概括
基因 8989
象征 TRPA1
同义词 anktm1 | feps
描述 瞬态受体电势阳离子通道亚家族成员1
参考 MIM:604775|HGNC:HGNC:497|ENSEMBL:ENSG00000104321|HPRD:09208|Vega:Otthumg00000164516
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q13
Pascal P值 0.375
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DVL3 0.97 0.97
EHMT2 0.97 0.97
WHSC2 0.97 0.97
RBM10 0.97 0.97
RBM15B 0.96 0.96
U2AF2 0.96 0.96
DCAF15 0.96 0.95
axin1 0.96 0.96
NUP62 0.96 0.94
CSNK1E 0.96 0.96
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.77 -0.90
AF347015.27 -0.76 -0.89
C5orf53 -0.75 -0.78
MT-CO2 -0.75 -0.89
AF347015.33 -0.74 -0.86
S100B -0.73 -0.82
mt-cyb -0.73 -0.86
HLA-F -0.72 -0.75
AF347015.8 -0.71 -0.87
COPZ2 -0.71 -0.80

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON 132 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔内B 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因