概括
基因 8971
象征 H1FX
同义词 H1.10 | H1x
描述 H1组蛋白家庭成员x
参考 MIM:602785|HGNC:HGNC:4722|ENSEMBL:ENSG00000184897|HPRD:04151|Vega:Otthumg00000159450
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q21.3
Pascal P值 5.137E-4
Sherlock P值 0.935
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG12276904 3 129035177 H1FX -0.022 0.75 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16878317 CHR8 31657853 H1FX 8971 0.2 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
htra2 0.92 0.91
MRPS2 0.90 0.89
EMD 0.89 0.89
RNF25 0.89 0.90
STK19 0.88 0.89
eral1 0.88 0.89
DTX3 0.88 0.87
KLHL22 0.88 0.88
OVCA2 0.88 0.87
AP4M1 0.88 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.8 -0.74 -0.77
MT-CO2 -0.74 -0.75
mt-cyb -0.73 -0.76
AF347015.27 -0.73 -0.76
AF347015.31 -0.72 -0.74
AF347015.2 -0.71 -0.76
AF347015.26 -0.71 -0.78
AF347015.33 -0.71 -0.73
AF347015.15 -0.70 -0.75
MT-ATP8 -0.67 -0.79

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘vmyb的目标 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧素DN的浓凋亡 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过小径dn 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1靶向 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 236 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1向上 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tavor Cebpa靶向DN 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C6的反应 39 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦卡因可卡因奖励5D 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gajate对Trabectedin DN的响应 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G4 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士JAK2瞄准 26 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G28 20 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
替代孕激素靶标 36 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时DN的响应 114 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因