基因页面:FGD3
总结吗?
GeneID | 89846年 |
象征 | FGD3 |
同义词 | ZFYVE5 |
描述 | FYVE, RhoGEF和PH值域包含3 |
参考 | HGNC: HGNC: 16027|运用:ENSG00000127084|HPRD: 10957|织女:OTTHUMG00000021032 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | - - - - - - |
帕斯卡假定值 | 0.001 |
胎儿β | 0.375 |
eGene | 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
表达式 | 荟萃分析的基因表达 | P值:2.189 | |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs16869851 | chr4 | 20690056 | FGD3 | 89846年 | 0.05 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FGD3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005089 | ρguanyl-nucleotide交换因素的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005085 | guanyl-nucleotide交换因素活动 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0031267 | 小GTPase绑定 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0046847 | 外肉伪足的形成 | 国际空间站 | 轴突(词级:10) | - - - - - - |
去:0007010 | 细胞骨架组织 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0008360 | 调节细胞形状 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0035023 | ρ调节蛋白信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0043088 | Cdc42 GTPase活动的监管 | 国际空间站 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0001726 | 莱夫 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0005794 | 高尔基体 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0005856 | 细胞骨架 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0030027 | lamellipodium | 国际空间站 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG调节肌动蛋白细胞骨架 | 216年 | 144年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ρgtpase REACTOME信号 | 113年 | 81年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME信号通过神经生长因子 | 217年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME NRAGE信号通过物死亡 | 43 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME细胞死亡信号通过NRAGE NRIF和纳德 | 60 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME我正常受体介导信号关系 | 81年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME G ALPHA1213信号事件 | 74年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质 | 450年 | 256年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周炎症反应费马DN | 284年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAUSSMANN MLL AF4融合目标C | 170年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆APC DN的目标 | 366年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN | 911年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗4 | 307年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANTVEER乳腺癌ESR1 | 167年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WINNEPENNINCKX黑色素瘤转移DN | 46 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 | 824年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |