基因页:cacna1g
概括?
基因 | 8913 |
象征 | cacna1g |
同义词 | Ca(V)T.1 | Cav3.1 | NBR13 | SCA42 |
描述 | 钙电压门控通道亚基Alpha1 g |
参考 | MIM:604065|HGNC:HGNC:1394|ENSEMBL:ENSG00000006283|HPRD:04961|Vega:Otthumg00000162180 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q22 |
Pascal P值 | 0.007 |
主持人 | 小脑半球 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2003180 | CHR3 | 87169338 | cacna1g | 8913 | 0.12 | 反式 | ||
RS1012411 | CHR6 | 30332554 | cacna1g | 8913 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CACNA1G_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
VIPR1 | 0.80 | 0.75 |
TMEM38A | 0.80 | 0.75 |
kcnip3 | 0.79 | 0.72 |
C1orf183 | 0.79 | 0.76 |
OLFM1 | 0.79 | 0.79 |
SLC30A3 | 0.79 | 0.77 |
STX1A | 0.79 | 0.68 |
RHEBL1 | 0.79 | 0.76 |
mical2 | 0.79 | 0.70 |
NOS2 | 0.79 | 0.67 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GPR125 | -0.47 | -0.50 |
SH2D2A | -0.46 | -0.60 |
KIAA1949 | -0.45 | -0.48 |
pde9a | -0.45 | -0.60 |
tubb2b | -0.44 | -0.54 |
Bcl7c | -0.44 | -0.55 |
traf4 | -0.44 | -0.55 |
carhsp1 | -0.44 | -0.56 |
SEMA4B | -0.43 | -0.53 |
C14orf93 | -0.43 | -0.56 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG II型糖尿病 | 47 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Beta Catenin nuc途径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NCAM1相互作用 | 39 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NCAM信号传导,用于神经突的生长 | 64 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 6hr DN的Takeda目标 | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlesinger甲基化的癌症 | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PTCH1和SUFU DN的Lee目标 | 83 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增 | 94 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 2 | 50 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sato被胰腺癌中的脱乙酰化沉默 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 | 109 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Asgharzadeh神经母细胞瘤生存率差DN | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向DN | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
基础质量靶标 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |