基因页：PRPF4B

Summary？
基因 8899
象征 PRPF4B
同义词 pr4h | prp4 | prp4h | prp4k | dj1013a10.1
描述 前MRNA处理因子4B
参考 MIM：602338|HGNC:HGNC:17346|ENSEMBL：ENSG00000112739|HPRD：09087|Vega：Otthumg0000000014157
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p25.2
Pascal P值 0.02
Sherlock P值 0.358

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0159

教派ion I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共同表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HSDL1 0.96 0.91
CTTNBP2NL 0.95 0.90
CD24 0.95 0.89
WDR40A 0.95 0.93
C2orf44 0.94 0.91
GNG2 0.94 0.91
KBTBD6 0.94 0.90
被杀2 0.94 0.91
阿克利 0.94 0.90
RBM12 0.94 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.74 -0.78
HLA-F -0.71 -0.75
AIFM3 -0.69 -0.72
AF347015.27 -0.69 -0.84
FBXO2 -0.69 -0.66
MT-CO2 -0.68 -0.85
AF347015.31 -0.68 -0.83
S100B -0.68 -0.77
AF347015.33 -0.67 -0.82
FXYD1 -0.67 -0.82

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 15452250|16169070|17513757
|17620599
去：0005524 ATP结合 IEA -
去：0004672 蛋白激酶活性 IEA -
去：0004674 protein serine/threonine kinase activity IEA -
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去：0006397 mRNA处理 IEA -
去：0008380 RNA剪接 tas 9102632
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 tas 9102632
细胞成分 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -
去：0005681 剪接体 IEA -
去：0005694 chromosome IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃SZGR 2.0途径中的基因 信息
Onken紫veal黑色素瘤 783 507 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 All SZGR 2.0 genes in this pathway
thum收缩性心力衰竭 423 283 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Elvidge缺氧DN 146 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Choi ATL阶段预测变量 44 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Akt1 48hr DN诱导的XU HGF目标 27 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dauer Stat3靶向DN 50 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SAKAI TUMOR INFILTRATING MONOCYTES DN 81 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gottwein的KSHV Mir K12 11 63 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
布朗HCMV感染20小时 240 152 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 All SZGR 2.0 genes in this pathway
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血祖先祖先 544 307 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JI对FSH DN的响应 58 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染14小时 156 101 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林黑色素瘤复制号码 73 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Finetti乳腺癌Kinome Grey 15 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kras Pten DN的Iwanaga癌变 353 226 All SZGR 2.0 genes in this pathway
p210 bcr abl融合的射线靶 18 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标36小时DN 185 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G1 UP 113 70 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lu ezh2靶向DN 414 237 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2靶向DN 882 538 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA绑定8D 882 506 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 752 758 M8 hsa-miR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-103/107 2261 2268 1A，M8 hsa-miR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
hsa-miR-107脑 agcagcauuguacggcuauca
mir-132/212 4192 4198 M8 HSA-MIR-212SZ uaacagucuccagucacggcc
HSA-MIR-132脑 UAACAGUCUACAGCCAUGGUCG
miR-138 1660年 1666年 M8 HSA-MIR-138脑 agcugguugugaauc
mir-139 196 203 1A，M8 HSA-MIR-139脑 ucuacagugcAcgugucu
mir-142-5p 799 806 1A，M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-146 1244 1250 1a HSA-MIR-146A ugagaacugaauuccaugggug
HSA-MIR-146B脑 ugagaacugaauuccauaggcu
HSA-MIR-146A ugagaacugaauuccaugggug
HSA-MIR-146B脑 ugagaacugaauuccauaggcu
mir-182 214 220 M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucacaca
mir-186 1093 1099 1a HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-21 533 539 1a HSA-MIR-21脑 UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA
hsa-miR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-224 1140 1146 M8 hsa-miR-224 caagucacuagugucuuccuuua
mir-23 1137 1143 M8 HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-299-5p 538 544 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-323 1137 1143 1a HSA-MIR-323脑 GCACAUUACGGUCGACCUCU
mir-329 398 404 M8 HSA-MIR-329脑 aacacaccugguaaccucuuu
mir-335 1053 1059 1a HSA-MIR-335脑 ucaagagcaauaacgaaaaauaugu
miR-375 1058 1064 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
miR-377 630 636 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggcaacuuuugu
miR-494 1552 1558 M8 HSA-MIR-494脑 ugaaacauacgggaaaccucuu
miR-495 812 818 1a HSA-MIR-495脑 aaacaaacauggugcacuucuuu
mir-539 1565 1571 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu