| SNAP-25 | bA416N4.2 | dJ1068F16.2 | synaptosomal-associated蛋白质,25 kda | 重新组成复杂 | BioGRID | 7622514 |
STX12 | MGC51957 | STX13 | STX14 | 突触融合蛋白12 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9507000|9817754 |
STX1A | HPC-1 | STX1 | p35-1 | 突触融合蛋白1(大脑) | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 7553862|7622514 |
STX4 | STX4A | p35-2 | 突触融合蛋白4 | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 16189514 |
STX5 | SED5 | STX5A | 突触融合蛋白5 | 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 9506515|16189514 |
STX7 | - - - - - - | 突触融合蛋白7 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9417091 |
STX8 | 碳水化合物 | 突触融合蛋白8 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10683148 |
TRPC3 | TRP3 | 瞬时受体电位阳离子通道,亚C,成员3 | TRPC3与alpha-SNAP交互。 | 绑定 | 15327778 |
TRPC3 | TRP3 | 瞬时受体电位阳离子通道,亚C,成员3 | - - - - - - | HPRD | 15327778 |
VAMP2 | FLJ11460 | SYB2 | VAMP-2 | vesicle-associated膜蛋白2 (synaptobrevin 2) | 重新组成复杂 | BioGRID | 7622514 |
VAMP8 | 教育局 | vesicle-associated膜蛋白8 (endobrevin) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9614193 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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REACTOME膜贩运 | 129年 | 74年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME反式高尔基网络泡萌芽 | 60 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME高尔基体囊泡生物起源有关 | 53 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DEURIG T细胞PROLYMPHOCYTIC白血病 | 368年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
维奇DMOG缺氧的DN | 59 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿斯顿重度抑郁症DN | 160年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MODY海马产后 | 63年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃晚期造血祖 | 544年 | 307年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陆衰老的大脑DN | 153年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李老化小脑DN | 86年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李老化的大脑皮层上 | 89年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AGUIRRE胰腺癌拷贝数 | 298年 | 174年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |