基因页:Wasl
概括?
基因 | 8976 |
象征 | Wasl |
同义词 | n-wasp | nwasp | waspb |
描述 | Wiskott-Aldrich综合征样 |
参考 | MIM:605056|HGNC:HGNC:12735|ENSEMBL:ENSG00000106299|HPRD:05448|Vega:Otthumg00000157346 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q31.3 |
Pascal P值 | 0.001 |
Sherlock P值 | 0.078 |
支持 | 结构可塑性 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZFYVE28 | 0.90 | 0.84 |
Stim1 | 0.87 | 0.84 |
CAMTA2 | 0.87 | 0.86 |
CNTNAP1 | 0.87 | 0.84 |
AC105206.1 | 0.86 | 0.82 |
NPTN | 0.86 | 0.81 |
ablim2 | 0.86 | 0.83 |
KCNAB2 | 0.86 | 0.88 |
mast3 | 0.86 | 0.87 |
SLC35F3 | 0.86 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.57 | -0.63 |
C9orf46 | -0.53 | -0.55 |
tubb2b | -0.51 | -0.50 |
RPS20 | -0.51 | -0.61 |
RPL27A | -0.51 | -0.63 |
RBMX2 | -0.50 | -0.51 |
RPL18 | -0.50 | -0.59 |
YBX1 | -0.50 | -0.44 |
RPS8 | -0.50 | -0.56 |
PPP1R14B | -0.50 | -0.56 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CDC42 | cdc42hs |G25K | 细胞分裂周期42(GTP结合蛋白,25KDA) | 体外 重构的复合物 |
Biogrid | 9422512|10781580 |
CDC42 | cdc42hs |G25K | 细胞分裂周期42(GTP结合蛋白,25KDA) | - | HPRD | 9422512|10724160 |
cttn | EMS1 |FLJ34459 | cortactin | - | HPRD,Biogrid | 11830518 |
DNMBP | KIAA1010 |图巴 | 动力蛋白结合蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 14506234 |
FNBP1L | C1orf39 |TOCA1 | formin结合蛋白1类 | - | HPRD | 15260990 |
FNBP1L | C1orf39 |TOCA1 | formin结合蛋白1类 | TOCA-1与N-WASP相互作用。这种相互作用是在人类与大鼠N-WASP的TOCA-1之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 15260990 |
GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 10087612|10781580 |
HSP90AA1 | FLJ31884 |HSP86 |HSP89A |HSP90A |HSP90N |HSPC1 |HSPCA |HSPCAL1 |HSPCAL4 |HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 | 热休克蛋白90KDAα(胞质),A类成员1 | Wasl(N-WASP)与HSPCA(HSP90-Alpha)相互作用。 | 绑定 | 15791211 |
HSP90AB1 | D6S182 |FLJ26984 |HSP90-BETA |HSP90B |HSPC2 |HSPCB | 热休克蛋白90KDAα(胞质),B类成员1 | WASL(N-WASP)与HSPCB(HSP90-BETA)相互作用。 | 绑定 | 15791211 |
ITSN1 | 它的|MGC134948 |MGC134949 |SH3D1A |SH3P17 | 相交1(SH3结构蛋白) | - | HPRD,Biogrid | 11584276 |
NCK1 | MGC12668 |NCK |nckalpha | NCK适配器蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 11340081 |
NCKIPSD | AF3P21 |蘸酱|dip1 |MGC23891 |ORF1 |Spin90 |WASLBP |希望 | NCK与SH3结构域的相互作用蛋白 | - | HPRD | 11157975 |
Pacsin1 | KIAA1379 |SDPI | 神经元中的蛋白激酶C和酪蛋白激酶底物1 | - | HPRD | 9950691 | 11179684 |
Pacsin1 | KIAA1379 |SDPI | 神经元中的蛋白激酶C和酪蛋白激酶底物1 | 重构的复合物 | Biogrid | 11082044 |
pacsin2 | SDPII | 神经元中的蛋白激酶C和酪蛋白激酶底物2 | 重构的复合物 | Biogrid | 11082044 |
Pacsin3 | SDPIII | 神经元中的蛋白激酶C和酪蛋白激酶底物3 | - | HPRD,Biogrid | 11082044 |
PFN1 | - | profilin 1 | - | HPRD,Biogrid | 9822597 |
PRPF40A | FBP-11 |FBP11 |flaf1 |FLJ20585 |fnbp3 |hip10 |hypa |NY-REN-6 | PRP40前MRNA处理因子40同源物A(酿酒酵母) | - | HPRD | 14697212 |
Rhoq | arhq |rasl7a |TC10 |TC10A | RAS同源基因家族,成员Q | - | HPRD,Biogrid | 12456725 |
VIPR1 | FLJ41949 |HVR1 |II |PACAP-R-2 |RDC1 |vapc1 |VIPR |维格|VPAC1 |VPCAP1R | 血管活性肠受体1 | - | HPRD,Biogrid | 10867004 |
WIPF1 | MGC111041 |prpl-2 |WASPIP |WIP | 是/WASL相互作用蛋白家族,成员1 | - | HPRD,Biogrid | 10087612|12372256 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG趋化因子信号传导途径 | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg粘附交界处 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 | 97 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG致病性大肠杆菌感染 | 59 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡尔塔沙门氏菌途径 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta CDC42RAC途径 | 16 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Actiny Pathway | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SIG趋化性 | 45 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rho GTPases对肌动蛋白细胞骨架的SIG调节 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID遇到了路径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID EPHB FWD途径 | 40 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CDC42途径 | 70 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Netrin途径 | 32 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1受体近端途径 | 35 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1下游途径 | 105 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PDGFRB途径 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID肾素Neph1途径 | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FAK PATHWAY | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞通信 | 120 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Enos激活和调节 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Netrin1信号传导 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DCC介导的有吸引力的信号 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肾素相互作用 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOOI ST7靶向 | 94 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN | 137 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 | 382 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染8小时 | 105 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma dn | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |