基因页:TRPA1
概括?
基因 | 8989 |
象征 | TRPA1 |
同义词 | anktm1 | feps |
描述 | 瞬态受体电势阳离子通道亚家族成员1 |
参考 | MIM:604775|HGNC:HGNC:497|ENSEMBL:ENSG00000104321|HPRD:09208|Vega:Otthumg00000164516 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q13 |
Pascal P值 | 0.375 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRPA1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DVL3 | 0.97 | 0.97 |
EHMT2 | 0.97 | 0.97 |
WHSC2 | 0.97 | 0.97 |
RBM10 | 0.97 | 0.97 |
RBM15B | 0.96 | 0.96 |
U2AF2 | 0.96 | 0.96 |
DCAF15 | 0.96 | 0.95 |
axin1 | 0.96 | 0.96 |
NUP62 | 0.96 | 0.94 |
CSNK1E | 0.96 | 0.96 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.90 |
AF347015.27 | -0.76 | -0.89 |
C5orf53 | -0.75 | -0.78 |
MT-CO2 | -0.75 | -0.89 |
AF347015.33 | -0.74 | -0.86 |
S100B | -0.73 | -0.82 |
mt-cyb | -0.73 | -0.86 |
HLA-F | -0.72 | -0.75 |
AF347015.8 | -0.71 | -0.87 |
COPZ2 | -0.71 | -0.80 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON | 132 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔内B | 172 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |