概括
基因 886
象征 CCKAR
同义词 cck-a | cck1-r | cck1r | cckra
描述 胆囊动蛋白A受体
参考 MIM:118444|HGNC:HGNC:1570|ENSEMBL:ENSG00000163394|HPRD:00322|Vega:Otthumg00000128567
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P15.2
Pascal P值 0.069
胎儿β -0.105
DMG 1(#研究)
主持人 伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18636319 4 26492206 CCKAR 3.723E-4 -0.444 0.043 DMG:Wockner_2014
CG08845028 4 26491963 CCKAR 5.114E-4 -0.433 0.047 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PRC1 0.96 0.75
Zwint 0.96 0.78
奥卡 0.95 0.69
NUSAP1 0.95 0.59
kif4a 0.95 0.62
bub1 0.95 0.59
CCNB2 0.95 0.53
Birc5 0.94 0.55
RAD51 0.94 0.63
kif2c 0.94 0.57
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.44 -0.61
AF347015.8 -0.44 -0.63
AF347015.15 -0.44 -0.63
mt-cyb -0.44 -0.61
AF347015.31 -0.44 -0.59
AF347015.33 -0.44 -0.60
MT-CO2 -0.43 -0.59
AF347015.2 -0.43 -0.62
AF347015.26 -0.42 -0.62
AF347015.9 -0.40 -0.55

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0004951 胆囊动蛋白受体活性 塔斯 8343165
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007409 轴突发生 IEA 神经元,轴突,神经突(GO期限:12) -
去:0001764 神经元迁移 IEA 神经元(GO期限:8) -
去:0030900 前脑发展 IEA 大脑(GO期限:8) -
去:0007200 G蛋白信号传导,耦合到IP3第二信使(磷脂酶C激活) 塔斯 8343165
去:0007204 胞质钙离子浓度的升高 塔斯 8503909
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0007631 喂养行为 塔斯 8503909
去:0007586 消化 塔斯 8503909
去:0007584 对养分的反应 塔斯 8503909
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005886 质膜 塔斯 8343165
去:0005887 质膜的积分 塔斯 8343165

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg钙信号通路 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽配体结合受体 188 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha Q信号事件 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR配体结合 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell转移DN 24 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑中的Smid乳腺癌复发 39 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因