SZGR2 - Beplay体育中心

概括？

GeneID	8850
Symbol	kat2b
Synonyms	CAF \| P/CAF \| PCAF
描述	lysine acetyltransferase 2B
参考	MIM：602303\|HGNC:HGNC:8638\|Ensembl：ENSG00000114166\|HPRD：06780\|Vega：Otthumg00000130481
基因类型	蛋白质编码
Map location	3P24
Pascal p-value	0.19
胎儿β	-1.344
Support	Chromatin Remodeling Genes

数据源中的基因

基因集名称	Method of gene set	描述
简历：Gwascat	全基因组关联研究	This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb.
CV：GWASDB	全基因组关联研究	精神分裂症的GWASDB记录
CV:PGCnp	Genome-wide Association Study	GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0003713	转录共激活因子活性	IDA		12435739
去：0004402	组蛋白乙酰转移酶活性	IEA		-
GO：0016740	转移酶活性	IEA		-
去：0008080	N-acetyltransferase activity	IEA		-
GO：0042826	组蛋白脱乙酰基酶结合	IPI		12887892
Biological process	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0006355	调节转录，DNA依赖性的调节	IEA		-
GO:0006350	转录	IEA		-
GO:0006338	染色质重塑	nas		10365964
GO:0006473	蛋白氨基酸乙酰化	塔斯		8684459
GO:0007049	细胞周期	IEA		-
GO:0007050	细胞周期停滞	塔斯		8684459
去：0008285	negative regulation of cell proliferation	IDA		8684459
GO:0008152	代谢过程	IEA		-
GO:0018076	N-terminal peptidyl-lysine acetylation	IDA		12435739
GO:0044419	生物之间的种间相互作用	IEA		-
细胞分量	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005634	核	塔斯		10891508
去：0005654	nucleoplasm	EXP		11250901

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	官方全名b	实验	来源	PubMed ID
Alb	DKFZp779N1935 \| PRO0883 \| PRO0903 \| PRO1341	albumin	PCAF interacts with the Albumin gene.	绑定	15616580
ARNTL	BMAL1 \|bmal1c \|JAP3 \|MGC47515 \|mop3 \|pasd3 \|抽动\|Bhlhe5	aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like	重构的复合物	Biogrid	14645221
BRCA2	brcc2 \|FACD \|时尚\|Fad1 \|Fancb \|fancd \|FANCD1	breast cancer 2, early onset	-	HPRD，Biogrid	9824164
CCND1	bcl1 \|D11S287E \|prad1 \|U21B31	cyclin D1	-	HPRD，Biogrid	10318892
cdc25b	-	细胞分裂周期25同源物B（S. pombe）	-	HPRD，Biogrid	11689696
CDK8	K35 \| MGC126074 \| MGC126075	cyclin-dependent kinase 8	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	9710619
时钟	KAT13D \| KIAA0334 \| bHLHe8	clock homolog (mouse)	重构的复合物	Biogrid	14645221
克雷布	CBP \| KAT3A \| RSTS	CREB结合蛋白	亲和力捕获 - 韦斯特恩共同分级重构的复合物	Biogrid	9710619\|11864601
CTBP1	酒吧\|MGC104684	C-terminal binding protein 1	CTBP1与PCAF互动	绑定	15834423
CTBP1	酒吧\|MGC104684	C-terminal binding protein 1	生化活动	Biogrid	9824164
CUX1	CASP \|CDP \|CDP/CUT \|CDP1 \|coy1 \|cutl1 \|Cux \|clox \|CUX/CDP \|golim6 \| Nbla10317 \| p100 \| p110 \| p200 \| p75	cut-like homeobox 1	-	HPRD，Biogrid	10852958
EP300	KAT3B \| p300	E1a结合蛋白p300	生化活动	Biogrid	12419806
EVI1	AML1-EVI-1 \| EVI-1 \| MDS1-EVI1 \| MGC163392 \| PRDM3	生态病毒整合站点1	-	HPRD，Biogrid	11568182
H3F3A	H3.3a \|H3F3 \|MGC87782 \|MGC87783	H3 histone, family 3A	H3F3A（组蛋白3）与PCAF相互作用。	绑定	15616580
Hist4H4	H4/p \| MGC24116	组蛋白簇4，H4	PCAF interacts with and acetylates H4. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between PCAF and H4, both from unspecified species.	绑定	15992539
HNF1A	HNF1 \| LFB1 \| MODY3 \| TCF1	HNF1 homeobox A	-	HPRD，Biogrid	10777539
ING1	p24ing1c \|p33 \|p33ing1 \|p33ing1b \|P47 \|P47ing1a	成长家族抑制剂，成员1	-	HPRD，Biogrid	12015309
IRF1	IRF-1 \| MAR	干扰素调节因子1	-	HPRD，Biogrid	10022868\|11304541
IRF2	DKFZp686F0244 \| IRF-2	干扰素调节因子2	-	HPRD，Biogrid	10022868\|11304541
JDP2	JUNDM2	二聚化蛋白2	-	HPRD	12101239
KLF13	BTEB3 \|FKLF2 \|NSLP1 \|rflat-1 \|rflat1	类似克鲁诗的因子13	-	HPRD，Biogrid	11748222
MDM2	HDMX \| MGC71221 \| hdm2	Mdm2 p53 binding protein homolog (mouse)	-	HPRD，Biogrid	12068014
Med21	SRB7 \|Surb7	中介复合体亚基21	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	9710619
我的C	Bhlhe39 \|c-myc	V-myc骨髓质体病毒性癌基因同源物（禽类）	亲和力捕获 - 韦斯特恩 Co-purification 重构的复合物	Biogrid	12660246
NCOA1	F-SRC-1 \|kat13a \|MGC129719 \|MGC129720 \|NCOA-1 \|RIP160 \|SRC-1 \|src1 \|Bhlhe42	核受体共激活因子1	-	HPRD，Biogrid	9296499
NCOA3	ACTR \| AIB-1 \| AIB1 \| CAGH16 \| CTG26 \| KAT13B \| MGC141848 \| RAC3 \| SRC3 \| TNRC14 \| TNRC16 \| TRAM-1 \| pCIP	核受体共激活因子3	P/CAF interacts with TRAM-1.	绑定	9346901
NCOA3	ACTR \| AIB-1 \| AIB1 \| CAGH16 \| CTG26 \| KAT13B \| MGC141848 \| RAC3 \| SRC3 \| TNRC14 \| TNRC16 \| TRAM-1 \| pCIP	核受体共激活因子3	-	HPRD	9445475
NCOA4	ARA70 \|DKFZP762E1112 \|ELE1 \|PTC3 \|RFG	核受体共激活因子4	-	HPRD，Biogrid	9892017
Notch1	TAN1 \| hN1	Notch同源1，易位相关（果蝇）	-	HPRD	10747963
Notch3	卡达西尔\|卡西尔	Notch同源3（果蝇）	-	HPRD	11404076
NPAS2	FLJ23138 \| MGC71151 \| MOP4 \| PASD4 \| bHLHe9	神经元PAS结构蛋白2	重构的复合物	Biogrid	14645221
NR4A1	GFRP1 \|HMR \|MGC9485 \|N10 \|Nak-1 \|ngfib \|NP10 \|Nur77 \|TR3	核受体亚科4，A组，成员1	-	HPRD，Biogrid	12082103
NRIP1	FLJ77253 \|RIP140	nuclear receptor interacting protein 1	-	HPRD	14581481
Onecut1	HNF-6 \|HNF6 \|HNF6A	一个切割的同源蛋白盒1	-	HPRD，Biogrid	10811635
PGR	NR3C3 \|PR	progesterone receptor	PRB与PCAF互动。这种相互作用是基于未指定物种的人类PRB和PCAF之间的相互作用建模的。	绑定	9223281
POLR2A	MGC75453 \|polr2 \|波拉\|RPB1 \|RPBH1 \|RPO2 \|rpol2 \|rpiils \|HRPB220 \|HSRPB1	polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A, 220kDa	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	9710619
拉拉	NR1B1 \| RAR	retinoic acid receptor, alpha	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	14581481
RB1	OSRC \|RB \|P105-RB \|PRB \|PP110	retinoblastoma 1	PRB与P/CAF的乙酰转移酶结构域相互作用。	绑定	15044952
RBPJ	CBF1 \|igkjrb \|igkjrb1 \|kbf2 \|MGC61669 \|RBP-J \|rbpjk \|rbpsuh \|suh \|CSL	recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region	-	HPRD，Biogrid	10747963
SMARCB1	BAF47 \|ini1 \|RDT \|SNF5 \|SNF5L1 \|SFH1P \|snr1 \|HSNFS	SWI/SNF相关，矩阵相关，染色质的肌动蛋白依赖性调节剂，亚家族B，成员1	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	9710619
SRCAP	domo1 \|EAF1 \|FLJ44499 \|KIAA0309 \|SWR1	Snf2-related CREBBP activator protein	-	HPRD	11581372
SUPT3H	SPT3 \| SPT3L	suppressor of Ty 3 homolog (S. cerevisiae)	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12660246
TACC2	Azu-1 \|ectacc	transforming, acidic coiled-coil containing protein 2	TACC2与PCAF相互作用。	绑定	14767476
taf5l	PAF65B	TAF5-like RNA polymerase II, p300/CBP-associated factor (PCAF)-associated factor, 65kDa	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12660246
TAF9	AD-004 \|AK6 \|CGI-137 \|电影院\|cip \|MGC1603 \|MGC3647 \|MGC5067 \|MGC：1603 \|MGC：3647 \| MGC:5067 \| TAF2G \| TAFII31 \| TAFII32 \| TAFIID32	TAF9 RNA聚合酶II，TATA盒结合蛋白（TBP）相关因子，32KDA	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12660246
TCF3	e2a \|itf1 \|MGC129647 \|MGC129648 \|BHLHB21	转录因子3（E2A免疫球蛋白增强子结合因子E12/E47）	-	HPRD，Biogrid	12435739
TP53	FLJ92943 \|LFS1 \|trp53 \|p53	肿瘤蛋白p53	生化活动	Biogrid	12068014
trrap	FLJ10671 \| PAF350/400 \| PAF400 \| STAF40 \| TR-AP \| Tra1	转化/转录结构域相关蛋白	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	11509179\|12660246
TTF1	-	转录终止因子，RNA聚合酶I	-	HPRD，Biogrid	11250901
TWIST1	ACS3 \|bpes2 \|bpes3 \|SCS \|扭曲\|BHLHA38	扭曲同源1（果蝇）	-	HPRD，Biogrid	10025406
yy1	delta \|INO80S \|NF-E1 \|UCRBP \|阴阳1	YY1转录因子	生化活动	Biogrid	11486036

V.途径注释

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
Kegg Notch信号通路	47	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA VDR PATHWAY	12	7	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA RARRXR PATHWAY	15	9	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SMAD2 3核途径	82	63	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HDAC ClassIII途径	25	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID E2F PATHWAY	74	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HDAC Classi途径	66	50	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FOXO PATHWAY	49	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AR TF途径	53	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid视黄酸途径	30	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53调节途径	59	50	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PreNCH的转录和翻译	29	17	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome YAP1和WWTR1 TAZ刺激基因表达	24	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PRE NOTCH EXPRESSION AND PROCESSING	44	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NOTCH1 INTRACELLULAR DOMAIN REGULATES TRANSCRIPTION	46	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Notch的Reactome信号传导1	70	46	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome通用转录途径	352	181	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I转录	89	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NOTCH HLH TRANSCRIPTION PATHWAY	13	8	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSCRIPTION	210	127	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录	122	80	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Notch的Reactome信号传导	103	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I转录INITIATION	25	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN	526	357	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION MONOCYTE DN	54	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN	199	124	该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN	805	505	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC DN	537	339	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO ROCK SIGNALING NOT VIA RHOA DN	48	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN	1781年	1082	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAGY PCAF COMPONENTS HUMAN	9	7	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN	164	111	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN	514	319	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN	203	134	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana乳腺癌点燃int网络	101	73	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS DN	848	527	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因	648	385	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标	893	528	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上	256	159	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSSEN MYC TARGETS	53	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG POU5F1 TARGETS UP	15	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CHICK	169	111	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞	293	193	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT UP	390	242	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN	371	218	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病	1691年	1088	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mulligan NTF3通过INSR和IGF1R DN信号传导	13	6	该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成6	189	112	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应	953	554	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时	783	442	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3	720	440	该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激	1022	619	该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEARMAN LUNG CANCER EARLY VS LATE UP	125	89	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN	270	181	该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄Foxa2靶向	45	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN DN	249	165	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING	510	309	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chung水泡细胞毒性DN	44	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 DN	40	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤PR DN	44	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特（Nielsen Gist）	98	66	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE S	162	86	该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAMBOLSKY RESPONSE TO VITAMIN D3 DN	26	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时DN	91	56	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN	505	328	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUBTIL PROGESTIN TARGETS	36	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS DN	1972	1213	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D	882	506	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND WITH H4K20ME1 MARK	145	82	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A	770	480	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN	784	464	该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A	182	108	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY	1839	928	该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

mirna家族	Target position			mirna id	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	mirna id	mirna seq
miR-142-3p	1141	1148	1A，M8	hsa-miR-142-3p	uguaguuuccuacuuuaugga
miR-17-5p/20/93.mr/106/519.d	120	126	M8	hsa-miR-17-5p	CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
				HSA-MIR-20A^脑	uaaagugcuuauagugcagguag
				HSA-MIR-106A	aaaagugcuuacugugcagguagc
				HSA-MIR-106B^SZ	uaaagugcugacagugcagau
				HSA-MIR-20B^SZ	CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
				hsa-miR-519d	CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
miR-181	366	372	M8	HSA-MIR-181A^脑	aacauucaacgcugucggugagu
				HSA-MIR-181B^SZ	AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
				HSA-MIR-181C^脑	AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
				HSA-MIR-181D^脑	AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU
miR-19	314	320	1A	HSA-MIR-19A	UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
miR-19	314	320	1A	HSA-MIR-19B	ugugcaaauccaugcaaaacuga
MiR-200BC/429	1021	1027	M8	HSA-MIR-200B	UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
				HSA-MIR-200C	uaauacugccggguaaugaugg
				HSA-MIR-429	uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-205	420	426	1A	HSA-MIR-205	uccuucauucccggagucug
miR-25/32/92/363/367	1748年	1755年	1A，M8	HSA-MIR-25^脑	Cauugcacuugucucggucuga
				hsa-miR-32	uauugcacauacuaaguugc
				hsa-miR-92	UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG
				HSA-MIR-367	AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA
				hsa-miR-92b^SZ	uauugcacucgucccgcgcuc
miR-27	1618	1624年	1A	HSA-MIR-27A^脑	uucacaguggcuaaguuccgc
miR-27	1618	1624年	1A	HSA-MIR-27B^脑	UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC
mir-30-3p	557	563	1A	HSA-MIR-30A-3P	CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC
mir-30-3p	557	563	1A	HSA-MIR-30E-3P	CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC
mir-330	543	550	1A，M8	HSA-MIR-330^脑	GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-495	1626年	1633年	1A，M8	HSA-MIR-495^脑	Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520	119	125	M8	hsa-miR-93^脑	aaagugcuguucgugcagguag
				HSA-MIR-302A	uaagugcuugcauguuuguga
				HSA-MIR-302B	UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG
				HSA-MIR-302C	UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
				HSA-MIR-302D	UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU
				HSA-MIR-372	AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU
				HSA-MIR-373	Gaagugcuucgauuuggggugu
				HSA-MIR-520E	AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
				HSA-MIR-520A	aaagugcuucccuuguggugu
				HSA-MIR-520B	aaagugcuuuuuuagaggg
				HSA-MIR-520C	aaagugcuuuuuuagagggUU
				HSA-MIR-520D	aaaguguuugugggguggguu

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击这里查看与SZ相关的miRNA列表。
大脑:microrna的表达大脑基于on miRNA microarray expression studies. Click这里查看与大脑相关的miRNA列表。

Gene Page:kat2b