概括
基因 89790
象征 SIGLEC10
同义词 pro940 | siglec-10 | slg2
描述 唾液酸结合Ig如凝集素10
参考 MIM:606091|HGNC:HGNC:15620|ENSEMBL:ENSG00000142512|HPRD:07307|Vega:Otthumg00000165521
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.3
Pascal P值 0.762
胎儿β -0.637
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG11459714 19 51520658 SIGLEC10 0.001 -7.147 DMG:Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10116858 Chr9 20300988 SIGLEC10 89790 0.04 反式
RS3802522 Chr10 28341865 SIGLEC10 89790 0.13 反式
RS10508730 Chr10 28403391 SIGLEC10 89790 0.13 反式
RS10743139 Chr11 10425326 SIGLEC10 89790 0.06 反式
RS10770432 CHR12 19234389 SIGLEC10 89790 0.12 反式
RS11178166 CHR12 70670585 SIGLEC10 89790 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合目标F DN 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向DN 148 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因