概括
基因 8777
象征 mpdz
同义词 hyc2 | mupp1
描述 多个PDZ结构域Crumbs细胞极性复合物分量
参考 MIM:603785|HGNC:HGNC:7208|ENSEMBL:ENSG00000107186|HPRD:09155|Vega:Otthumg00000021031
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9p23
Pascal P值 0.597
Sherlock P值 0.944
胎儿β -0.242
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:4
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.1065

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06202228 9 13279482 mpdz 9.04e-10 -0.029 1.11E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS235427 CHR8 133815575 mpdz 8777 0.07 反式
RS235428 CHR8 133815725 mpdz 8777 0.1 反式
RS16904746 CHR8 133844507 mpdz 8777 0.11 反式
RS6471100 0 mpdz 8777 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C7 0.82 0.83
serpind1 0.80 0.68
lum 0.79 0.67
ASPN 0.78 0.67
BMP5 0.75 0.48
COL3A1 0.75 0.29
邮政 0.73 0.54
islr 0.71 0.80
TBX18 0.70 0.69
FAP 0.70 0.63
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AL022328.1 -0.23 -0.27
SNHG12 -0.22 -0.41
AC132872.1 -0.20 -0.39
9月2日 -0.20 -0.32
HES4 -0.19 -0.36
C1orf61 -0.19 -0.18
C16orf79 -0.19 -0.20
AC135724.1 -0.19 -0.30
ACP6 -0.19 -0.17
增强 -0.18 -0.08

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 16192269
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0042995 细胞投影 IEA Axon(GO术语级别:4) -
去:0005923 紧密连接 IEA 大脑(GO期限:10) -
GO:0019717 突触体 IEA 突触,大脑(GO期限:7) -
GO:0045211 突触后膜 IEA 突触,神经递质(GO期限:5) -
GO:0045202 突触 IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0016324 顶质膜 IEA -
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg thright连接点 134 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
鲍德温·普拉奇(Baldwin Prkci)瞄准 35 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向 100 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
被胰岛素抵抗DN钝化的sartipy 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射8G后的生存率不佳 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 DN 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖DN 179 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因