基因页面:ANKRD13A
总结吗?
| GeneID | 88455年 |
| 象征 | ANKRD13A |
| 同义词 | ANKRD13 | NY-REN-25 |
| 描述 | 锚蛋白重复域13 |
| 参考 | MIM: 615123|HGNC: HGNC: 21268|运用:ENSG00000076513|HPRD: 12458|织女:OTTHUMG00000169314 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 12 q24.11 |
| 帕斯卡假定值 | 5.303 e-5 |
| 夏洛克假定值 | 0.491 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 表达式 | 荟萃分析的基因表达 | P值:1.593 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs246085 | chr12 | 109558196 | ANKRD13A | 88455年 | 0.14 | 独联体 | ||
| rs6829546 | chr4 | 12587664 | ANKRD13A | 88455年 | 0.14 | 反式 | ||
| rs6448932 | chr4 | 12595798 | ANKRD13A | 88455年 | 0.03 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 罗德里格斯甲状腺未分化癌DN | 537年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化和管理不善的DN | 382年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PASQUALUCCI淋巴瘤在GC阶段DN | 165年 | 104年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 | 393年 | 244年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王肿瘤侵袭性DN | 210年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 国外RB1增长目标 | 243年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 国外RB1目标融合性的 | 567年 | 365年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 促进DN KDM1A目标 | 211年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG类1引起的暂时性的EGF | 516年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 124.1 | 665年 | 671年 | 1 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA | ||||
| miR-124/506 | 658年 | 664年 | 1 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir - 137 | 1144年 | 1150年 | 1 | hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG |
| miR-204/211 | 1023年 | 1030年 | 1、m8 | hsa - mir - 204大脑 | UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU |
| hsa - mir - 211 | UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU | ||||
| hsa - mir - 204大脑 | UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU | ||||
| hsa - mir - 211 | UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU | ||||
| miR-22 | 802年 | 808年 | 1 | hsa-miR-22大脑 | AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU |
| hsa-miR-22大脑 | AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU | ||||
| mir - 320 | 289年 | 296年 | 1、m8 | hsa - mir - 320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA |
| mir - 500 | 137年 | 143年 | m8 | hsa - mir - 500 | AUGCACCUGGGCAAGGAUUCUG |
| mir - 539 | 1175年 | 1181年 | 1 | hsa - mir - 539 | GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU |