概括
基因 8893
象征 EIF2B5
同义词 cach | cle | eif-2b | eif2bepsilon | lvwm
描述 真核翻译起始因子2B亚基epsilon
参考 MIM:603945|HGNC:HGNC:3261|ENSEMBL:ENSG00000145191|HPRD:04898|Vega:Otthumg00000156840
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q27.1
Pascal P值 0.276
Sherlock P值 0.855
胎儿β 0.133
DMG 2(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25739137 3 183851986 EIF2B5 6.05e-6 -0.357 0.011 DMG:Wockner_2014
CG18313702 3 183853126 EIF2B5 4.02E-8 -0.008 1.13e-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005085 鸟苷核苷酸交换因子活性 艾达 11323413
去:0005085 鸟苷核苷酸交换因子活性 小鬼 15054402
去:0005085 鸟苷核苷酸交换因子活性 ISS -
去:0003743 翻译引发因子活动 艾达 16289705
去:0003743 翻译引发因子活动 nas 8688466
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15060152
去:0005515 蛋白质结合 ISS -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008415 酰基转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0014003 少突胶质细胞开发 小鬼 轴突,少突胶质细胞,神经胶质(GO期限:10) 15217090
GO:0014002 星形胶质细胞开发 小鬼 神经元,星形胶质细胞,胶质(GO术语级别:10) 15723074
GO:0042552 髓鞘 小鬼 神经元,轴突,大脑,少突胶质细胞(GO术语级别:13) 14566705|15723074
去:0001541 卵巢卵泡发育 小鬼 15507143
去:0009408 对热的反应 小鬼 15723074
去:0009408 对热的反应 ISS -
去:0009408 对热的反应 塔斯 12499492
去:0009749 对葡萄糖刺激的反应 ISS -
GO:0043434 对肽激素刺激的反应 ISS -
GO:0045948 转化启动的积极调节 ISS -
GO:0051716 细胞对刺激的反应 艾达 8626696
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005851 真核翻译起始因子2B复合物 艾达 11323413|15060152
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 艾达 11323413

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta EIF2途径 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IGF1MTOR途径 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta VEGF途径 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome翻译 222 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Slebos头和颈癌与HPV 84 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP 265 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李小脑老化 84 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 118 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应14 143 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
MiR-200BC/429 136 142 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu