总结吗?
GeneID 8829年
象征 NRP1
同义词 BDCA4 | CD304 | NP1 | NRP | VEGF165R
描述 neuropilin 1
参考 MIM: 602069|HGNC: HGNC: 8004|运用:ENSG00000099250|HPRD: 03642|织女:OTTHUMG00000019343
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 10 p12
帕斯卡假定值 0.008
胎儿β 1.234
DMG 1(#研究)
支持 Ascano FMRP目标

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 2
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:6

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg26075074 10 33623509 NRP1 1.94 e-9 -0.008 1.62 e-6 DMG: Jaffe_2016
cg20074042 10 33625992 NRP1 9.08 e-9 -0.013 4.12 e-6 DMG: Jaffe_2016


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZCCHC12 0.75 0.73
SLC26A11 0.73 0.77
CPNE2 0.73 0.74
NSUN7 0.73 0.66
GDPD2 0.71 0.62
DCLK2 0.71 0.73
TPST1 0.70 0.71
CCNA1 0.70 0.71
CTNNB1 0.70 0.66
ANUBL1 0.70 0.66
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.46 -0.52
AF347015.21 -0.45 -0.52
AF347015.27 -0.44 -0.50
AF347015.31 -0.44 -0.49
AF347015.8 -0.43 -0.49
AF347015.33 -0.42 -0.46
AF347015.2 -0.42 -0.50
MT-CYB -0.42 -0.46
AF347015.15 -0.40 -0.46
MT-ATP8 -0.39 -0.48

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005021 血管内皮生长因子受体的活动 助教 9288753
去:0004872 受体的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0042802 相同的蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0017154 semaphorin受体活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007413 轴突束状 国际能源机构 神经元,轴突(术语层面:13) - - - - - -
去:0007411 轴突的指导 国际能源机构 轴突(术语层面:13) - - - - - -
去:0007411 轴突的指导 助教 轴突(术语层面:13) 9288753
去:0030517 负调节轴突延伸 国际能源机构 轴突(术语层面:15) - - - - - -
去:0016358 树突发展 国际能源机构 轴突、树突(术语层面:11) - - - - - -
去:0007399 神经系统发育 国际能源机构 神经突(术语层面:5) - - - - - -
去:0001569 模式的血管 国际能源机构 - - - - - -
去:0007155 细胞粘附 国际能源机构 - - - - - -
去:0007267 信息信号 助教 9288753
去:0009887 器官形态发生 助教 9529250
去:0007165 信号转导 助教 9288753
去:0008284 积极的调控细胞增殖 助教 9529250
去:0007507 心发展 国际能源机构 - - - - - -
去:0048010 血管内皮生长因子受体信号通路 国际能源机构 - - - - - -
去:0007275 多细胞有机体的发展 国际能源机构 - - - - - -
去:0030154 细胞分化 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 国际能源机构 - - - - - -
去:0016020 国际能源机构 - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005886 等离子体膜 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
FGF1 AFGF | ECGF | ECGF-beta | ECGFA | ECGFB | FGF-alpha | FGFA | GLIO703 | HBGF1 纤维母细胞生长因子1(酸性) NRP1 (Npn-1)与FGF1交互。这种交互是仿照了老鼠NRP1之间的相互作用和人类FGF1。 绑定 15695515
FGF2 BFGF | FGFB | HBGF-2 纤维母细胞生长因子2(基本) NRP1 (Npn-1)与FGF2交互。这种交互是仿照了老鼠NRP1之间的相互作用和人类FGF2。 绑定 15695515
FGF4 HBGF-4 | HST | HST-1 | HSTF1 | K-FGF | KFGF 纤维母细胞生长因子4 NRP1 (Npn-1)与FGF4交互。这种交互是仿照了老鼠NRP1之间的相互作用和人类FGF4。 绑定 15695515
FGF7 HBGF-7 | KGF 纤维母细胞生长因子7(角质细胞生长因子) NRP1 (Npn-1)与FGF7交互。这种交互是仿照了老鼠NRP1之间的相互作用和人类FGF7。 绑定 15695515
HGF F-TCF | HGFB | HPTA |科幻 肝细胞生长因子(hepapoietin;散射系数) NRP1 (Npn-1)与HGF。这种交互是仿照了老鼠NRP1之间的相互作用和人类胶质瘤。 绑定 15695515
PGF D12S1900 | PGFL | PLGF | PlGF-2 | shgc - 10760 胎盘生长因子 NRP1与PlGF-2交互。这种交互是仿照人类NRP1和鼠标PlGF-2证明之间的交互。 绑定 11986311
PGF D12S1900 | PGFL | PLGF | PlGF-2 | shgc - 10760 胎盘生长因子 - - - - - - HPRD, BioGRID 11986311
