总结吗?
GeneID 8841年
象征 HDAC3
同义词 HD3 | RPD3 | RPD3-2
描述 组蛋白脱乙酰酶3
参考 MIM: 605166|HGNC: HGNC: 4854|运用:ENSG00000171720|HPRD: 08950|织女:OTTHUMG00000129629
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 5问
帕斯卡假定值 0.45
夏洛克假定值 0.956
胎儿β 0.498
支持 染色质重塑基因

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.0032
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0004407 组蛋白脱乙酰酶的活动 助教 12711221
去:0016787 水解酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0008134 转录因子结合 助教 12711221
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0006350 转录 国际能源机构 - - - - - -
去:0006916 抗凋亡 助教 10777477
去:0016568 染色质修饰 助教 12711221
去:0016575 组蛋白脱乙酰作用 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000118 组蛋白脱乙酰酶复杂 助教 12711221
去:0005634 助教 12711221
去:0005737 细胞质 助教 12711221

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
ANKRD11 T13 ANCO-1 | LZ16 | 锚蛋白重复域11 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 15184363
ANKRD11 T13 ANCO-1 | LZ16 | 锚蛋白重复域11 ANCO-1与HDAC3交互。这种交互是仿照人类ANCO-1之间的交互和HDAC3从一个未指明的物种。 绑定 15184363
基于“增大化现实”技术 AIS | DHTR | HUMARA | KD | NR3C4 | SBMA | SMAX1 |解冻 雄性激素受体 重新组成复杂 BioGRID 12943985
ARID4A RBBP1 | RBP-1 | RBP1 丰富的互动领域4 (RBP1-like) - - - - - - HPRD 10490602
BCL3 BCL4 | D19S37 b细胞慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤3 HDAC3与BCL-3交互。 绑定 15469820
BCOR ANOP2 | FLJ20285 | FLJ38041 | KIAA1575 | MAA2 | MCOPS2 | MGC131961 | MGC71031 BCL6若 亲和力Capture-Western BioGRID 10898795
BIRC3 AIP1 | API2 | CIAP2 | HAIP1 | HIAP1 | MALT2 | MIHC | RNF49 baculoviral IAP repeat-containing 3 cIAP-2启动子与HDAC3交互。 绑定 15494311
CBFA2T3 ETO2 | MTG16 | MTGR2 | ZMYND4 α亚基2 core-binding因素,小牛域;转移到3 - - - - - - HPRD, BioGRID 12242670
CCND1 BCL1 | D11S287E | PRAD1 | U21B31 细胞周期蛋白D1 亲和力Capture-Western BioGRID 12048199|15558026
CCT5 CCT-epsilon | CCTE | KIAA0098 | TCP-1-epsilon 包含TCP1 chaperonin,亚基5(ε) - - - - - - HPRD, BioGRID 12502735
CSNK2A1 CK2A1 | CKII 酪蛋白激酶2,α1多肽 CSNK2A1 (CK2)磷酸化HDAC3。 绑定 15805470
CTBP1 酒吧| MGC104684 c端结合蛋白1 重新组成复杂 BioGRID 11022042
DAXX BING2 | DAP6 | EAP1 | MGC126245 | MGC126246 死亡域相关的蛋白质 西部 BioGRID 10669754
GATA1 ERYF1 | GF-1 | GF1 | NFE1 叫结合蛋白1(球蛋白转录因子1) 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 14668799
GATA2 MGC2306 | NFE1B 叫结合蛋白2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11567998
GPS2 AMF-1 | MGC104294 | MGC119287 | MGC119288 | MGC119289 G蛋白通路抑制2 亲和力Capture-MS
亲和力Capture-Western
BioGRID 11931768
GTF2I bap - 135 | BAP135 | BTKAP1 | diw | FLJ38776 | FLJ56355 | IB291 | |旋转TFII-I | WBS | WBSCR6 通用转录因子II,我 HDAC3与TFII-I交互。这种交互是仿照HDAC3之间的交互和TFII-I亚型来自不明物种。 绑定 12239342
GTF2I bap - 135 | BAP135 | BTKAP1 | diw | FLJ38776 | FLJ56355 | IB291 | |旋转TFII-I | WBS | WBSCR6 通用转录因子II,我 - - - - - - HPRD, BioGRID 12239342|12393887
GTF2I bap - 135 | BAP135 | BTKAP1 | diw | FLJ38776 | FLJ56355 | IB291 | |旋转TFII-I | WBS | WBSCR6 通用转录因子II,我 - - - - - - HPRD 12393887
GTF2IRD1 本| CREAM1 | GTF3 | MUSTRD1 | RBAP2 | WBS | WBSCR11 | WBSCR12 | hMusTRD1alpha1 GTF2I重复域包含1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12239342
GTF2IRD1 本| CREAM1 | GTF3 | MUSTRD1 | RBAP2 | WBS | WBSCR11 | WBSCR12 | hMusTRD1alpha1 GTF2I重复域包含1 HDAC3与hMusTRD1交互。之间的交互是仿照了交互从一个未指明的物种和人类hMusTRD1 HDAC3。 绑定 12239342
HDAC1 DKFZp686H12203 | GON-10 | HD1 | RPD3 | RPD3L1 组蛋白脱乙酰酶1 - - - - - - HPRD 10944117|11302704
HDAC10 DKFZp761B039 | MGC149722 组蛋白脱乙酰酶10 亲和力Capture-Western BioGRID 11861901
HDAC3 HD3 | RPD3 | RPD3-2 组蛋白脱乙酰酶3 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 11779848
HDAC4 HA6116 | HD4 | HDAC-A | HDACA | KIAA0288 组蛋白脱乙酰酶4 - - - - - - HPRD 11804585
HDAC4 HA6116 | HD4 | HDAC-A | HDACA | KIAA0288 组蛋白脱乙酰酶4 - - - - - - HPRD, BioGRID 11466315
HDAC5 FLJ90614 | HD5 | NY-CO-9 组蛋白脱乙酰酶5 - - - - - - HPRD, BioGRID 11804585
HDAC5 FLJ90614 | HD5 | NY-CO-9 组蛋白脱乙酰酶5 - - - - - - HPRD 11466315
HDAC7 DKFZp586J0917 | FLJ99588 | HD7A | HDAC7A 组蛋白脱乙酰酶7 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 11466315
HDAC9 HD7 DKFZp779K1053 | | HDAC | HDAC7 | HDAC7B | HDAC9B | HDAC9FL | HDRP | KIAA0744 | MITR 组蛋白脱乙酰酶9 不详的同种型HDAC9 (MITR)与HDAC3交互。这种交互是仿照人类HDAC9的演示了一个未指明的同种型之间的相互作用和HDAC3从一个未指明的物种。 绑定 15711539
HDAC9 HD7 DKFZp779K1053 | | HDAC | HDAC7 | HDAC7B | HDAC9B | HDAC9FL | HDRP | KIAA0744 | MITR 组蛋白脱乙酰酶9 - - - - - - HPRD, BioGRID 10655483
HIF1A HIF-1alpha | HIF1 | HIF1-ALPHA | MOP1 | PASD8 低氧诱导因子1α亚基(基本helix-loop-helix转录因子) 重新组成复杂 BioGRID 11641274
HIF1AN DKFZp762F1811 | FIH1 | FLJ20615 | FLJ22027 低氧诱导因子1α亚基抑制剂 重新组成复杂 BioGRID 11641274
人力资源 非盟ALUNC | | HSA277165 无毛的相同器官(鼠标) 亲和力Capture-Western BioGRID 11641275
HSPA4 APG-2 | HS24 / P52 | MGC131852 | |变化中hsp70 | hsp70RY 70 kda热休克蛋白4 - - - - - - HPRD, BioGRID 11777905
HSPA8 HSC54 | HSC70 | HSC71 | HSP71 | HSP73 | HSPA10 | LAP1 | MGC131511 | MGC29929 | NIP71 热休克蛋白质8 70 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 12502735
IKZF1 Hs.54452 | IK1 | IKAROS | LYF1 | PRO0758 | ZNFN1A1 | hIk-1 伊卡洛斯家族锌指1(伊卡洛斯飞船) 亲和力Capture-Western BioGRID 12015313
IL8 CXCL8 | GCP-1 | GCP1 |收| LUCT | LYNAP | MDNCF | MONAP |氟化钠| NAP-1 | NAP1 白介素8 引发剂与HDAC3交互。 绑定 15494311
小君 AP-1 | AP1 | c-Jun 小君致癌基因 - - - - - - HPRD, BioGRID 12853483
MAP3K7IP2 FLJ21885 | KIAA0733 | TAB2 增殖蛋白激酶激酶激酶7相互作用蛋白质2 - - - - - - HPRD, BioGRID 12150997
MAPK11 P38B | P38BETA2 | PRKM11 | SAPK2 | SAPK2B | p38-2 | p38Beta 增殖蛋白激酶11 - - - - - - HPRD, BioGRID 15356147
NCOR1 KIAA1047 | MGC104216 | N-CoR | TRAC1 | hCIT529I10 | hN-CoR 核受体若1 亲和力Capture-MS
亲和力Capture-Western
Co-fractionation
Co-purification
重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 10944117|11013263
|11466315|11804585
|11931768|12628926
|14527417
NCOR1 KIAA1047 | MGC104216 | N-CoR | TRAC1 | hCIT529I10 | hN-CoR 核受体若1 N-CoR与HDAC3交互。 绑定 12628926
NCOR1 KIAA1047 | MGC104216 | N-CoR | TRAC1 | hCIT529I10 | hN-CoR 核受体若1 - - - - - - HPRD 10944117|11509652
NCOR2 CTG26 | SMRT | SMRTE | SMRTE-tau | TNRC14 | TRAC-1 | TRAC1 核受体若2 亲和力Capture-MS
亲和力Capture-Western
Co-fractionation
Co-purification
重新组成复杂
