基因页:suclg2
概括?
基因 | 8801 |
象征 | suclg2 |
同义词 | gbeta |
描述 | 琥珀酸酯连接酶,GDP形成,β亚基 |
参考 | MIM:603922|HGNC:HGNC:11450|ENSEMBL:ENSG00000172340|HPRD:06799|Vega:Otthumg00000158740 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P14.1 |
Pascal P值 | 4.912E-4 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1578978 | CHR8 | 118196802 | suclg2 | 8801 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SUCLG2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KDM1 | 0.98 | 0.97 |
不,不 | 0.98 | 0.98 |
XRN2 | 0.97 | 0.97 |
KHDRBS1 | 0.97 | 0.98 |
SF3B3 | 0.97 | 0.96 |
DHX9 | 0.97 | 0.96 |
XPO5 | 0.97 | 0.96 |
EPC1 | 0.96 | 0.97 |
SSRP1 | 0.96 | 0.96 |
vprbp | 0.96 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.75 | -0.83 |
C5orf53 | -0.75 | -0.79 |
AIFM3 | -0.74 | -0.81 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.93 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.92 |
MT-CO2 | -0.73 | -0.93 |
S100B | -0.73 | -0.87 |
FXYD1 | -0.73 | -0.92 |
TSC22D4 | -0.73 | -0.84 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.91 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
柠檬酸盐周期TCA周期 | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg丙酸代谢 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组丙酮酸代谢和柠檬酸TCA循环 | 48 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 | 141 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组柠檬酸循环TCA循环 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
早期的粉刺开发 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM对TSA和Decitabine DN的反应 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钟对偶氮丁丁和TSA DN的反应 | 70 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoebeke淋巴干细胞DN | 86 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高 | 147 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌 | 146 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧癌 | 83 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 | 70 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集15 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
cebpa的valk aml | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 DN | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez多发性骨髓瘤 | 35 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G2 | 182 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanoevelen肌发生SIN3A靶标 | 220 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |