基因页：NAV1

概括？
基因 89796
象征 NAV1
同义词 POMFIL3 | Steerin1 | UNC53H1
描述 神经元导航器1
参考 MIM：611628|HGNC：HGNC：15989|ENSEMBL：ENSG00000134369|HPRD：10113|Vega：Otthumg0000000035766
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q32.3
Sherlock P值 0.837
DEG P值 DEG：ZHAO_2015：P = 3.40E-04：Q = 0.0924
胎儿β 1.837
DMG 1（＃研究）
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG：Zhao_2015 RNA测序分析 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG17123676 1 201673460 NAV1 4.659E-4 -0.349 0.046 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0017111 核苷 - 三磷酸酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0001764 神经元迁移 IEA 神经元（GO期限：8） -
去：0007399 神经系统的发展 IEA 神经突（GO期限：5） -
去：0001578 微管束的形成 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
去：0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005856 细胞骨架 IEA -
去：0005874 微管 IEA -
去：0005737 细胞质 IEA -
去：0015630 微管细胞骨架 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对Forskolin DN的反应 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿色DN 25 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
仅通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发和癌症Box4 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bernard PPAPDC1B目标DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈肝新陈代谢QTL顺式 93 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向 139 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 134 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BMI1和PCGF2的Wiederschain目标 57 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1的Juban目标 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 2737 2743 1a HSA-MIR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-124.1 2301 2308 1A，M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 2512 2518 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-130/301 1285 1291 1a HSA-MIR-130A脑 cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b脑 Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-15/16/195/424/497 2195 2202 1A，M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-153 2246 2252 1a HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-18 3140 3146 M8 HSA-MIR-18A uaagguggaugugcagaua
HSA-MIR-18B uaaggugcaucuagugcagua
mir-19 2850 2856 1a HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-27 2213 2219 1a HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-29 2940 2947 1A，M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-30-5p 2841 2848 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-34/449 468 475 1A，M8 HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-34b 2299 2305 M8 HSA-MIR-34B uaggcagugucauagcugauug
mir-448 2245 2252 1A，M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-503 2196 2202 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag
mir-539 3358 3364 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-542-3p 15 21 M8 HSA-MIR-542-3P ugugacauugauaacugaaa
mir-544 2320 2326 M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu