概括
基因 8913
象征 cacna1g
同义词 Ca(V)T.1 | Cav3.1 | NBR13 | SCA42
描述 钙电压门控通道亚基Alpha1 g
参考 MIM:604065|HGNC:HGNC:1394|ENSEMBL:ENSG00000006283|HPRD:04961|Vega:Otthumg00000162180
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q22
Pascal P值 0.007
主持人 小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2003180 CHR3 87169338 cacna1g 8913 0.12 反式
RS1012411 CHR6 30332554 cacna1g 8913 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
VIPR1 0.80 0.75
TMEM38A 0.80 0.75
kcnip3 0.79 0.72
C1orf183 0.79 0.76
OLFM1 0.79 0.79
SLC30A3 0.79 0.77
STX1A 0.79 0.68
RHEBL1 0.79 0.76
mical2 0.79 0.70
NOS2 0.79 0.67
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GPR125 -0.47 -0.50
SH2D2A -0.46 -0.60
KIAA1949 -0.45 -0.48
pde9a -0.45 -0.60
tubb2b -0.44 -0.54
Bcl7c -0.44 -0.55
traf4 -0.44 -0.55
carhsp1 -0.44 -0.56
SEMA4B -0.43 -0.53
C14orf93 -0.43 -0.56

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg钙信号通路 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG II型糖尿病 47 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Beta Catenin nuc途径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM1相互作用 39 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM信号传导,用于神经突的生长 64 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 6hr DN的Takeda目标 41 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlesinger甲基化的癌症 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 83 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增 94 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 2 50 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sato被胰腺癌中的脱乙酰化沉默 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 109 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 102 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Asgharzadeh神经母细胞瘤生存率差DN 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向DN 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
基础质量靶标 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因