基因页:EIF2B5
概括?
基因 | 8893 |
象征 | EIF2B5 |
同义词 | cach | cle | eif-2b | eif2bepsilon | lvwm |
描述 | 真核翻译起始因子2B亚基epsilon |
参考 | MIM:603945|HGNC:HGNC:3261|ENSEMBL:ENSG00000145191|HPRD:04898|Vega:Otthumg00000156840 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q27.1 |
Pascal P值 | 0.276 |
Sherlock P值 | 0.855 |
胎儿β | 0.133 |
DMG | 2(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25739137 | 3 | 183851986 | EIF2B5 | 6.05e-6 | -0.357 | 0.011 | DMG:Wockner_2014 |
CG18313702 | 3 | 183853126 | EIF2B5 | 4.02E-8 | -0.008 | 1.13e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EIF2B5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005085 | 鸟苷核苷酸交换因子活性 | 艾达 | 11323413 | |
去:0005085 | 鸟苷核苷酸交换因子活性 | 小鬼 | 15054402 | |
去:0005085 | 鸟苷核苷酸交换因子活性 | ISS | - | |
去:0003743 | 翻译引发因子活动 | 艾达 | 16289705 | |
去:0003743 | 翻译引发因子活动 | nas | 8688466 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15060152 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | ISS | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008415 | 酰基转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0014003 | 少突胶质细胞开发 | 小鬼 | 轴突,少突胶质细胞,神经胶质(GO期限:10) | 15217090 |
GO:0014002 | 星形胶质细胞开发 | 小鬼 | 神经元,星形胶质细胞,胶质(GO术语级别:10) | 15723074 |
GO:0042552 | 髓鞘 | 小鬼 | 神经元,轴突,大脑,少突胶质细胞(GO术语级别:13) | 14566705|15723074 |
去:0001541 | 卵巢卵泡发育 | 小鬼 | 15507143 | |
去:0009408 | 对热的反应 | 小鬼 | 15723074 | |
去:0009408 | 对热的反应 | ISS | - | |
去:0009408 | 对热的反应 | 塔斯 | 12499492 | |
去:0009749 | 对葡萄糖刺激的反应 | ISS | - | |
GO:0043434 | 对肽激素刺激的反应 | ISS | - | |
GO:0045948 | 转化启动的积极调节 | ISS | - | |
GO:0051716 | 细胞对刺激的反应 | 艾达 | 8626696 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005851 | 真核翻译起始因子2B复合物 | 艾达 | 11323413|15060152 | |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 11323413 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta EIF2途径 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta IGF1MTOR途径 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta VEGF途径 | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome翻译 | 222 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Slebos头和颈癌与HPV | 84 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌LMP | 265 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李小脑老化 | 84 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应14 | 143 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
MiR-200BC/429 | 136 | 142 | M8 | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu |