概括
基因 8932
象征 MBD2
同义词 DMTase | NY-CO-41
描述 甲基-CPG结合结构域蛋白2
参考 MIM:603547|HGNC:HGNC:6917|ENSEMBL:ENSG00000134046|HPRD:04647|Vega:Otthumg00000132705
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18Q21
Pascal P值 0.351
胎儿β -0.554
支持 染色质重塑基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FRZB 0.55 0.50
GDF10 0.55 0.55
GLT8D2 0.54 0.53
HCRTR1 0.51 0.49
TM6SF1 0.51 0.41
CYP1A1 0.50 0.51
TFR2 0.49 0.50
OR2W3 0.48 0.43
AC132186.2 0.48 0.49
CCDC3 0.47 0.44
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C11orf67 -0.23 -0.22
CHMP4A -0.23 -0.23
nkapl -0.22 -0.20
AF347015.21 -0.22 -0.17
MT-ATP8 -0.22 -0.14
Anp32b -0.22 -0.22
AF347015.27 -0.22 -0.16
SAP30 -0.22 -0.23
AIF1L -0.22 -0.20
AF347015.18 -0.22 -0.15

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CHD3 Mi-2a |mi2-alpha |ZFH 染色体群酶DNA结合蛋白3 重构的复合物 Biogrid 10444591
克雷布 CBP |kat3a |RST CREB结合蛋白 - HPRD 12665568
DHX9 ddx9 |LKP |ndhii |RHA DEAH(ASP-GLU-ALA-HIS)盒多肽9 - HPRD,Biogrid 12665568
DNMT1 目标|CXXC9 |DNMT |FLJ16293 |MCMT |MGC104992 DNA(胞嘧啶-5-) - 甲基转移酶1 - HPRD 10947852
gatad2a FLJ20085 |FLJ21017 |p66alpha 含有2A的GATA锌指域 - HPRD,Biogrid 12183469
gatad2b FLJ37346 |KIAA1150 |MGC138257 |MGC138285 |p66beta |RP11-216N14.6 含有2B的GATA锌指域 - HPRD,Biogrid 11756549|12183469
GPN1 atpbd1a |mbdin |NTPBP |xab1 GPN环GTPase 1 - HPRD,Biogrid 12588985
HDAC1 DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 组蛋白脱乙酰基酶1 - HPRD,Biogrid 10471499
HDAC2 RPD3 |yaf1 组蛋白脱乙酰基酶2 - HPRD,Biogrid 10471499
MBD2 DKFZP586O0821 |DMTase |NY-CO-41 甲基-CPG结合结构域蛋白2 - HPRD 10947852
MBD3 - 甲基-CPG结合结构域蛋白3 - HPRD 10947852
MBD3 - 甲基-CPG结合结构域蛋白3 重构的复合物
两个杂交
Biogrid 10444591|15456747
MBD3L1 MBD3L |MGC138263 |MGC138269 甲基-CPG结合结构域蛋白3样1 - HPRD,Biogrid 15456747
mizf DKFZP434F162 |hinf-p |ZNF743 MBD2相互作用的锌指 - HPRD,Biogrid 115536​​31
MTA2 DKFZP686F2281 |mta1l1 |pid 转移相关的1个家庭,成员2 重构的复合物 Biogrid 10444591
RBBP4 NURF55 |RBAP48 视网膜母细胞瘤结合蛋白4 - HPRD,Biogrid 10471499
sin3a DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) 重构的复合物
两个杂交
Biogrid 10950960


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID HDAC Classi途径 66 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I转录 89 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I启动子开口 62 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 201 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
科科拉畸胎瘤 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牛津·拉拉(Oxford Rala)和拉尔布(Ralb)的目标 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤LB 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移DN 81 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦响应集群D3 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller Plurinet 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应 87 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin的反应 90 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APC和MBD2 DN的Phesse目标 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡mir302a目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1 DN的Juban目标 92 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因