BioGRID 10809664|10944117
|11013263|11804585
|12502735|12628926
|14527417
NFKBIA IKBA | MAD-3 | NFKBI 核因子k光多肽基因增强剂b细胞抑制剂,α HDAC3与I-kappa-B-alpha交互。 绑定 12972430
NR2C1 TR2 核受体亚科2,C组,成员1 - - - - - - HPRD, BioGRID 14521922
NR2C2 TAK1 | TR2R1 | TR4 | hTAK1 核受体亚科2,C组,成员2 重新组成复杂 BioGRID 12943985
PML 万立升| PP8675 | RNF71 | TRIM19 早幼粒细胞白血病 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 11259576
PPARD FAAR | MGC3931 | NR1C2 | NUC1 | NUCI | NUCII | PPAR-beta | PPARB 过氧物酶体proliferator-activated受体δ 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 11867749|12943985
PPARG NR1C3 | PPARG1 | PPARG2 | PPARgamma 过氧物酶体proliferator-activated受体γ - - - - - - HPRD, BioGRID 12479814
PPP4C PP4 | PPH3 | PPX 蛋白磷酸酶4 X(以前),催化亚基 PPP4C (PP4C)与HDAC3交互。 绑定 15805470
PPP4R1 PP4 (Rmeg) | PP4R1 蛋白磷酸酶4,调节亚基1 PPP4R1 (PP4R1)与HDAC3交互。 绑定 15805470
RARA NR1B1 | RAR 视黄酸受体α 重新组成复杂 BioGRID 12943985
RB1 OSRC | RB | p105-Rb |复审委员会| pp110 成视网膜细胞瘤1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12479814
RBBP4 NURF55 | RBAP48 视网膜母细胞瘤结合蛋白4 - - - - - - HPRD 11777905
RBBP4 NURF55 | RBAP48 视网膜母细胞瘤结合蛋白4 重新组成复杂 BioGRID 11470869
RBL1 CP107 | MGC40006 | PRB1 | p107 retinoblastoma-like 1 (p107) 亲和力Capture-Western BioGRID 10490602
RELA MGC131774 | NFKB3 | p65 v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) 亲和力Capture-Western BioGRID 11533489
RUNX1T1 AML1T1 | CBFA2T1 | CDR | |埃托奥MGC2796 | MTG8 | MTG8b | ZMYND2 runt-related转录因子1;转移到1(细胞周期蛋白D-related) 亲和力Capture-Western BioGRID 11533236
RUNX1T1 AML1T1 | CBFA2T1 | CDR | |埃托奥MGC2796 | MTG8 | MTG8b | ZMYND2 runt-related转录因子1;转移到1(细胞周期蛋白D-related) 环氧乙烷与HDAC3交互。 绑定 15333839
RUNX2 CCD AML3 | CBFA1 | | CCD1 | MGC120022 | MGC120023 | OSF2 | PEA2aA | PEBP2A1 | PEBP2A2 | PEBP2aA | PEBP2aA1 runt-related转录因子2 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 15292260
RXRA FLJ00280 | FLJ00318 | FLJ16020 | FLJ16733 | MGC102720 | NR2B1 类维生素a X受体α 重新组成复杂 BioGRID 12943985
SF3B1 PRP10 | PRPF10 | SAP155 | SF3b155 剪接因子3 b亚基1,155 kda 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
SIN3A DKFZp434K2235 | FLJ90319 | KIAA0700 SIN3同族体,转录监管机构(酵母) - - - - - - HPRD 10944117
SMARCA4 BAF190 |缺失| FLJ39786 | SNF2 | SNF2-BETA | SNF2L4 | SNF2LB | SWI2 | hSNF2b 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员4 - - - - - - HPRD 10944117
STAT3 APRF | FLJ20882 |麻疹| MGC16063 信号传感器和转录激活3(急性期反应的因素) Stat3与HDAC3交互。 绑定 15653507
SUV39H1 KMT1A | MG44 | SUV39H 抑制的彩色3 - 9同族体1(果蝇) 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 11788710
TBL1X EBI | SMAP55 | TBL1 transducin(β)——1 x连锁 亲和力Capture-MS
亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 10809664|11931768
TBL1X EBI | SMAP55 | TBL1 transducin(β)——1 x连锁 HDAC3与TBL1交互。 绑定 12628926
TBL1X EBI | SMAP55 | TBL1 transducin(β)——1 x连锁 - - - - - - HPRD 10944117|11931768
TBL1XR1 C21 | DC42 | FLJ12894 | IRA1 | TBLR1 transducin(β)——1 x受体1 亲和力Capture-MS BioGRID 11931768
TCP1 CCT-alpha | CCT1 | CCTa | D6S230E | TCP-1-alpha t-complex 1 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 12502735
THRB ERBA-BETA | ERBA2 | GRTH | MGC126109 | MGC126110 | NR1A2 | PRTH | THR1 | THRB1 | THRB2 甲状腺激素受体β(erythroblastic白血病病毒(v-erb-a)致癌基因同族体2,鸟类) - - - - - - HPRD 10944117
TNFSF10 APO2L | Apo-2L | CD253 | TL2 | 肿瘤坏死因子(配体)总科,10个成员 HDAC3与TNFSF10启动子进行交互。 绑定 15619633
VHL HRCA1 | RCA1 | VHL1 冯Hippel-Lindau肿瘤抑制 重新组成复杂 BioGRID 11641274
XPO1 CRM1 | DKFZp686B1823 间1 (CRM1同系物、酵母) - - - - - - HPRD, BioGRID 11779848
YY1 三角洲| INO80S | NF-E1 | UCRBP | YIN-YANG-1 YY1转录因子 - - - - - - HPRD, BioGRID 9346952
ZBTB16 PLZF | ZNF145 锌指和BTB域包含16 重新组成复杂 BioGRID 15467736
ZBTB33 ZNF-kaiso | ZNF348 锌指和BTB域包含33 亲和力Capture-MS
亲和力Capture-Western
BioGRID 14527417


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
BIOCARTA RELA通路 16 12 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CARM ER通路 35 27 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA RARRXR通路 15 9 所有SZGR 2.0基因通路
PID HDAC CLASSII通路 34 27 所有SZGR 2.0基因通路
PID HDAC抚慰心灵的途径 66年 50 所有SZGR 2.0基因通路
PID视黄酸途径 30. 23 所有SZGR 2.0基因通路
PID MYC抑制通路 63年 52 所有SZGR 2.0基因通路
PID 1 RB通路 65年 46 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过神经生长因子 217年 167年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME发育生物学 396年 292年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME BMAL1时钟NPAS2激活生理表现 36 27 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME PPARA激活基因表达 104年 72年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RORA基因激活生理表现 24 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME NOTCH1胞内域调节转录 46 28 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME昼夜镇压ERBA牧师的表达式 23 16 所有SZGR 2.0基因通路
由NOTCH1 REACTOME信号 70年 46 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME我正常受体介导信号关系 81年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME代谢脂质和脂蛋白 478年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168年 115年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME生物钟 53 40 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME转录调控的白色脂肪细胞的分化 72年 53 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过切口 103年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 1382年 904年 所有SZGR 2.0基因通路
DN SENESE HDAC3目标 536年 332年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
OZANNE AP1目标了 18 11 所有SZGR 2.0基因通路
曼AMIFOSTINE反应 20. 12 所有SZGR 2.0基因通路
DAIRKEE叔目标了 380年 213年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652年 1023年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA2 PCC网络 423年 265年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN 514年 330年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH MYC和上述目标 230年 156年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH自行车基因 648年 385年 所有SZGR 2.0基因通路
陈神经母细胞瘤拷贝数收益 50 35 所有SZGR 2.0基因通路
快活的HDAC扩散集群 57 35 所有SZGR 2.0基因通路
林APC的目标 77年 55 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯TRABECTEDIN反应 71年 49 所有SZGR 2.0基因通路
BRCA1和BRCA2 HEDENFALK乳腺癌 163年 113年 所有SZGR 2.0基因通路
海勒HDAC目标了 317年 208年 所有SZGR 2.0基因通路
党受MYC 1103年 714年 所有SZGR 2.0基因通路