基因页：FCGBP

概括？
基因 8857
象征 FCGBP
同义词 FC（伽马）BP
描述 IgG结合蛋白的FC片段
参考 HGNC：HGNC：13572|Ensembl：ENSG00000275395|HPRD：10956|Vega：Otthumg00000182580
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.1
Pascal P值 0.166
Sherlock P值 0.094
胎儿β 0.669
DMG 1（＃研究）
主持人 尾状基底神经节
皮质
海马
伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
DNM：XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
FCGBP CHR19 40430427 C 一个 NM_003890 p.506d> y 错过 精神分裂症 DNM：XU_2012

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG18051762 19 40388677 FCGBP 1.517E-4 -0.366 0.032 DMG：Wockner_2014
CG24864275 19 40421453 FCGBP 1.606E-4 0.233 0.032 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS473411 CHR1 110846615 FCGBP 8857 0.19 反式
RS17004962 CHR4 81563338 FCGBP 8857 0.08 反式
RS16873760 CHR6 45729388 FCGBP 8857 0.08 反式
RS16873861 CHR6 45752854 FCGBP 8857 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ACVR1B 0.89 0.92
OSBPL10 0.89 0.89
GPD1L 0.89 0.88
USP6NL 0.89 0.89
SPTAN1 0.88 0.88
LMO7 0.88 0.86
ctnnd2 0.87 0.83
HERC3 0.87 0.89
C5orf25 0.86 0.89
SEC31A 0.86 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
serpinb6 -0.73 -0.78
HSD17B14 -0.72 -0.83
MT-CO2 -0.72 -0.83
AF347015.31 -0.72 -0.82
FXYD1 -0.70 -0.83
higd1b -0.70 -0.84
AF347015.33 -0.69 -0.78
mt-cyb -0.69 -0.79
ifi27 -0.68 -0.81
AF347015.8 -0.68 -0.81

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王·巴雷特（Wang Barretts）食道 51 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
瓦特自动甲状腺腺瘤 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kuuselo胰腺癌19Q13扩增 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine卵泡甲状腺腺瘤 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌DN 80 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因