基因页：synj1

Summary？
GeneID 8867
Symbol synj1
同义词 inpp5g | park20
描述 Synaptojanin 1
参考 MIM：604297|HGNC：HGNC：11503|Ensembl：ENSG00000159082|HPRD：09182|Vega：Otthumg0000000064926
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.2
Pascal P值 0.203
胎儿beta -1.577
支持 ENDOCYTOSIS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_CLATHRIN
G2Cdb.human_mGluR5
G2Cdb.human_Synaptosome
CompositeSet
Darnell FMRP目标
潜在的突触基因

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
PMID：COOCCUR 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 3
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献：0.2637

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003676 核酸结合 IEA -
去：0003723 RNA结合 IEA -
去：0004437 肌醇或磷脂酰肌醇磷酸酶活性 IEA -
去：0004439 phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity IEA -
去：0004445 肌醇 - 聚磷酸5-磷酸酶活性 tas 9428629
GO：0016787 水解酶活性 IEA -
GO:0017120 多磷酸肌醇磷酸酶活性 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0048489 突触囊泡运输 IEA 神经元，突触（GO期限：6） -
GO：0048488 突触囊泡内吞作用 tas 轴突，突触，神经递质（GO术语级别：7） 9428629
去：0006836 神经递质运输 IEA 神经元，神经递质（GO期限：5） -
去：0006796 磷酸盐代谢过程 tas 9428629
细胞成分 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005737 cytoplasm IEA -
去：0030117 膜外套 IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 ＃SZGR 2.0途径中的基因 信息
KEGG INOSITOL PHOSPHATE METABOLISM 54 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 76 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta ndkdynamin途径 21 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID EPHB FWD途径 40 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID ERBB1内部化途径 41 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组磷脂代谢 198 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
质膜上的PIP的反应组合成 31 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Pi代谢 48 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME METABOLISM OF LIPIDS AND LIPOPROTEINS 478 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Puiffe入侵被腹水DN抑制 145 91 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王顺铂反应和XPC DN 228 146 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARIADASON REGULATED BY HISTONE ACETYLATION UP 83 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染14小时 156 101 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 All SZGR 2.0 genes in this pathway
krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张乳腺癌祖细胞DN 145 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
陈代谢综合征网络 1210 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与宫颈 193 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC DN监管 253 192 All SZGR 2.0 genes in this pathway
尼尔森·盖斯特（Nielsen Gist） 98 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ceribelli基因不活跃，受NFY的约束 45 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节microRNA注释

miRNA family 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 1108 1114 M8 hsa-miR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
hsa-miR-107脑 agcagcauuguacggcuauca
mir-142-5p 2134 2141 1A，M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-148/152 99 106 1A，M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B UCAGUGCAACACACUUUUGU
HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B UCAGUGCAACACACUUUUGU
miR-15/16/195/424/497 1109 1115 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuugaa
HSA-MIR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
miR-153 1175 1181 1a HSA-MIR-153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
mir-190 2182 2188 M8 HSA-MIR-190 ugauuauguugauauauuaggu
MiR-200BC/429 1678 1685 1A，M8 hsa-miR-200b uaauacugccugguaaugaugac
hsa-miR-200c uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguaaaaAccgu
hsa-miR-200b uaauacugccugguaaugaugac
hsa-miR-200c uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguaaaaAccgu
mir-203.1 1652 1658 1a hsa-miR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-218 1471 1477 M8 hsa-miR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-23 1705年 1712 1A，M8 HSA-MIR-23A脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
miR-25/32/92/363/367 79 86 1A，M8 HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-323 1705年 1711年 1a HSA-MIR-323脑 GCACAUUACACGGUCGACCUCU
mir-34/449 1166 1173 1A，M8 hsa-miR-34a脑 uggcaguguuagcugguuguu
hsa-miR-34c Aggcaguguaguagcugauugc
hsa-miR-449 UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguagcuggc
miR-365 59 66 1A，M8 HSA-MIR-365 UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU
miR-378 1896年 1902年 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-448 1174 1181 1A，M8 hsa-miR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-9 392 399 1A，M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga