基因页面:TSC22D1

总结吗?
GeneID 8848年
象征 TSC22D1
同义词 Ptg-2 | TGFB1I4 | TSC22
描述 TSC22域家庭成员1
参考 MIM: 607715|HGNC: HGNC: 16826|运用:ENSG00000102804|HPRD: 07414|织女:OTTHUMG00000016838
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 13 q14
帕斯卡假定值 0.327
夏洛克假定值 0.354
胎儿β 0.303
DMG 1(#研究)
支持 CompositeSet
达内尔FMRP目标

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 1
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.0363

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg22183626 13 45150990 TSC22D1 -0.03 0.25 DMG: Nishioka_2013


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
SCN8A 0.94 0.93
KCNB1 0.93 0.91
AP000751.3 0.92 0.92
MEF2D 0.92 0.92
DLGAP2 0.91 0.84
TLN2 0.91 0.93
AAK1 0.91 0.94
SORL1 0.91 0.84
KCNMA1 0.90 0.80
LRRC8B 0.90 0.86
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
DBI -0.46 -0.62
RAB34 -0.45 -0.56
MYL12A -0.44 -0.63
PECI -0.42 -0.50
RAB13 -0.42 -0.53
RHOC -0.42 -0.58
EFEMP2 -0.42 -0.44
C1orf61 -0.42 -0.61
C21orf57 -0.41 -0.41
C9orf46 -0.41 -0.38

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003700 转录因子的活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0006350 转录 国际能源机构 - - - - - -
去:0006366 从RNA聚合酶II启动子转录 助教 9022669
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 核 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 源 PubMed ID
APLP1 APLP β淀粉样蛋白前体如蛋白1 (A4) 2台混合动力 BioGRID 16169070
ASAH1 PHP AC | ASAH表示| FLJ21558 | FLJ22079 | | PHP32 N-acylsphingosine酰胺水解酶(酸性ceramidase) 1 2台混合动力 BioGRID 16169070
BAT3 BAG-6 | BAG6 | D6S52E | G3 HLA-B相关记录3 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
CCDC90B MDS011 | MDS025 | MGC104239 卷曲螺旋域包含90 b 2台混合动力 BioGRID 16169070
CDK2 p33 (CDK2) 细胞周期蛋白依赖性激酶2 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
COPB2 β的警察 coatomer蛋白质复合体亚基β2(β') 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
CORO2B CLIPINC | KIAA0925 coronin肌动蛋白结合蛋白2 b 2台混合动力 BioGRID 16169070
DYNC1H1 DHC1 | DHC1a | DKFZp686P2245 | DNCH1 | DNCL | DNECL | DYHC | Dnchc1 | HL-3 | KIAA0325 |第22位 动力蛋白、胞质1,重链1 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
EPPK1 EPIPL | EPIPL1 epiplakin 1 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
GCN1L1 GCN1 | GCN1L | KIAA0219 GCN1一般控制的氨基酸合成1 1(酵母) 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
GSTK1 GST13 谷胱甘肽S-transferase kappa 1 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
HEATR2 FLJ20397 | FLJ25564 | FLJ31671 | FLJ39381 热量重复包含2 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
HNRNPM DKFZp547H118 | HNRNPM4 | HNRPM | HNRPM4 | HTGR1 | NAGR1 异构核核糖核蛋白米 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
iar FLJ20736 | IARS1 |劳工关系| PRO0785 isoleucyl-tRNA合成酶 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
KIAA0090 RP1-43E13.1 KIAA0090 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
MAP3K12 DLK | MUK | ZPK | ZPKP1 增殖蛋白激酶激酶激酶12 2台混合动力 BioGRID 16169070
地铁 FLJ33168 | FLJ43216 | FLJ45386 |女士 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine甲基转移酶 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
NDUFA9 MGC111043 | NDUFS2L NADH脱氢酶(辅酶q) 1α复形,9日,39 kda 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
NRBP1 MADM BCON3 | FLJ27109 | FLJ35541 | | MUDPNP | NRBP 核受体结合蛋白1 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
NUP93 KIAA0095 | MGC21106 nucleoporin 93 kda 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
RGS1 1 r20 | BL34 | IER1 | IR20 蛋白信号1的监管机构 2台混合动力 BioGRID 16169070
RPA3 REPA3 复制蛋白A3, 14 kda 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
SETDB1 ESET | KG1T | KIAA0067 | KMT1E 设置域,分支1 2台混合动力 BioGRID 16169070
SFXN1 FLJ12876 sideroflexin 1 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
SLC25A22 FLJ13044 | GC1 溶质载体家族25(线粒体载体:谷氨酸),22个成员 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
SRPRB APMCF1 信号识别颗粒受体B亚基 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
TSC22D1 DKFZp686O19206 | MGC17597 | rp11 - 269 c23.2 | TGFB1I4 | TSC22 TSC22域家族,成员1 2台混合动力 BioGRID 16169070
TSC22D4 THG-1 | THG1 TSC22域家族成员4 - - - - - - HPRD 10488076


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 783年 507年 所有SZGR 2.0基因通路
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 579年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 1382年 904年 所有SZGR 2.0基因通路
HORIUCHI WTAP目标了 306年 188年 所有SZGR 2.0基因通路
王LMO4目标了 372年 227年 所有SZGR 2.0基因通路
武田的目标NUP98 HOXA9融合8 d 157年 91年 所有SZGR 2.0基因通路
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1融合HSC DN 187年 115年 所有SZGR 2.0基因通路
DITTMER PTHLH目标了 112年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
ODONNELL TFRC目标了 456年 228年 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌6小时DN 167年 One hundred. 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN 805年 505年 所有SZGR 2.0基因通路
HAHTOLA蕈样了 19 15 所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应角化细胞 530年 342年 所有SZGR 2.0基因通路
DN CHEBOTAEV GR目标 120年 73年 所有SZGR 2.0基因通路
MARKEY RB1急性LOF DN 228年 137年 所有SZGR 2.0基因通路
兰迪斯ERBB2乳房肿瘤65 DN 37 22 所有SZGR 2.0基因通路
兰迪斯ERBB2乳房肿瘤324 DN 149年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
MCBRYAN发育期TGFB1目标 169年 127年 所有SZGR 2.0基因通路
RIZ红细胞分化12小时 43 35 所有SZGR 2.0基因通路
TSUNODA顺铂耐药性DN 51 38 所有SZGR 2.0基因通路
DAIRKEE叔目标了 380年 213年 所有SZGR 2.0基因通路
GRUETZMANN胰腺癌起来 358年 245年 所有SZGR 2.0基因通路
布伊泰尔特说光动力治疗压力 811年 508年 所有SZGR 2.0基因通路
洛佩兹MBD的目标 957年 597年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH NANOG目标 988年 594年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH OCT4目标 290年 172年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SOX2目标 734年 436年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH号目标 179年 105年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH自行车基因 648年 385年 所有SZGR 2.0基因通路
建筑师周边的时钟 169年 111年 所有SZGR 2.0基因通路
尼尔森对雄激素 86年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
JECHLINGER上皮间充质转变DN 66年 47 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER活检肾移植排斥和好的DN 546年 351年 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 555年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
GALINDO肠毒素的免疫反应 85年 67年 所有SZGR 2.0基因通路
王不灭的HOXA9和MEIS1 DN 24 15 所有SZGR 2.0基因通路
FERRANDO T与MLL ENL融合起来 87年 67年 所有SZGR 2.0基因通路
LENAOUR树突状细胞成熟DN 128年 90年 所有SZGR 2.0基因通路
王MLL CBP融合DN的目标 45 31日 所有SZGR 2.0基因通路
AFFAR YY1目标了 214年 133年 所有SZGR 2.0基因通路
高雄应对UVB辐射 86年 55 所有SZGR 2.0基因通路
KAAB失败心脏心房DN 141年 99年 所有SZGR 2.0基因通路
李卡路里限制大脑皮层 83年 66年 所有SZGR 2.0基因通路
SESTO应对紫外线C6 39 27 所有SZGR 2.0基因通路
麦克朗CREB1 DN的目标 57 39 所有SZGR 2.0基因通路
DAZARD应对紫外线这些地方 244年 151年 所有SZGR 2.0基因通路
曾IRS1 DN的目标 135年 88年 所有SZGR 2.0基因通路
伯顿脂肪生成1 33 24 所有SZGR 2.0基因通路
集群G1 DAZARD紫外线反应 67年 41 所有SZGR 2.0基因通路
曾脂肪形成的潜在DN 46 28 所有SZGR 2.0基因通路
KAAB失败心脏心室DN 41 28 所有SZGR 2.0基因通路
《图片报》极品致癌签名 261年 166年 所有SZGR 2.0基因通路
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 393年 244年 所有SZGR 2.0基因通路
CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 720年 440年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1 DN的目标 543年 317年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯TP53的目标了 602年 364年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1和TP53的目标 601年 369年 所有SZGR 2.0基因通路
麦凯布受HOXC6 469年 239年 所有SZGR 2.0基因通路
郑胶质母细胞瘤可塑性DN 58 39 所有SZGR 2.0基因通路
拉贝风TGFB1目标了 102年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
陈HOXA5目标9小时 223年 132年 所有SZGR 2.0基因通路
蔡应对放射治疗 32 20. 所有SZGR 2.0基因通路
BOYLAN多发性骨髓瘤C DN 59 39 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA CSF2RB和IL4 DN 315年 201年 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA应对HGF 418年 282年 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 408年 276年 所有SZGR 2.0基因通路
张核心DN血清反应 209年 137年 所有SZGR 2.0基因通路
36张及目标的人力资源 221年 150年 所有SZGR 2.0基因通路
60张及目标的人力资源 293年 203年 所有SZGR 2.0基因通路
张及目标了 108年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
汉SATB1目标了 395年 249年 所有SZGR 2.0基因通路
CROONQUIST国家管制当局方面与基质刺激DN 99年 65年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和发票16易位 422年 277年 所有SZGR 2.0基因通路
开罗肝母细胞癌类DN 210年 141年 所有SZGR 2.0基因通路
黄成人组织干细胞模块 721年 492年 所有SZGR 2.0基因通路
集群G24 DAZARD紫外线反应 28 19 所有SZGR 2.0基因通路
WHITFIELD细胞周期G1 148年 95年 所有SZGR 2.0基因通路
RAGHAVACHARI血小板特定基因 70年 46 所有SZGR 2.0基因通路
国外RB1目标衰老 572年 352年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日GLIS2目标了 84年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
赞美上帝FOXO3 DN的目标 187年 109年 所有SZGR 2.0基因通路
KASLER HDAC7目标1 194年 133年 所有SZGR 2.0基因通路
李BMP2目标了 745年 475年 所有SZGR 2.0基因通路
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 824年 528年 所有SZGR 2.0基因通路
PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 448年 282年 所有SZGR 2.0基因通路
JUBAN SPI1和FLI1的目标 115年 73年 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG类1引起的暂时性的EGF 516年 308年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 101 530年 536年 m8 hsa - mir - 101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
miR-124/506 296年 302年 m8 hsa - mir - 506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa - mir - 124大脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir - 134 81年 87年 m8 hsa - mir - 134大脑 UGUGACUGGUUGACCAGAGGG
mir - 200 bc / 429 147年 154年 1、m8 hsa - mir - 200 b UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
hsa - mir - 200 c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa - mir - 429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
mir - 203.1 89年 95年 1 hsa - mir - 203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
mir - 205 623年 629年 m8 hsa - mir - 205 UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG
mir - 381 642年 648年 1 hsa - mir - 381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir - 542 - 3 - p 502年 508年 m8 hsa - mir - 542 - 3 - p UGUGACAGAUUGAUAACUGAAA