基因页:rsph1
概括?
基因 | 89765 |
象征 | rsph1 |
同义词 | CT79 | RSP44 | RSPH10A | TSA2 | TSGA2 |
描述 | radial辐条1同源物(衣原体) |
参考 | MIM:609314|HGNC:HGNC:12371|ENSEMBL:ENSG00000160188|HPRD:11651|Vega:Otthumg00000086804 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 21q22.3 |
Pascal P值 | 0.187 |
Sherlock P值 | 0.027 |
主持人 | 尾状基底神经节 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12122035 | CHR1 | 50726051 | rsph1 | 89765 | 0.06 | 反式 | ||
RS6713473 | CHR2 | 11284414 | rsph1 | 89765 | 0.2 | 反式 | ||
RS7578306 | CHR2 | 171082977 | rsph1 | 89765 | 0.02 | 反式 | ||
RS6799944 | CHR3 | 122905753 | rsph1 | 89765 | 0.14 | 反式 | ||
RS2268637 | CHR6 | 39050917 | rsph1 | 89765 | 0.05 | 反式 | ||
RS11966129 | CHR6 | 138693996 | rsph1 | 89765 | 0.17 | 反式 | ||
RS1341140 | CHR13 | 79534499 | rsph1 | 89765 | 0.14 | 反式 | ||
RS12585805 | CHR13 | 79546978 | rsph1 | 89765 | 0.14 | 反式 | ||
RS9976598 | 21 | 43901777 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 3.313E-7 | 0.01 | 11412 | gtex_brain_putamen_basal |
RS200939470 | 21 | 43903570 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 4.953E-8 | 0.01 | 9619 | gtex_brain_putamen_basal |
RS66906364 | 21 | 43903571 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 4.942E-8 | 0.01 | 9618 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2839536 | 21 | 43905887 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 4.461E-8 | 0.01 | 7302 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2839537 | 21 | 43906351 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 4.461E-8 | 0.01 | 6838 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4920113 | 21 | 43907252 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 4.461E-8 | 0.01 | 5937 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9983237 | 21 | 43909302 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 4.461E-8 | 0.01 | 3887 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9979100 | 21 | 43913370 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 1.698E-7 | 0.01 | -181 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1573413 | 21 | 43916339 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 7.753E-8 | 0.01 | -3150 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9984443 | 21 | 43929514 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 1.843E-7 | 0.01 | -16325 | gtex_brain_putamen_basal |
RS8126600 | 21 | 43929852 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 1.841E-7 | 0.01 | -16663 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4919990 | 21 | 43938673 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 4.48e-7 | 0.01 | -25484 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3788020 | 21 | 43947353 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 6.05e-8 | 0.01 | -34164 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10887974 | 21 | 43949715 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 1.152E-7 | 0.01 | -36526 | gtex_brain_putamen_basal |
RS228049 | 21 | 43952437 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 3.79E-7 | 0.01 | -39248 | gtex_brain_putamen_basal |
RS228081 | 21 | 43966971 | rsph1 | ENSG00000160188.5 | 2.361E-7 | 0.01 | -53782 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
留置权乳腺癌化生型与导管DN | 114 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤D簇DN | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 DN | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |