基因页面:CCK

总结吗?
GeneID 885年
象征 CCK
同义词 - - - - - -
描述 缩胆囊素
参考 MIM: 118440|HGNC: HGNC: 1569|运用:ENSG00000187094|HPRD: 00321|织女:OTTHUMG00000131796
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 3 p22 . 1
帕斯卡假定值 0.204
夏洛克假定值 0.814
胎儿β -3.098
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 生成的信号

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,精神分裂症患者,神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:4

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg16864658 3 42306150 CCK 4.42的军医 0.568 0.045 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs9571716 chr13 67711344 CCK 885年 0.16 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
BUB1 0.98 0.84
RRM2 0.98 0.81
CCNB2 0.98 0.83
MELK 0.98 0.84
PRC1 0.98 0.76
EXO1 0.98 0.79
KIF4A 0.97 0.86
迪泰 0.97 0.85
BIRC5 0.97 0.81
KIF2C 0.97 0.80
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC9A3R2 -0.38 -0.47
FBXO2 -0.37 -0.67
HLA-F -0.37 -0.77
C5orf53 -0.37 -0.70
PTH1R -0.37 -0.68
ASPHD1 -0.36 -0.55
TNFSF12 -0.36 -0.65
LHPP -0.36 -0.60
AIFM3 -0.35 -0.69
ALDOC -0.35 -0.66

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005184 神经肽激素活动 国际能源机构 轴突,Synap、脑、神经递质(术语层面:6) - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007409 axonogenesis 国际能源机构 神经元,轴突神经突(术语层面:12) - - - - - -
去:0001764 神经元迁移 国际能源机构 神经元(术语层面:8) - - - - - -
去:0007165 信号转导 助教 10320330
去:0042755 饮食行为 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0030424 轴突 国际能源机构 神经元,轴突神经递质(术语层面:6) - - - - - -
去:0005576 细胞外区域 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
REACTOME胃泌激素分子通过PKC和MAPK信号通路 205年 136年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME GPCR信号的 920年 449年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME肽配体受体有约束力 188年 108年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME类A1受体等视紫红质 305年 177年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME GαQ信号事件 184年 116年 所有SZGR 2.0基因通路
下游REACTOME GPCR信号 805年 368年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME GPCR配体结合 408年 246年 所有SZGR 2.0基因通路
刘前列腺癌DN 481年 290年 所有SZGR 2.0基因通路
金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 1278年 748年 所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应角化细胞 530年 342年 所有SZGR 2.0基因通路
BERENJENO岩石信号不是通过RHOA 29日 21 所有SZGR 2.0基因通路
MARKEY RB1急性LOF DN 228年 137年 所有SZGR 2.0基因通路
MCBRYAN发育期乳房4 5周 271年 175年 所有SZGR 2.0基因通路
通过小道HAMAI细胞凋亡 584年 356年 所有SZGR 2.0基因通路
DN SCHLOSSER血清反应 712年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
JECHLINGER上皮间充质转变 71年 51 所有SZGR 2.0基因通路
桑塞姆APC DN的目标 366年 238年 所有SZGR 2.0基因通路
张EWSR1 FLI1融合的目标 88年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
STAEGE尤因家族肿瘤 33 22 所有SZGR 2.0基因通路
MODY海马产后 63年 50 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
麦克朗可卡因奖励5 d 79年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
麦克朗三角洲FOSB目标2周 48 36 所有SZGR 2.0基因通路
DAZARD应对紫外线这些地方 244年 151年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒18人力资源 178年 111年 所有SZGR 2.0基因通路
麦克朗CREB1目标了 One hundred. 72年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒12小时 111年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
佐藤在胰腺癌1被甲基化 419年 273年 所有SZGR 2.0基因通路
江老化大脑皮层DN 54 43 所有SZGR 2.0基因通路
海勒HDAC目标被甲基化 461年 298年 所有SZGR 2.0基因通路
RIZKI肿瘤侵袭性的3 d 210年 124年 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305年 895年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 435年 318年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 756年 494年 所有SZGR 2.0基因通路
金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 682年 440年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍CALB1 CORR 548年 370年 所有SZGR 2.0基因通路
VERHAAK胶质母细胞瘤神经 129年 85年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 280年 158年 所有SZGR 2.0基因通路
GHANDHI直接照射 110年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
GHANDHI旁观者照射了 86年 54 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-23 132年 139年 1、m8 hsa-miR-23a大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
hsa-miR-23b大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
mir - 323 132年 138年 1 hsa - mir - 323大脑 GCACAUUACACGGUCGACCUCU