基因页:MBD2
概括?
基因 | 8932 |
象征 | MBD2 |
同义词 | DMTase | NY-CO-41 |
描述 | 甲基-CPG结合结构域蛋白2 |
参考 | MIM:603547|HGNC:HGNC:6917|ENSEMBL:ENSG00000134046|HPRD:04647|Vega:Otthumg00000132705 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q21 |
Pascal P值 | 0.351 |
胎儿β | -0.554 |
支持 | 染色质重塑基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MBD2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FRZB | 0.55 | 0.50 |
GDF10 | 0.55 | 0.55 |
GLT8D2 | 0.54 | 0.53 |
HCRTR1 | 0.51 | 0.49 |
TM6SF1 | 0.51 | 0.41 |
CYP1A1 | 0.50 | 0.51 |
TFR2 | 0.49 | 0.50 |
OR2W3 | 0.48 | 0.43 |
AC132186.2 | 0.48 | 0.49 |
CCDC3 | 0.47 | 0.44 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C11orf67 | -0.23 | -0.22 |
CHMP4A | -0.23 | -0.23 |
nkapl | -0.22 | -0.20 |
AF347015.21 | -0.22 | -0.17 |
MT-ATP8 | -0.22 | -0.14 |
Anp32b | -0.22 | -0.22 |
AF347015.27 | -0.22 | -0.16 |
SAP30 | -0.22 | -0.23 |
AIF1L | -0.22 | -0.20 |
AF347015.18 | -0.22 | -0.15 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CHD3 | Mi-2a |mi2-alpha |ZFH | 染色体群酶DNA结合蛋白3 | 重构的复合物 | Biogrid | 10444591 |
克雷布 | CBP |kat3a |RST | CREB结合蛋白 | - | HPRD | 12665568 |
DHX9 | ddx9 |LKP |ndhii |RHA | DEAH(ASP-GLU-ALA-HIS)盒多肽9 | - | HPRD,Biogrid | 12665568 |
DNMT1 | 目标|CXXC9 |DNMT |FLJ16293 |MCMT |MGC104992 | DNA(胞嘧啶-5-) - 甲基转移酶1 | - | HPRD | 10947852 |
gatad2a | FLJ20085 |FLJ21017 |p66alpha | 含有2A的GATA锌指域 | - | HPRD,Biogrid | 12183469 |
gatad2b | FLJ37346 |KIAA1150 |MGC138257 |MGC138285 |p66beta |RP11-216N14.6 | 含有2B的GATA锌指域 | - | HPRD,Biogrid | 11756549|12183469 |
GPN1 | atpbd1a |mbdin |NTPBP |xab1 | GPN环GTPase 1 | - | HPRD,Biogrid | 12588985 |
HDAC1 | DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰基酶1 | - | HPRD,Biogrid | 10471499 |
HDAC2 | RPD3 |yaf1 | 组蛋白脱乙酰基酶2 | - | HPRD,Biogrid | 10471499 |
MBD2 | DKFZP586O0821 |DMTase |NY-CO-41 | 甲基-CPG结合结构域蛋白2 | - | HPRD | 10947852 |
MBD3 | - | 甲基-CPG结合结构域蛋白3 | - | HPRD | 10947852 |
MBD3 | - | 甲基-CPG结合结构域蛋白3 | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 10444591|15456747 |
MBD3L1 | MBD3L |MGC138263 |MGC138269 | 甲基-CPG结合结构域蛋白3样1 | - | HPRD,Biogrid | 15456747 |
mizf | DKFZP434F162 |hinf-p |ZNF743 | MBD2相互作用的锌指 | - | HPRD,Biogrid | 11553631 |
MTA2 | DKFZP686F2281 |mta1l1 |pid | 转移相关的1个家庭,成员2 | 重构的复合物 | Biogrid | 10444591 |
RBBP4 | NURF55 |RBAP48 | 视网膜母细胞瘤结合蛋白4 | - | HPRD,Biogrid | 10471499 |
sin3a | DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 | SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 10950960 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID HDAC Classi途径 | 66 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I转录 | 89 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RNA Pol I启动子开口 | 62 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
科科拉畸胎瘤 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牛津·拉拉(Oxford Rala)和拉尔布(Ralb)的目标 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard粉碎和燃烧突变体DN | 185 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤LB | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦响应集群D3 | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujii YBX1靶向 | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应 | 87 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson对Forskolin的反应 | 90 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
APC和MBD2 DN的Phesse目标 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卡mir302a目标 | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPI1和FLI1 DN的Juban目标 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |