基因页:mpdz
概括?
基因 | 8777 |
象征 | mpdz |
同义词 | hyc2 | mupp1 |
描述 | 多个PDZ结构域Crumbs细胞极性复合物分量 |
参考 | MIM:603785|HGNC:HGNC:7208|ENSEMBL:ENSG00000107186|HPRD:09155|Vega:Otthumg00000021031 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9p23 |
Pascal P值 | 0.597 |
Sherlock P值 | 0.944 |
胎儿β | -0.242 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:4 | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.1065 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06202228 | 9 | 13279482 | mpdz | 9.04e-10 | -0.029 | 1.11E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS235427 | CHR8 | 133815575 | mpdz | 8777 | 0.07 | 反式 | ||
RS235428 | CHR8 | 133815725 | mpdz | 8777 | 0.1 | 反式 | ||
RS16904746 | CHR8 | 133844507 | mpdz | 8777 | 0.11 | 反式 | ||
RS6471100 | 0 | mpdz | 8777 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MPDZ_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C7 | 0.82 | 0.83 |
serpind1 | 0.80 | 0.68 |
lum | 0.79 | 0.67 |
ASPN | 0.78 | 0.67 |
BMP5 | 0.75 | 0.48 |
COL3A1 | 0.75 | 0.29 |
邮政 | 0.73 | 0.54 |
islr | 0.71 | 0.80 |
TBX18 | 0.70 | 0.69 |
FAP | 0.70 | 0.63 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AL022328.1 | -0.23 | -0.27 |
SNHG12 | -0.22 | -0.41 |
AC132872.1 | -0.20 | -0.39 |
9月2日 | -0.20 | -0.32 |
HES4 | -0.19 | -0.36 |
C1orf61 | -0.19 | -0.18 |
C16orf79 | -0.19 | -0.20 |
AC135724.1 | -0.19 | -0.30 |
ACP6 | -0.19 | -0.17 |
增强 | -0.18 | -0.08 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16192269 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0044419 | 生物之间的种间相互作用 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0042995 | 细胞投影 | IEA | Axon(GO术语级别:4) | - |
去:0005923 | 紧密连接 | IEA | 大脑(GO期限:10) | - |
GO:0019717 | 突触体 | IEA | 突触,大脑(GO期限:7) | - |
GO:0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触,神经递质(GO期限:5) | - |
GO:0045202 | 突触 | IEA | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | - |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0016324 | 顶质膜 | IEA | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
鲍德温·普拉奇(Baldwin Prkci)瞄准 | 35 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gotzmann上皮到间充质过渡 | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LE EGR2目标DN | 108 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
被胰岛素抵抗DN钝化的sartipy | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G1 DN | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ohguchi肝HNF4A靶向DN | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |