概括
基因 89765
象征 rsph1
同义词 CT79 | RSP44 | RSPH10A | TSA2 | TSGA2
描述 radial辐条1同源物(衣原体)
参考 MIM:609314|HGNC:HGNC:12371|ENSEMBL:ENSG00000160188|HPRD:11651|Vega:Otthumg00000086804
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.3
Pascal P值 0.187
Sherlock P值 0.027
主持人 尾状基底神经节
皮质
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12122035 CHR1 50726051 rsph1 89765 0.06 反式
RS6713473 CHR2 11284414 rsph1 89765 0.2 反式
RS7578306 CHR2 171082977 rsph1 89765 0.02 反式
RS6799944 CHR3 122905753 rsph1 89765 0.14 反式
RS2268637 CHR6 39050917 rsph1 89765 0.05 反式
RS11966129 CHR6 138693996 rsph1 89765 0.17 反式
RS1341140 CHR13 79534499 rsph1 89765 0.14 反式
RS12585805 CHR13 79546978 rsph1 89765 0.14 反式
RS9976598 21 43901777 rsph1 ENSG00000160188.5 3.313E-7 0.01 11412 gtex_brain_putamen_basal
RS200939470 21 43903570 rsph1 ENSG00000160188.5 4.953E-8 0.01 9619 gtex_brain_putamen_basal
RS66906364 21 43903571 rsph1 ENSG00000160188.5 4.942E-8 0.01 9618 gtex_brain_putamen_basal
RS2839536 21 43905887 rsph1 ENSG00000160188.5 4.461E-8 0.01 7302 gtex_brain_putamen_basal
RS2839537 21 43906351 rsph1 ENSG00000160188.5 4.461E-8 0.01 6838 gtex_brain_putamen_basal
RS4920113 21 43907252 rsph1 ENSG00000160188.5 4.461E-8 0.01 5937 gtex_brain_putamen_basal
RS9983237 21 43909302 rsph1 ENSG00000160188.5 4.461E-8 0.01 3887 gtex_brain_putamen_basal
RS9979100 21 43913370 rsph1 ENSG00000160188.5 1.698E-7 0.01 -181 gtex_brain_putamen_basal
RS1573413 21 43916339 rsph1 ENSG00000160188.5 7.753E-8 0.01 -3150 gtex_brain_putamen_basal
RS9984443 21 43929514 rsph1 ENSG00000160188.5 1.843E-7 0.01 -16325 gtex_brain_putamen_basal
RS8126600 21 43929852 rsph1 ENSG00000160188.5 1.841E-7 0.01 -16663 gtex_brain_putamen_basal
RS4919990 21 43938673 rsph1 ENSG00000160188.5 4.48e-7 0.01 -25484 gtex_brain_putamen_basal
RS3788020 21 43947353 rsph1 ENSG00000160188.5 6.05e-8 0.01 -34164 gtex_brain_putamen_basal
RS10887974 21 43949715 rsph1 ENSG00000160188.5 1.152E-7 0.01 -36526 gtex_brain_putamen_basal
RS228049 21 43952437 rsph1 ENSG00000160188.5 3.79E-7 0.01 -39248 gtex_brain_putamen_basal
RS228081 21 43966971 rsph1 ENSG00000160188.5 2.361E-7 0.01 -53782 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
留置权乳腺癌化生型与导管DN 114 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D簇DN 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 DN 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因