Gene Page:BTRC
概括?
基因 | 8945 |
象征 | BTRC |
Synonyms | BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP |
Description | 含有E3泛素蛋白连接酶的β-透明蛋白重复 |
参考 | MIM:603482|HGNC:HGNC:1144|Ensembl:ENSG00000166167|HPRD:04596|Vega:OTTHUMG00000018932 |
Gene type | protein-coding |
Map location | 10q24.32 |
Pascal p-value | 0.006 |
Sherlock P值 | 0.11 |
eGene | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
Gene set name | Method of gene set | Description | Info |
---|---|---|---|
CV:PGCnp | Genome-wide Association Study | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
eQTL annotation
SNP ID | Chromosome | Position | eGene | Gene Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS distance | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs2209358 | chr1 | 157274426 | BTRC | 8945 | 0.15 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BTRC | BETA-TRCP | FBW1A | FBXW1 | FBXW1A | FWD1 | MGC4643 | bTrCP | bTrCP1 | betaTrCP | beta-transducin repeat containing | Affinity Capture-Western | BioGRID | 10644755 |
CD4 | CD4mut | CD4molecule | - | HPRD,BioGRID | 9660940 |
CDC25A | CDC25A2 | cell division cycle 25 homolog A (S. pombe) | - | HPRD | 14603323 |
CDC34 | E2-CDC34 |UBC3 |ube2r1 | cell division cycle 34 homolog (S. cerevisiae) | Biochemical Activity Reconstituted Complex |
BioGRID | 10531035|12037680 |
楚克 | IKBKA | IKK-alpha | IKK1 | IKKA | NFKBIKA | TCF16 | 保守的螺旋环螺旋无处不在激酶 | I-kappa-B-alpha interacts with beta-TrCP. | BIND | 15994554 |
CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | catenin (cadherin-associated protein), beta 1, 88kDa | - | HPRD | 11818547|12114015 |
CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | catenin (cadherin-associated protein), beta 1, 88kDa | BTRC(beta-trcp1)与CTNNB1(β-catenin)相互作用。 | BIND | 15735746 |
CUL1 | MGC149834 | MGC149835 | 卡林1 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 10531035|10644755 |12609982 |
DLG1 | DKFZp761P0818 | DKFZp781B0426 | DLGH1 | SAP97 | dJ1061C18.1.1 | hdlg | 圆盘,大型同源物1(果蝇) | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 12902344 |
DLGAP5 | DLG1 |DLG7 |hurp |KIAA0008 | discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 5 | - | HPRD | 12902344 |
E2F4 | E2F-4 | E2F转录因子4,P107/P130结合 | E2F4interacts with BTRC promoter. | BIND | 15782160 |
FBXW11 | btrc2 |BTRCP2 |fbw1b |fbxw1b |FBW11 |hos |KIAA0696 | F-box和WD重复域包含11 | - | HPRD,BioGRID | 10644755 |
IKBKB | FLJ40509 |ikk-beta |ikk2 |ikkb |MGC131801 |nfkbikb | B细胞,激酶β的Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11158290 |
JUP | ARVD12 | CTNNG | DP3 | DPIII | PDGB | PKGB | 交界处Plakoglobin | - | HPRD,BioGRID | 10803460 |
NFKB1 | DKFZP686C01211 |EBP-1 |kbf1 |MGC54151 |nf-kappa-b |NFKB-P105 |NFKB-P50 |P105 | nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11158290 |
NFKB2 | LYT-10 | LYT10 | B细胞2(P49/P100)中Kappa光多肽基因增强子的核因子 | - | HPRD,BioGRID | 11994270 |
NFKBIA | ikba |Mad-3 |nfkbi | B细胞抑制剂Alpha中Kappa光多肽基因增强子的核因子 | - | HPRD,BioGRID | 9990853 |
NFKBIA | ikba |Mad-3 |nfkbi | B细胞抑制剂Alpha中Kappa光多肽基因增强子的核因子 | h-beta-TrCP interacts with and promotes ubiquitination of phosphorylated I-kappa-B-alpha. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human beta-TrCP (h-beta-TrCP) and I-kappa-B-alpha from an unspecified species. | BIND | 9990853 |
nfkbib | IKBB | TRIP9 | B细胞抑制剂Beta中Kappa光多肽基因增强子的核因子 | - | HPRD,BioGRID | 10514424 |
RELA | MGC131774 | NFKB3 | p65 | v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian) | - | HPRD,BioGRID | 9990853 |
SKP1 | EMC19 | MGC34403 | OCP-II | OCP2 | SKP1A | TCEB1L | p19A | S-phase kinase-associated protein 1 | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex 两个杂交 |
BioGRID | 9660940|10531035 |10644755|10918611 |12609982 |
SKP1 | EMC19 | MGC34403 | OCP-II | OCP2 | SKP1A | TCEB1L | p19A | S-phase kinase-associated protein 1 | SKP1与FBW1A相互作用。 | BIND | 10531035 |
Smad3 | DKFZp586N0721 | DKFZp686J10186 | HSPC193 | HsT17436 | JV15-2 | MADH3 | MGC60396 | SMAD家庭成员3 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 14988407 |
Smad4 | DPC4 | JIP | MADH4 | SMAD家庭成员4 | - | HPRD,BioGRID | 14988407 |
SUFU | PRO1280 | SUFUH | SUFUXL | suppressor of fused homolog (Drosophila) | - | HPRD | 10564661 |
TBK1 | FLJ11330 | NAK | T2K | 储罐结合激酶1 | 亲和力捕获ms | BioGRID | 14743216 |
TRIM9 | KIAA0282 |RNF91 |春天 | 三方基序9 | 两个杂交 | BioGRID | 16189514 |
TSPAN15 | 2700063A19Rik | NET-7 | TM4SF15 | tetraspanin 15 | - | HPRD | 12037680 |
UBE2D2 | E2(17)KB2 | PUBC1 | UBC4 | UBC4/5 | UBCH5B | ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 (UBC4/5 homolog, yeast) | Biochemical Activity | BioGRID | 10531035 |
UBE2D2 | E2(17)KB2 | PUBC1 | UBC4 | UBC4/5 | UBCH5B | ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 (UBC4/5 homolog, yeast) | - | HPRD | 10918611 |
ube2r2 | CDC34B | FLJ20419 | MGC10481 | UBC3B | ubiquitin-conjugating enzyme E2R 2 | - | HPRD,BioGRID | 12037680 |
UBQLN2 | CHAP1 | CHAP1/DSK2 | Dsk2 | HRIHFB2157 | LIC-2 | N4BP4 | PLIC-2 | PLIC2 | RIHFB2157 | 泛素2 | - | HPRD,BioGRID | 10983987 |
wee1 | DKFZp686I18166 | FLJ16446 | WEE1A | WEE1hu | wee1homolog (S. pombe) | Wee1A interacts with an unspecified isoform of beta-TrCP1. | BIND | 15070733 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | # SZGR 2.0 genes in pathway | Info |
---|---|---|---|
KEGG OOCYTE MEIOSIS | 114 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG UBIQUITIN MEDIATED PROTEOLYSIS | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG WNT SIGNALING PATHWAY | 151 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg刺猬信号通路 | 56 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta PS1途径 | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA WNT PATHWAY | 26 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WNT SIGNALING | 89 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wnt的Reactome信号传导 | 65 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CELL CYCLE | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4的Reactome信号传导 | 90 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PROLACTIN RECEPTOR SIGNALING | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4的Reactome核信号传导 | 38 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME DOWNSTREAM SIGNALING EVENTS OF B CELL RECEPTOR BCR | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ACTIVATION OF NF KAPPAB IN B CELLS | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNALING BY THE B CELL RECEPTOR BCR | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CELL CYCLE MITOTIC | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
有丝分裂细胞周期的反应组调节 | 85 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNALING BY ILS | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome IL1信号传导 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome昼夜节律 | 53 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME HIV INFECTION | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SCF BETA TRCP MEDIATED DEGRADATION OF EMI1 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME IMMUNE SYSTEM | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ANTIGEN PROCESSING UBIQUITINATION PROTEASOME DEGRADATION | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LASTOWSKA NEUROBLASTOMA COPY NUMBER DN | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 XPCS DN | 88 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM UP | 81 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai肿瘤浸润单核细胞 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KENNY CTNNB1 TARGETS UP | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ABRAHAM ALPC VS MULTIPLE MYELOMA UP | 26 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE HCMV INFECTION 20HR UP | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE HCMV INFECTION 16HR UP | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MCCLUNG COCAINE REWARD 5D | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染12小时 | 111 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE HCMV INFECTION 6HR UP | 71 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MCCABE BOUND BY HOXC6 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ACEVEDO METHYLATED IN LIVER CANCER DN | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MATZUK SPERMATOCYTE | 72 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BONCI TARGETS OF MIR15A AND MIR16 1 | 91 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WANG TUMOR INVASIVENESS UP | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3 TARGETS DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LINSLEY MIR16 TARGETS | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIM MAMMARY LUMINAL MATURE UP | 116 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |