基因页面:CDK5R2

总结吗?
GeneID 8941年
象征 CDK5R2
同义词 NCK5AI | P39 | p39nck5ai
描述 细胞周期蛋白依赖性激酶5,调节亚基2 (p39)
参考 MIM: 603764|HGNC: HGNC: 1776|运用:ENSG00000171450|HPRD: 04790|织女:OTTHUMG00000133083
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 2 q35
帕斯卡假定值 0.131
胎儿β -1.785
DMG 1(#研究)
支持 CompositeSet
达内尔FMRP目标

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) Psr: 0.00916
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) Psr: 0.01016

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg16673768 2 219828170 CDK5R2 5.48 e-9 -0.009 3.02 e-6 DMG: Jaffe_2016


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
ANAPC1 0.89 0.88
UGCG 0.88 0.88
ARMC8 0.88 0.84
斯塔姆 0.88 0.83
PSMD5 0.88 0.86
LMBR1 0.87 0.88
KIAA1012 0.87 0.85
AKAP10 0.87 0.87
KIAA1468 0.87 0.88
TMEM184C 0.87 0.84
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.75 -0.64
AF347015.21 -0.75 -0.64
AF347015.8 -0.73 -0.64
HIGD1B -0.73 -0.66
AF347015.2 -0.72 -0.60
AF347015.31 -0.72 -0.62
MT-CYB -0.71 -0.60
AC098691.2 -0.70 -0.69
AF347015.18 -0.70 -0.64
AF347015.33 -0.70 -0.59

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016534 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶- 5催化剂活性 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000079 调节细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶活性 助教 7592934
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016533 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶- 5催化剂复杂 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
PID LIS1通路 28 22 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652年 1023年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH速度的目标 1062年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH PRC2目标 652年 441年 所有SZGR 2.0基因通路
RIZKI肿瘤侵袭性的3 d 210年 124年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 349年 234年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 210年 148年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 590年 403年 所有SZGR 2.0基因通路
马顿斯维甲酸反应了 857年 456年 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 1725年 838年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 133 61年 67年 m8 hsa - mir - 133 a UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU
hsa - mir - 133 b UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA
mir - 331 137年 143年 1 hsa - mir - 331大脑 GCCCCUGGGCCUAUCCUAGAA
mir - 96 1142年 1148年 m8 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC