基因页面:RGS11
总结吗?
GeneID | 8786年 |
象征 | RGS11 |
同义词 | RS11 |
描述 | 监管机构的蛋白信号11 |
参考 | MIM: 603895|HGNC: HGNC: 9993|运用:ENSG00000076344|HPRD: 04872|织女:OTTHUMG00000064893 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 p13.3 |
帕斯卡假定值 | 0.219 |
夏洛克假定值 | 0.514 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs2502827 | chr1 | 176044216 | RGS11 | 8786年 | 0.15 | 反式 | ||
rs16829545 | chr2 | 151977407 | RGS11 | 8786年 | 4.972 e - | 反式 | ||
rs3845734 | chr2 | 171125572 | RGS11 | 8786年 | 0 | 反式 | ||
rs7584986 | chr2 | 184111432 | RGS11 | 8786年 | 0.01 | 反式 | ||
rs17762315 | chr5 | 76807576 | RGS11 | 8786年 | 0.06 | 反式 | ||
rs16878286 | chr8 | 31646175 | RGS11 | 8786年 | 0.11 | 反式 | ||
rs16878317 | chr8 | 31657853 | RGS11 | 8786年 | 0.05 | 反式 | ||
rs16955618 | chr15 | 29937543 | RGS11 | 8786年 | 6.57 e-12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RGS11_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TOM1L2 | 0.83 | 0.86 |
SYNM | 0.82 | 0.80 |
FAM120A | 0.82 | 0.84 |
MAP3K5 | 0.81 | 0.82 |
SIRPA | 0.80 | 0.85 |
BCL2L2 | 0.80 | 0.79 |
KIAA1671 | 0.80 | 0.84 |
沥青质 | 0.80 | 0.83 |
UTRN | 0.79 | 0.83 |
SLC6A1 | 0.79 | 0.85 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RPL35 | -0.56 | -0.65 |
RPL27 | -0.56 | -0.64 |
RPL31 | -0.55 | -0.63 |
RPL36 | -0.55 | -0.65 |
RPS18 | -0.55 | -0.63 |
RPL24 | -0.54 | -0.62 |
RPS23 | -0.54 | -0.63 |
RPL18 | -0.54 | -0.64 |
RPS3AP47 | -0.54 | -0.58 |
RPL32 | -0.53 | -0.61 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
我REACTOME Gα信号事件 | 195年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过血清剥夺DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 234年 | 147年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林格伦膀胱癌集群2 b | 392年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王BEXAROTENE反应 | 34 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
16 p13 NIKOLSKY乳腺癌扩增子 | 120年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAVIN FOXP3目标集群P2 | 79年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三乳腺癌基本DN | 701年 | 446年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |