概括
基因 8970
象征 Hist1H2BJ
同义词 H2B/R | H2BFR | H2BJ
描述 组蛋白簇1,H2BJ
参考 MIM:615044|HGNC:HGNC:4761|HPRD:13657|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p22.1
Pascal P值 1E-12
胎儿β 0.279

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.407
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC012676.1 0.94 0.93
VPS11 0.89 0.83
rad23a 0.88 0.84
WIPI2 0.88 0.84
FAM134A 0.88 0.83
adipor1 0.87 0.80
战争 0.86 0.82
UBAP1 0.86 0.81
otud5 0.86 0.81
GPI 0.86 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.63 -0.38
AF347015.18 -0.61 -0.42
AL139819.3 -0.57 -0.51
MT-CO2 -0.56 -0.37
AF347015.8 -0.56 -0.37
AF347015.2 -0.56 -0.33
AC098691.2 -0.55 -0.37
AF347015.31 -0.54 -0.37
IL32 -0.54 -0.33
AC010300.1 -0.53 -0.51

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 nas 6647026
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006334 核小体组装 nas 6647026
GO:0042742 对细菌的防御反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000786 核小体 nas 6647026
去:0005634 IEA -
去:0005694 染色体 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg系统性狼疮红斑 140 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂 116 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I转录 89 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录 210 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome染色体维护 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
新CENPA的反应组沉积在丝粒处含有核小体 64 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I启动子开口 62 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂重组 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Meiotic Synapsis 73 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组淀粉样蛋白 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
端粒末端的反应组包装 48 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome端粒维护 75 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM对TSA和Decitabine的反应 129 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Olsson E2F3靶向DN 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时 156 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH的响应 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 120 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist IL6剥夺DN 98 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRA与基质刺激DN 99 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染30分钟DN 150 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇1 DN 48 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇3 dn 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rao由Sall4绑定 227 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因