基因页：IER3

概括?
基因ID 8870
Symbol IER3
同义词 DIF-2|DIF2|GLY96|IEX-1|IEX-1L|IEX1|PRG1
描述 immediate early response 3
参考 MIM:602996|HGNC:HGNC:5392|ENSEMBL：ENSG00000137331|HPRD：04295|Vega:OTTHUMG00000031265
基因type protein-coding
地图位置 6p21.3
Pascal P值 1E-12
Sherlock P值 0.925
eGene 小脑半球
额叶皮质BA9
Nucleus accumbens basal ganglia
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 6
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg20178172 6 30711655 ier3; flot1 5.61E-6 0.524 0.011 DMG:Wockner_2014
cg04012931 6 30711164 ier3; flot1 1.412E-4 0.617 0.031 DMG:Wockner_2014
CG08384314 6 30711680 ier3; flot1 1.953E-4 0.563 0.035 DMG:Wockner_2014
cg13337949 6 30711586 ier3; flot1 3.68E-4 0.325 0.042 DMG:Wockner_2014
cg12232308 6 30711580 ier3; flot1 4.482E-4 0.314 0.045 DMG:Wockner_2014
CG09235583 6 30711141 ier3; flot1 4.486E-4 0.546 0.045 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs553106 chr11 82939896 IER3 8870 0.04 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
Hist1h2am 0.78 0.26
Hist1h2bf 0.74 0.30
HIST1H3H 0.74 0.28
SMCHD1 0.73 0.28
Hist1H2AD 0.73 0.27
HIST1H3D 0.70 0.34
Hist1h2ae 0.69 0.31
HIST2H2AC 0.69 0.19
Hist1H1E 0.68 0.06
Hist1h2bg 0.67 0.36
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
SLC9A3R2 -0.20 -0.14
ptprk -0.19 -0.15
TDRD10 -0.19 -0.17
CSGALNACT1 -0.19 -0.14
DOCK9 -0.19 -0.11
LGI4 -0.18 -0.12
KIF16B -0.18 -0.15
LSR -0.18 -0.14
ABCG2 -0.18 -0.11
KIAA1239 -0.18 -0.14

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0003674 molecular_function ND -
GO:0005515 protein binding 新闻学会 15451437
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0009653 anatomical structure morphogenesis 塔斯 9196025
去：0006916 anti-apoptosis NAS 9703517
去：0006916 anti-apoptosis 塔斯 9703517
去：0006915 apoptosis 塔斯 9196025
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005575 cellular_component ND -
GO:0016020 膜 IEA -
GO:0016021 integral to membrane IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRASOR TAMOXIFEN RESPONSE UP 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 6HR DN 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LIVE UP 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pramoonjago sox4靶向 52 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEURIG T细胞PROLYMPHOCYTIC低浓缩铀KEMIA UP 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES NTN1 TARGETS DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILBAN B CLL LPL DN 42 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION DN 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAGASHIMA NRG1 SIGNALING UP 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAGASHIMA EGF SIGNALING UP 58 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER LMP UP 265 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides cd4 up 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
geserick tert目标dn 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELYS THYROID CANCER UP 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA FOREVER DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LANDIS ERBB2 BREAST TUMORS 324 UP 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KERLEY RESPONSE TO CISPLATIN UP 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TOMIDA METASTASIS UP 26 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUELLER METHYLATED IN GLIOBLASTOMA 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTTA APOPTOSIS VIA NFKB 33 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射1的响应1 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
温曼对缺氧DN的适应 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONG INTERACT WITH PTTG1 57 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 40 HELA 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应60 MCF10A 39 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对雌二醇DN的反应 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO HYPOXIA UP 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Osawa TNF目标 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hemin的addya红斑分化 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Galindo对肠毒素的免疫反应 85 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NEMETH INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LENAOUR DENDRITIC CELL MATURATION DN 128 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THEILGAARD NEUTROPHIL AT SKIN WOUND UP 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weigel氧化应激反应 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
INGA TP53 TARGETS 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR UP 180 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD ADIPOGENESIS DN 64 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 2HR 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 1 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
safford t淋巴细胞厌食 87 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C3 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G2 30 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）的靶向对雌激素的反应 31 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER SILENCED BY METHYLATION UP 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION UP 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE UP 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG GLIOBLASTOMA PLASTICITY UP 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 125 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jiang Tip30目标 46 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在肿瘤血管生成期间沉默的Hellebrekers 80 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP 77 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园维甲酸的反应和PML RARA FUSION 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARK TRETINOIN RESPONSE AND RARA PLZF FUSION 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS FIBROBLAST UP 84 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hofmann骨髓发育异常综合症低风险DN 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hofmann骨髓发育异常综合征风险 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee SP4胸腺细胞 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
cro骨基质刺激 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST NRAS VS STROMAL STIMULATION DN 99 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G56 DN 17 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COULOUARN TEMPORAL TGFB1 SIGNATURE UP 109 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存 73 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG REGULATED BY MYC DN 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORN ADENOVIRUS INFECTION 12HR DN 33 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORN ADENOVIRUS INFECTION 24HR DN 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORN ADENOVIRUS INFECTION 32HR DN 39 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORN ADENOVIRUS INFECTION 48HR DN 40 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tian tnf信令不通过NFKB 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 5 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G28 20 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DASU IL6 SIGNALING UP 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
QI HYPOXIA 140 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU EZH2 TARGETS UP 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP A 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANDESLUIS COMMD1 TARGETS GROUP 3 UP 89 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 UP 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 TARGETS 1HR UP 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR UP 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF TARGETS UP 63 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 PARTIAL 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMIRNOV RESPONSE TO IR 2HR UP 53 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因