PLXNA1 11月| NOVP | PLEXIN-A1 | PLXN1 plexin A1 - - - - - - HPRD 10520994
PLXND1 KIAA0620 | MGC75353 | PLEXD1 plexin D1 PlexinD1与Npn-1交互。这种交互是仿照人类PlexinD1之间的交互和Npn-1从一个未指明的物种。 绑定 15239958
SEMA3A Hsema-I | Hsema-III | MGC133243 | SEMA1 | SEMAD | SEMAIII |红丝| SemD | coll-1 某领域,免疫球蛋白域(Ig),短的基本领域,分泌(semaphorin) 3 - - - - - - HPRD, BioGRID 9331348|10520994
SEMA3A Hsema-I | Hsema-III | MGC133243 | SEMA1 | SEMAD | SEMAIII |红丝| SemD | coll-1 某领域,免疫球蛋白域(Ig),短的基本领域,分泌(semaphorin) 3 Sema3A与Npn-1交互。这种交互是仿照人类Sema3A和老鼠Npn-1证明之间的交互。 绑定 15550623
SEMA3B FLJ34863 | LUCA-1 | SEMA5 | SEMAA | |某semaV 某领域,免疫球蛋白域(Ig),短的基本领域,分泌,(semaphorin) 3 b - - - - - - HPRD 10196546
SEMA3F SEMA-IV | SEMA4 | SEMAK 某领域,免疫球蛋白域(Ig),短的基本领域,分泌(semaphorin) 3 f - - - - - - HPRD 9883722
VEGFA MGC70609 | VEGF | VEGF-A |结合 血管内皮生长因子A 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 9529250|11986311
VEGFA MGC70609 | VEGF | VEGF-A |结合 血管内皮生长因子A NRP1与VEGF165交互。 绑定 11986311
VEGFA MGC70609 | VEGF | VEGF-A |结合 血管内皮生长因子A - - - - - - HPRD 9529250|10409677
|11986311
VEGFA MGC70609 | VEGF | VEGF-A |结合 血管内皮生长因子A VEGF165与neuropilin-1交互。这种交互建模在展示人类VEGF165与neuropilin-1相互作用从一个未指明的物种。 绑定 14600159
VEGFB VEGFL |多联机 血管内皮生长因子B - - - - - - HPRD, BioGRID 10409677


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG轴突引导 129年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
PID VEGF VEGFR通路 10 6 所有SZGR 2.0基因通路
PID VEGFR1通路 26 23 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME发育生物学 396年 292年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME VEGF受体配体相互作用 10 6 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME轴突引导 251年 188年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME CRMPS SEMA3A信号 14 14 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME SEMA3A PAK轴突排斥的依赖 15 14 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME SEMAPHORIN交互 68年 53 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME SEMA3A PLEXIN排斥信号通过抑制整合素粘附 13 9 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME L1CAM交互 86年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME L1信号转导 34 25 所有SZGR 2.0基因通路
SCHUETZ乳腺癌导管侵入性 351年 230年 所有SZGR 2.0基因通路
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 579年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN 455年 304年 所有SZGR 2.0基因通路
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质DN 460年 312年 所有SZGR 2.0基因通路
罗伊伤口血管 50 30. 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯DCC DN的目标 121年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
武田的目标NUP98 HOXA9融合8 d DN 205年 127年 所有SZGR 2.0基因通路
武田的目标NUP98 HOXA9融合10 d DN 142年 90年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1 DN的目标 459年 276年 所有SZGR 2.0基因通路
DN GOZGIT ESR1目标 781年 465年 所有SZGR 2.0基因通路
兰迪斯乳腺癌进展DN 70年 43 所有SZGR 2.0基因通路
转换CDC25 CHIARADONNA肿瘤 120年 73年 所有SZGR 2.0基因通路
CHEBOTAEV GR目标了 77年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
BERENJENO岩石信号不是通过RHOA DN 48 34 所有SZGR 2.0基因通路
兰迪斯ERBB2乳房肿瘤65 DN 37 22 所有SZGR 2.0基因通路
GAUSSMANN MLL AF4融合目标 191年 128年 所有SZGR 2.0基因通路
