基因页面:SYNJ2

总结吗?
GeneID 8871年
象征 SYNJ2
同义词 INPP5H
描述 synaptojanin 2
参考 MIM: 609410|HGNC: HGNC: 11504|运用:ENSG00000078269|HPRD: 10259|织女:OTTHUMG00000015904
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 6 q25.3
帕斯卡假定值 0.35
胎儿β -2.158
DMG 2(#研究)
支持 内吞作用
G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Montano_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括172复制与精神分裂症之间的联系论文认定。 3
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 3

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg03940776 6 158490013 SYNJ2 2.4的军医 -0.005 0.167 DMG: Montano_2016
cg06327227 6 158439902 SYNJ2 2.112的军医 -0.466 0.035 DMG: Wockner_2014
cg12784241 6 158402508 SYNJ2 4.494的军医 -0.279 0.045 DMG: Wockner_2014


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
TRIM28 0.95 0.94
HNRNPA0 0.93 0.90
SMARCB1 0.93 0.91
HNRNPM 0.93 0.86
HNRNPL 0.93 0.92
DBN1 0.93 0.91
CENPV 0.93 0.93
DDX39 0.92 0.90
PPP4C 0.92 0.92
RBM4 0.92 0.91
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.71 -0.76
AF347015.27 -0.70 -0.88
AF347015.33 -0.69 -0.88
C5orf53 -0.69 -0.73
AF347015.31 -0.69 -0.86
MT-CO2 -0.68 -0.87
AIFM3 -0.68 -0.75
MT-CYB -0.68 -0.88
S100B -0.67 -0.80
AF347015.8 -0.66 -0.88

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003723 核糖核酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0004437 肌醇磷脂酰肌醇或磷酸酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0004439 phosphatidylinositol-4, 5-bisphosphate 5-phosphatase活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0016787 水解酶活性 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG磷酸肌醇代谢 54 42 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG磷脂酰肌醇信号系统 76年 56 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA NDKDYNAMIN通路 21 15 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME磷脂代谢 198年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME pip值在质膜上的综合 31日 23 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOMEπ新陈代谢 48 34 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME代谢脂质和脂蛋白 478年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
钟阿扎胞苷和TSA 183年 119年 所有SZGR 2.0基因通路
HUTTMANN B CLL穷人生存DN 60 39 所有SZGR 2.0基因通路
武田的目标NUP98 HOXA9融合16 d DN 143年 83年 所有SZGR 2.0基因通路
MULLIGHAN NPM1突变签名2 DN 77年 46 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1目标了 214年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日WT1目标8小时 164年 122年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN 805年 505年 所有SZGR 2.0基因通路
CONCANNON EPOXOMICIN了细胞凋亡 239年 157年 所有SZGR 2.0基因通路
佩雷斯TP63目标 355年 243年 所有SZGR 2.0基因通路
滑落紫外线反应通过ERCC3运输大亨DN 84年 63年 所有SZGR 2.0基因通路
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 855年 609年 所有SZGR 2.0基因通路
阿斯顿重度抑郁症DN 160年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染14小时血巨细胞病毒DN 298年 200年 所有SZGR 2.0基因通路
MAHAJAN应对IL1A DN 76年 57 所有SZGR 2.0基因通路
SARTIPY正常胰岛素抵抗 34 27 所有SZGR 2.0基因通路
佐藤在胰腺癌1被甲基化 419年 273年 所有SZGR 2.0基因通路
CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 720年 440年 所有SZGR 2.0基因通路
CREIGHTON内分泌治疗抵抗5 482年 296年 所有SZGR 2.0基因通路
马森受FOXP3刺激 1022年 619年 所有SZGR 2.0基因通路
汉SATB1目标了 395年 249年 所有SZGR 2.0基因通路
BOYAULT肝癌子类G12 39 17 所有SZGR 2.0基因通路
蒋介石肝癌子类扩散 178年 108年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP 718年 401年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森人大与H3K4ME3 ICP 445年 257年 所有SZGR 2.0基因通路
国外RB1目标衰老 572年 352年 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG类1引起的暂时性的EGF 516年 308年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-1/206 551年 557年 m8 hsa-miR-1 UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA
hsa - mir - 206深圳 UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
hsa - mir - 613 AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC