基因页面:STK19
总结吗?
| GeneID | 8859年 |
| 象征 | STK19 |
| 同义词 | D6S60 | D6S60E | G11 | HLA-RP1 |一国 |
| 描述 | 丝氨酸/苏氨酸激酶19 |
| 参考 | MIM: 604977|HGNC: HGNC: 11398|运用:ENSG00000204344|HPRD: 07281|织女:OTTHUMG00000166424 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 . 3 |
| 帕斯卡假定值 | 5.868 e-9 |
| 夏洛克假定值 | 0.079 |
| 胎儿β | 0.292 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg17139322 | 6 | 31940089 | STK19; DOM3Z | 3.51 e-5 | -0.493 | 0.02 | DMG: Wockner_2014 |
| cg20284673 | 6 | 31940167 | STK19 | 8.8 e-8 | -0.005 | 2.02 e-5 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7201717 | chr16 | 6065279 | STK19 | 8859年 | 0.12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CNGB1 | 0.72 | 0.79 |
| SLC7A4 | 0.71 | 0.81 |
| MATN2 | 0.71 | 0.72 |
| GALNTL1 | 0.68 | 0.76 |
| MYO7A | 0.67 | 0.73 |
| VWA5A | 0.66 | 0.74 |
| TMEM130 | 0.66 | 0.78 |
| LENG4 | 0.65 | 0.79 |
| KCNC4 | 0.65 | 0.79 |
| AC112484.1 | 0.63 | 0.73 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLA | -0.25 | 0.07 |
| KLHL1 | -0.25 | 0.06 |
| DACT1 | -0.25 | 0.08 |
| RPL24 | -0.24 | -0.33 |
| NEUROD6 | -0.24 | -0.03 |
| RPS3AP47 | -0.24 | -0.29 |
| SATB2 | -0.23 | 0.02 |
| RPL9 | -0.23 | -0.30 |
| SCUBE1 | -0.23 | -0.18 |
| RPL31 | -0.23 | -0.34 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 14667819 | |
| 去:0005524 | ATP结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0004674 | 蛋白质的丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | 助教 | 9812991 | |
| 去:0016740 | 转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016301 | 激酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030145 | 锰离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006468 | 蛋白质磷酸化氨基酸 | 助教 | 9812991 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 助教 | 9812991 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| SHETH肝癌VS TXNIP PAM4损失 | 261年 | 153年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER PBL肾移植好的VS捐赠 | 151年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONOME卵巢癌生存最佳减积 | 246年 | 152年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布卢姆SALIRASIB反应 | 245年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究包括 | 420年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆EZH2的目标了 | 295年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VANOEVELEN肌发生SIN3A目标 | 220年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-15/16/195/424/497 | 152年 | 158年 | m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| mir - 182 | 370年 | 377年 | 1、m8 | hsa - mir - 182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
| mir - 96 | 371年 | 377年 | 1 | hsa - mir - 96大脑 | UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC |