Gene Page:SOCS2

概括?
GeneID 8835
Symbol SOCS2
同义词 CIS2|Cish2|SOCS-2|SSI-2|SSI2|STATI2
描述 抑制细胞因子信号2
参考 MIM：605117|HGNC:HGNC:19382|Ensembl:ENSG00000120833|HPRD:05490|Vega:OTTHUMG00000170160
Gene type protein-coding
Map location 12q
Pascal p-value 0.008
Sherlock P值 0.266
Fetal beta 1.68
eGene Caudate basal ganglia
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set 描述 Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统的烤焦ch in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs12055836 chr6 45899822 SOCS2 8835 0.08 trans
rs7819766 chr8 132659889 SOCS2 8835 0.14 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
NCAPH 0.98 0.81
DTL 0.98 0.78
KIF2C 0.97 0.78
ORC1L 0.97 0.80
MCM2 0.97 0.90
GTSE1 0.97 0.84
MCM10 0.97 0.77
KIF20A 0.97 0.77
CDK2 0.97 0.63
PRC1 0.97 0.80
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
C5orf53 -0.47 -0.76
PTH1R -0.46 -0.70
HLA-F -0.45 -0.68
AF347015.31 -0.45 -0.83
AF347015.27 -0.45 -0.81
TNFSF12 -0.44 -0.66
FBXO2 -0.44 -0.60
AIFM3 -0.44 -0.67
MT-CO2 -0.44 -0.83
ALDOC -0.43 -0.64

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG JAK STAT SIGNALING PATHWAY 155 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TYPE II DIABETES MELLITUS 47 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 1 Pathway 55 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组生长激素受体信号传导 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA UP 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST LOBULAR CARCINOMA VS DUCTAL NORMAL DN 91 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM SYSTOLIC HEART FAILURE UP 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES NTN1 TARGETS UP 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG CLIM2 TARGETS UP 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC UP 185 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合粒细胞的tonks目标向上 55 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAGASHIMA NRG1 SIGNALING DN 58 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA DN 146 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG DN的Elvidge缺氧 59 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HIF1A TARGETS UP 67 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge HIF1A和HIF2A靶向 41 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAATINEN HEMATOPOIETIC STEM CELL UP 316 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LANDIS ERBB2 BREAST TUMORS 324 UP 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房5 6WK 116 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN对砷三氧化物的反应 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RASHI RESPONSE TO IONIZING RADIATION 2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FUNG IL2 SIGNALING 1 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FUNG IL2 TARGETS WITH STAT5 BINDING SITES 7 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIANG HEMATOPOIESIS STEM CELL NUMBER SMALL VS HUGE DN 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANTOVANI VIRAL GPCR SIGNALING UP 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN HEAD AND NECK CANCER E 89 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 240 MCF10A 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIN B CELL LYMPHOMA CLUSTER 2 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori前BI淋巴细胞向上 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和Sufu的Lee目标 53 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEGMEIER PRE-MITOTIC CELL CYCLE REGULATORS 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB TARGETS 1 UP 118 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEOK RESPONSE TO HD MTX DN 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSS AML WITH MLL FUSIONS 78 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hemin的addya红斑分化 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B LYMPHOCYTE PROGENITOR 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GALE APL WITH FLT3 MUTATED UP 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 16HR UP 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramalho Stemness 206 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 UP 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张抗病毒对利巴韦林DN的反应 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS UP 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T4 94 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P7 90 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG BOUND BY FOXP3 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG FOXP3 TARGETS IN THYMUS UP 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEIN ESRRA TARGETS UP 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUANG FOXA2 TARGETS UP 45 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE SKI TARGETS DN 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE UP 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG GLIOBLASTOMA PLASTICITY UP 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON AND RECTAL CANCER DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE TGFB1 TARGETS DN 108 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAUCH HEDGEHOG SIGNALING PARACRINE DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION C 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS UP 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼（Hoffmann 75 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROME INSULIN TARGETS IN MUSCLE DN 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VALK AML CLUSTER 1 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
flt3 itd的valk aml 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与T 9 11易位 130 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONO AML1 TARGETS DN 41 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ono foxp3目标 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SYED雌二醇反应 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEIN ESRRA TARGETS 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAMBOLSKY TARGETS OF MUTATED TP53 DN 50 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤经典 162 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WIERENGA STAT5A TARGETS UP 217 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WIERENGA STAT5A TARGETS GROUP2 60 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 6 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ TRANSLATION VIA FN1 SIGNALING 35 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR UP 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO ALLERGEN INDUCED TH2 ASSOCIATED MODULE 151 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 1 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因