基因页:SIGLEC10
概括?
基因 | 89790 |
象征 | SIGLEC10 |
同义词 | pro940 | siglec-10 | slg2 |
描述 | 唾液酸结合Ig如凝集素10 |
参考 | MIM:606091|HGNC:HGNC:15620|ENSEMBL:ENSG00000142512|HPRD:07307|Vega:Otthumg00000165521 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.3 |
Pascal P值 | 0.762 |
胎儿β | -0.637 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG11459714 | 19 | 51520658 | SIGLEC10 | 0.001 | -7.147 | DMG:Vaneijk_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10116858 | Chr9 | 20300988 | SIGLEC10 | 89790 | 0.04 | 反式 | ||
RS3802522 | Chr10 | 28341865 | SIGLEC10 | 89790 | 0.13 | 反式 | ||
RS10508730 | Chr10 | 28403391 | SIGLEC10 | 89790 | 0.13 | 反式 | ||
RS10743139 | Chr11 | 10425326 | SIGLEC10 | 89790 | 0.06 | 反式 | ||
RS10770432 | CHR12 | 19234389 | SIGLEC10 | 89790 | 0.12 | 反式 | ||
RS11178166 | CHR12 | 70670585 | SIGLEC10 | 89790 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SIGLEC10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合目标F DN | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向DN | 148 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |