基因页：SAP30
Summary？
| 基因 | 8819 |
| 象征 | SAP30 |
| 同义词 | - |
| Description | SIN3A相关蛋白30KDA |
| Reference | MIM：603378|HGNC：HGNC：10532|ENSEMBL：ENSG00000164105|HPRD：04540|Vega：Otthumg00000160798 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4Q34.1 |
| Pascal P值 | 0.234 |
| Sherlock p-value | 0.649 |
| DEG P值 | DEG：Maycox_2009:CC_BA10_fold_change=1.10:CC_BA10_disease_P=0.0370:HBB_BA9_fold_change=1.21:HBB_BA9_disease_P=0.0274 |
| 胎儿β | 0.742 |
| 主持人 | Myers' cis & trans |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Maycox_2009 | 微阵列来确定超过300的表达00 mRNA transcripts in post-mortem tissue | 我们包括了51个基因，其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1561519 | CHR2 | 35823020 | SAP30 | 8819 | 0.11 | 反式 | ||
| RS7591339 | CHR2 | 35825597 | SAP30 | 8819 | 0.11 | 反式 | ||
| RS7570146 | CHR2 | 35844751 | SAP30 | 8819 | 0.11 | 反式 | ||
| RS1439691 | CHR2 | 35851281 | SAP30 | 8819 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| USP33 | 0.94 | 0.95 |
| arcn1 | 0.93 | 0.93 |
| ATAD1 | 0.93 | 0.91 |
| Shoc2 | 0.93 | 0.93 |
| CAB39 | 0.92 | 0.93 |
| LRPPRC | 0.92 | 0.93 |
| Stau2 | 0.92 | 0.92 |
| SLC30A9 | 0.92 | 0.92 |
| 广告 | 0.91 | 0.91 |
| ARMC8 | 0.91 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.73 | -0.74 |
| AF347015.21 | -0.72 | -0.72 |
| FXYD1 | -0.72 | -0.74 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.73 |
| AF347015.8 | -0.71 | -0.73 |
| HIGD1B | -0.70 | -0.72 |
| EIF4EBP3 | -0.69 | -0.74 |
| ifi27 | -0.69 | -0.72 |
| mt-cyb | -0.69 | -0.70 |
| AF347015.2 | -0.69 | -0.70 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CIR | - | CBF1相互作用的CorePressor | - | HPRD，Biogrid | 9874765 |
| CIR | - | CBF1相互作用的CorePressor | CIR与SAP30相互作用 | 绑定 | 11000236 |
| HBP1 | FLJ16340 | HMG-box transcription factor 1 | - | HPRD | 15235594 |
| HDAC1 | DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰基酶1 | - | HPRD，Biogrid | 9651585 |
| HDAC2 | RPD3 |yaf1 | 组蛋白脱乙酰基酶2 | Affinity Capture-MS 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 |
Biogrid | 9651585|10444591 |11784859 |
| HIST4H4 | H4/P |MGC24116 | 组蛋白簇4，H4 | - | HPRD | 9651585 |
| ING1 | p24ing1c |p33 |p33ing1 |p33ing1b |P47 |P47ing1a | 成长家族抑制剂，成员1 | - | HPRD，Biogrid | 11784859 |
| MTA2 | DKFZp686F2281 | MTA1L1 | PID | 转移相关的1个家庭，成员2 | 共纯化 | Biogrid | 10444591 |
| MXD1 | 疯狂|Mad1 |MGC104659 | 最大二聚化蛋白1 | 重构的复合物 | Biogrid | 11101889 |
| NCOR1 | KIAA1047 |MGC104216 |n-cor |trac1 |HCIT529I10 |hn-cor | 核受体共抑制剂1 | - | HPRD，Biogrid | 9702189 |
| NCOR2 | CTG26 |SMRT |Smrte |smrte-tau |TNRC14 |TRAC-1 |trac1 | 核受体共抑制剂2 | - | HPRD | 9702189 |
| NCOR2 | CTG26 |SMRT |Smrte |smrte-tau |TNRC14 |TRAC-1 |trac1 | 核受体共抑制剂2 | 共纯化 | Biogrid | 11013263 |
| PHF12 | FLJ34122 |KIAA1523 |MGC131914 |PF1 | PhD手指蛋白12 | - | HPRD，Biogrid | 11390640 |
| RBBP4 | NURF55 |RBAP48 | retinoblastoma binding protein 4 | - | HPRD，Biogrid | 9651585 |
| RBBP7 | MGC138867 |MGC138868 |RBAP46 | retinoblastoma binding protein 7 | Affinity Capture-MS 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 重构的复合物 |
Biogrid | 9651585|10444591 |11784859 |
| sin3a | DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 | SIN3同源物A，转录调节剂（酵母） | - | HPRD | 11013263 |
| sin3a | DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 | SIN3同源物A，转录调节剂（酵母） | Affinity Capture-MS 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 重构的复合物 |
Biogrid | 9651585|9702189 |10444591|11390640 |11784859|12724404 |
| SIN3B | KIAA0700 | SIN3同源物B，转录调节剂（酵母） | 共纯化 | Biogrid | 10444591 |
| yy1 | DELTA | INO80S | NF-E1 | UCRBP | YIN-YANG-1 | yy1反式cription factor | - | HPRD，Biogrid | 12788099 |