基因页:鼻烟
概括?
基因 | 8926 |
象征 | 鼻烟 |
同义词 | - |
描述 | SNRPN上游阅读框架 |
参考 | HGNC:HGNC:11171|HPRD:18083| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q12 |
Pascal P值 | 0.239 |
Sherlock P值 | 0.496 |
胎儿β | -0.92 |
主持人 | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2105242 | CHR1 | 163568328 | 鼻烟 | 8926 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NRGN | 0.66 | 0.62 |
itpka | 0.60 | 0.60 |
CAMK1 | 0.59 | 0.53 |
necab3 | 0.59 | 0.47 |
CCDC85B | 0.57 | 0.60 |
OCEL1 | 0.57 | 0.56 |
kremen2 | 0.57 | 0.61 |
cacna1f | 0.57 | 0.60 |
抓牢 | 0.56 | 0.62 |
FAM131A | 0.56 | 0.51 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF766 | -0.42 | -0.48 |
ZNF345 | -0.42 | -0.48 |
tubb2b | -0.42 | -0.45 |
Znf3 | -0.41 | -0.45 |
UPF3B | -0.41 | -0.54 |
thoc2 | -0.41 | -0.51 |
Tigd1 | -0.41 | -0.45 |
ZNF311 | -0.41 | -0.43 |
CCDC123 | -0.41 | -0.43 |
AC004017.1 | -0.41 | -0.43 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID AR途径 | 61 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1目标 | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein本地化到近端树突 | 37 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TERAO AOX4靶向皮肤DN | 27 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Brideau印迹基因 | 63 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |