概括
基因 8926
象征 鼻烟
同义词 -
描述 SNRPN上游阅读框架
参考 HGNC:HGNC:11171|HPRD:18083|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q12
Pascal P值 0.239
Sherlock P值 0.496
胎儿β -0.92
主持人 尾状基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2105242 CHR1 163568328 鼻烟 8926 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NRGN 0.66 0.62
itpka 0.60 0.60
CAMK1 0.59 0.53
necab3 0.59 0.47
CCDC85B 0.57 0.60
OCEL1 0.57 0.56
kremen2 0.57 0.61
cacna1f 0.57 0.60
抓牢 0.56 0.62
FAM131A 0.56 0.51
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF766 -0.42 -0.48
ZNF345 -0.42 -0.48
tubb2b -0.42 -0.45
Znf3 -0.41 -0.45
UPF3B -0.41 -0.54
thoc2 -0.41 -0.51
Tigd1 -0.41 -0.45
ZNF311 -0.41 -0.43
CCDC123 -0.41 -0.43
AC004017.1 -0.41 -0.43

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID AR途径 61 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein本地化到近端树突 37 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller Plurinet 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAO AOX4靶向皮肤DN 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Brideau印迹基因 63 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因