兰迪斯ERBB2乳房肿瘤324 DN 149年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
王食道癌和正常的DN 101年 66年 所有SZGR 2.0基因通路
胎儿肝脏DN MARTORIATI MDM4目标 514年 319年 所有SZGR 2.0基因通路
NUYTTEN EZH2的目标了 1037年 673年 所有SZGR 2.0基因通路
廖SOX4结合位点 40 26 所有SZGR 2.0基因通路
廖转移 539年 324年 所有SZGR 2.0基因通路
GUENTHER增长球形VS附着DN 26 19 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
不知道背景目标2 256年 159年 所有SZGR 2.0基因通路
罗斯AML CBFB MYH11融合 52 32 所有SZGR 2.0基因通路
JECHLINGER上皮间充质转变DN 66年 47 所有SZGR 2.0基因通路
郭十六进制的目标了 81年 54 所有SZGR 2.0基因通路
阿布得生活信号2 14 13 所有SZGR 2.0基因通路
王MLL CBP融合DN的目标 45 31日 所有SZGR 2.0基因通路
盖瑞CEBP目标 126年 90年 所有SZGR 2.0基因通路
康被叔DN 102年 67年 所有SZGR 2.0基因通路
DN佩特洛娃PROX1目标 64年 38 所有SZGR 2.0基因通路
任肺泡横纹肌肉瘤DN 408年 274年 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃晚期造血祖 544年 307年 所有SZGR 2.0基因通路
胡GENOTOXIN行动直接和间接4人力资源 37 22 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒16小时DN 86年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
具备干细胞RAMALHO DN 74年 55 所有SZGR 2.0基因通路
陈使用支持心脏衰竭的DN 42 32 所有SZGR 2.0基因通路
麦克朗CREB1 DN的目标 57 39 所有SZGR 2.0基因通路
崔TCF21目标2 DN 830年 547年 所有SZGR 2.0基因通路
MODY海马新生儿 35 25 所有SZGR 2.0基因通路
王顺铂的反应和XPC DN 228年 146年 所有SZGR 2.0基因通路
亨德瑞SMARCA4 DN的目标 53 34 所有SZGR 2.0基因通路
曾IRS1 DN的目标 135年 88年 所有SZGR 2.0基因通路
曾脂肪形成的潜在DN 46 28 所有SZGR 2.0基因通路
麦克道尔急性肺损伤DN 48 33 所有SZGR 2.0基因通路
《图片报》MYC致癌签名 206年 117年 所有SZGR 2.0基因通路
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 953年 554年 所有SZGR 2.0基因通路
KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 783年 442年 所有SZGR 2.0基因通路
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 393年 244年 所有SZGR 2.0基因通路
GAVIN FOXP3目标集群T4 94年 69年 所有SZGR 2.0基因通路
GAVIN FOXP3目标集群P4 One hundred. 62年 所有SZGR 2.0基因通路
郑受FOXP3 491年 310年 所有SZGR 2.0基因通路
马森受FOXP3刺激 1022年 619年 所有SZGR 2.0基因通路
郑FOXP3目标了 26 16 所有SZGR 2.0基因通路
近藤EZH2的目标 245年 148年 所有SZGR 2.0基因通路
DE YY1 DN的目标 92年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
里奇尤因肉瘤祖DN 191年 123年 所有SZGR 2.0基因通路
LE滑雪目标了 17 12 所有SZGR 2.0基因通路
拉贝风WNT3A目标了 112年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
拉贝风TGFB1和WNT3A的目标 111年 70年 所有SZGR 2.0基因通路
VART KSHV感染血管生成标记 165年 118年 所有SZGR 2.0基因通路
研究包括 420年 269年 所有SZGR 2.0基因通路
BOYLAN多发性骨髓瘤C D DN 252年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
GOLDRATH抗原反应 346年 192年 所有SZGR 2.0基因通路
ICHIBA移植物抗宿主病D7 DN 40 22 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA CSF2RB和IL4 338年 225年 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA应对HGF 418年 282年 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 408年 276年 所有SZGR 2.0基因通路
汉SATB1目标了 395年 249年 所有SZGR 2.0基因通路
米利伪足趋化性DN 457年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
VALK AML集群9 35 26 所有SZGR 2.0基因通路
COULOUARN颞TGFB1签名 109年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
对环磷酰胺ZEMBUTSU敏感 18 12 所有SZGR 2.0基因通路
VERHAAK胶质母细胞瘤间质 216年 130年 所有SZGR 2.0基因通路
国外RB1增长目标 243年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
国外RB1目标融合性的 567年 365年 所有SZGR 2.0基因通路
BHAT ESR1目标不是通过AKT1 DN 88年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
通过AKT1 DN BHAT ESR1目标 82年 51 所有SZGR 2.0基因通路
MIYAGAWA EWSR1 ETS融合DN的目标 229年 135年 所有SZGR 2.0基因通路
赞美上帝FOXO3 DN的目标 187年 109年 所有SZGR 2.0基因通路
德拉克洛瓦RARG绑定MEF 367年 231年 所有SZGR 2.0基因通路
德拉克洛瓦RAR DN的目标 24 16 所有SZGR 2.0基因通路
DN PEDRIOLI MIR31目标 418年 245年 所有SZGR 2.0基因通路
LIM乳腺干细胞 489年 314年 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG类1引起的暂时性的EGF 516年 308年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-1/206 2537年 2544年 1、m8 hsa-miR-1 UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA
hsa - mir - 206深圳 UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
hsa - mir - 613 AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC
mir - 124.1 2441年 2447年 1 hsa - mir - 124 a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
miR-124/506 748年 754年 m8 hsa - mir - 506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa - mir - 124大脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-130/301 2134年 2140年 m8 hsa - mir - 130 a大脑 CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU
hsa - mir - 301 CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC
hsa - mir - 130 b大脑 CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU
hsa - mir - 454 - 3 - p UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU
mir - 137 571年 578年 1、m8 hsa - mir - 137 UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG
miR-141/200a 2192年 2199年 1、m8 hsa - mir - 141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
hsa - mir - 200 a UAACACUGUCUGGUAACGAUGU
mir - 142 - 5 - p 1166年 1172年 m8 hsa - mir - 142 - 5 - p CAUAAAGUAGAAAGCACUAC
miR-148/152 2135年 2142年 1、m8 hsa - mir - 148 a UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa - mir - 152大脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
hsa - mir - 148 b UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
mir - 186 2267年 2273年 1 hsa - mir - 186 CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU
mir - 194 2195年 2201年 1 hsa - mir - 194 UGUAACAGCAACUCCAUGUGGA
mir - 214 1136年 1142年 m8 hsa - mir - 214大脑 ACAGCAGGCACAGACAGGCAG
miR-30-5p 563年 569年 m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir - 320 1127年 1134年 1、m8 hsa - mir - 320 AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA
mir - 324 - 3 - p 2190年 2196年 m8 hsa - mir - 324 - 3 - p CCACUGCCCCAGGUGCUGCUGG
mir - 326 1991年 1998年 1、m8 hsa - mir - 326 CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG
mir - 338 353年 359年 m8 hsa - mir - 338大脑 UCCAGCAUCAGUGAUUUUGUUGA
mir - 361 2139年 2145年 1 hsa - mir - 361大脑 UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC
mir - 376 2391年 2397年 m8 hsa - mir - 376 a AUCAUAGAGGAAAAUCCACGU
hsa - mir - 376 b AUCAUAGAGGAAAAUCCAUGUU
mir - 381 978年 984年 1 hsa - mir - 381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir - 494 2420年 2426年 1 hsa - mir - 494大脑 UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU
mir - 539 122年 128年 1 hsa - mir - 539 GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU
miR-9 2542年 2548年 1 hsa-miR-9深圳 UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA