概括?
基因 8945
象征 BTRC
Synonyms BETA-TRCP|FBW1A|FBXW1|FBXW1A|FWD1|bTrCP|bTrCP1|betaTrCP
Description 含有E3泛素蛋白连接酶的β-透明蛋白重复
参考 MIM:603482|HGNC:HGNC:1144|Ensembl:ENSG00000166167|HPRD:04596|Vega:OTTHUMG00000018932
Gene type protein-coding
Map location 10q24.32
Pascal p-value 0.006
Sherlock P值 0.11
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance EQTL类型
rs2209358 chr1 157274426 BTRC 8945 0.15 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
BTRC BETA-TRCP | FBW1A | FBXW1 | FBXW1A | FWD1 | MGC4643 | bTrCP | bTrCP1 | betaTrCP beta-transducin repeat containing Affinity Capture-Western BioGRID 10644755
CD4 CD4mut CD4molecule - HPRD,BioGRID 9660940
CDC25A CDC25A2 cell division cycle 25 homolog A (S. pombe) - HPRD 14603323
CDC34 E2-CDC34 |UBC3 |ube2r1 cell division cycle 34 homolog (S. cerevisiae) Biochemical Activity
Reconstituted Complex
BioGRID 10531035|12037680
楚克 IKBKA | IKK-alpha | IKK1 | IKKA | NFKBIKA | TCF16 保守的螺旋环螺旋无处不在激酶 I-kappa-B-alpha interacts with beta-TrCP. BIND 15994554
CTNNB1 ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 catenin (cadherin-associated protein), beta 1, 88kDa - HPRD 11818547|12114015
CTNNB1 ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 catenin (cadherin-associated protein), beta 1, 88kDa BTRC(beta-trcp1)与CTNNB1(β-catenin)相互作用。 BIND 15735746
CUL1 MGC149834 | MGC149835 卡林1 Affinity Capture-Western BioGRID 10531035|10644755
|12609982
DLG1 DKFZp761P0818 | DKFZp781B0426 | DLGH1 | SAP97 | dJ1061C18.1.1 | hdlg 圆盘,大型同源物1(果蝇) Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
BioGRID 12902344
DLGAP5 DLG1 |DLG7 |hurp |KIAA0008 discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 5 - HPRD 12902344
E2F4 E2F-4 E2F转录因子4,P107/P130结合 E2F4interacts with BTRC promoter. BIND 15782160
FBXW11 btrc2 |BTRCP2 |fbw1b |fbxw1b |FBW11 |hos |KIAA0696 F-box和WD重复域包含11 - HPRD,BioGRID 10644755
IKBKB FLJ40509 |ikk-beta |ikk2 |ikkb |MGC131801 |nfkbikb B细胞,激酶β的Kappa光多肽基因增强子的抑制剂 Affinity Capture-Western BioGRID 11158290
JUP ARVD12 | CTNNG | DP3 | DPIII | PDGB | PKGB 交界处Plakoglobin - HPRD,BioGRID 10803460
NFKB1 DKFZP686C01211 |EBP-1 |kbf1 |MGC54151 |nf-kappa-b |NFKB-P105 |NFKB-P50 |P105 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 Affinity Capture-Western BioGRID 11158290
NFKB2 LYT-10 | LYT10 B细胞2(P49/P100)中Kappa光多肽基因增强子的核因子 - HPRD,BioGRID 11994270
NFKBIA ikba |Mad-3 |nfkbi B细胞抑制剂Alpha中Kappa光多肽基因增强子的核因子 - HPRD,BioGRID 9990853
NFKBIA ikba |Mad-3 |nfkbi B细胞抑制剂Alpha中Kappa光多肽基因增强子的核因子 h-beta-TrCP interacts with and promotes ubiquitination of phosphorylated I-kappa-B-alpha. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human beta-TrCP (h-beta-TrCP) and I-kappa-B-alpha from an unspecified species. BIND 9990853
nfkbib IKBB | TRIP9 B细胞抑制剂Beta中Kappa光多肽基因增强子的核因子 - HPRD,BioGRID 10514424
RELA MGC131774 | NFKB3 | p65 v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian) - HPRD,BioGRID 9990853
SKP1 EMC19 | MGC34403 | OCP-II | OCP2 | SKP1A | TCEB1L | p19A S-phase kinase-associated protein 1 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
两个杂交
BioGRID 9660940|10531035
|10644755|10918611
|12609982
SKP1 EMC19 | MGC34403 | OCP-II | OCP2 | SKP1A | TCEB1L | p19A S-phase kinase-associated protein 1 SKP1与FBW1A相互作用。 BIND 10531035
Smad3 DKFZp586N0721 | DKFZp686J10186 | HSPC193 | HsT17436 | JV15-2 | MADH3 | MGC60396 SMAD家庭成员3 Affinity Capture-Western BioGRID 14988407
Smad4 DPC4 | JIP | MADH4 SMAD家庭成员4 - HPRD,BioGRID 14988407
SUFU PRO1280 | SUFUH | SUFUXL suppressor of fused homolog (Drosophila) - HPRD 10564661
TBK1 FLJ11330 | NAK | T2K 储罐结合激酶1 亲和力捕获ms BioGRID 14743216
TRIM9 KIAA0282 |RNF91 |春天 三方基序9 两个杂交 BioGRID 16189514
TSPAN15 2700063A19Rik | NET-7 | TM4SF15 tetraspanin 15 - HPRD 12037680
UBE2D2 E2(17)KB2 | PUBC1 | UBC4 | UBC4/5 | UBCH5B ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 (UBC4/5 homolog, yeast) Biochemical Activity BioGRID 10531035
UBE2D2 E2(17)KB2 | PUBC1 | UBC4 | UBC4/5 | UBCH5B ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 (UBC4/5 homolog, yeast) - HPRD 10918611
ube2r2 CDC34B | FLJ20419 | MGC10481 | UBC3B ubiquitin-conjugating enzyme E2R 2 - HPRD,BioGRID 12037680
UBQLN2 CHAP1 | CHAP1/DSK2 | Dsk2 | HRIHFB2157 | LIC-2 | N4BP4 | PLIC-2 | PLIC2 | RIHFB2157 泛素2 - HPRD,BioGRID 10983987
wee1 DKFZp686I18166 | FLJ16446 | WEE1A | WEE1hu wee1homolog (S. pombe) Wee1A interacts with an unspecified isoform of beta-TrCP1. BIND 15070733


V.途径注释

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG OOCYTE MEIOSIS 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG UBIQUITIN MEDIATED PROTEOLYSIS 138 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG WNT SIGNALING PATHWAY 151 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg刺猬信号通路 56 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta PS1途径 14 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA WNT PATHWAY 26 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WNT SIGNALING 89 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wnt的Reactome信号传导 65 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome信号传导 90 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PROLACTIN RECEPTOR SIGNALING 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome核信号传导 38 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNSTREAM SIGNALING EVENTS OF B CELL RECEPTOR BCR 97 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ACTIVATION OF NF KAPPAB IN B CELLS 64 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY THE B CELL RECEPTOR BCR 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE MITOTIC 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
有丝分裂细胞周期的反应组调节 85 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY ILS 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL1信号传导 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome昼夜节律 53 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HIV INFECTION 207 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 132 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SCF BETA TRCP MEDIATED DEGRADATION OF EMI1 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ANTIGEN PROCESSING UBIQUITINATION PROTEASOME DEGRADATION 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LASTOWSKA NEUROBLASTOMA COPY NUMBER DN 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM UP 81 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KENNY CTNNB1 TARGETS UP 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABRAHAM ALPC VS MULTIPLE MYELOMA UP 26 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR UP 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 16HR UP 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCCLUNG COCAINE REWARD 5D 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时 111 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 6HR UP 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCCABE BOUND BY HOXC6 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO METHYLATED IN LIVER CANCER DN 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK SPERMATOCYTE 72 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONCI TARGETS OF MIR15A AND MIR16 1 91 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG TUMOR INVASIVENESS UP 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3 TARGETS DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINSLEY MIR16 TARGETS 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY LUMINAL MATURE UP 116 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因