基因页:Selenbp1
概括?
基因 | 8991 |
象征 | Selenbp1 |
同义词 | HEL-S-134P | LPSB | SBP56 | SP56 | HSBP |
描述 | 硒结合蛋白1 |
参考 | MIM:604188|HGNC:HGNC:10719|ENSEMBL:ENSG00000143416|HPRD:05007|Vega:Otthumg0000000012498 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q21.3 |
Sherlock P值 | 0.547 |
胎儿β | -1.577 |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0235 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00814 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10858568 | CHR12 | 87625390 | Selenbp1 | 8991 | 0.15 | 反式 | ||
RS17070904 | CHR18 | 60917055 | Selenbp1 | 8991 | 0.17 | 反式 | ||
RS4501739 | Chrx | 35960848 | Selenbp1 | 8991 | 0.01 | 反式 | ||
RS4465127 | Chrx | 75360522 | Selenbp1 | 8991 | 0.1 | 反式 | ||
RS192069 | Chrx | 76053555 | Selenbp1 | 8991 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SELENBP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
OTUB1 | 0.93 | 0.94 |
mtch1 | 0.92 | 0.93 |
MAPRE3 | 0.90 | 0.89 |
AP2M1 | 0.90 | 0.88 |
鼻烟 | 0.88 | 0.89 |
BSCL2 | 0.88 | 0.87 |
ATP6V0C | 0.88 | 0.90 |
GPI | 0.87 | 0.85 |
PEBP1 | 0.87 | 0.86 |
FAM134A | 0.87 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.54 | -0.37 |
NSBP1 | -0.52 | -0.49 |
AC010300.1 | -0.51 | -0.55 |
AF347015.21 | -0.47 | -0.22 |
AF347015.26 | -0.46 | -0.25 |
AF347015.2 | -0.46 | -0.21 |
EIF5B | -0.46 | -0.51 |
AC005921.3 | -0.45 | -0.59 |
AF347015.8 | -0.44 | -0.24 |
MT-ATP8 | -0.44 | -0.25 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008430 | 硒结合 | IEA | - | |
去:0008430 | 硒结合 | 塔斯 | 9027582 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Corre多发性骨髓瘤DN | 62 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane乳腺癌ESR1 UP | 112 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola sezary综合征 | 98 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lucas HNF4A靶向 | 58 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hwang前列腺癌标记 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 | 110 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 | 142 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌电纤维酸DN | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌ACOX1 DN | 65 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Frasor对雌二醇DN的反应 | 82 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Dena DN | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Radmacher AML预后 | 78 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUAN对TNF Troglitazone DN的反应 | 42 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUAN对TNF DN的反应 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HNE和TBH的Weigel氧化应激 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脑DN中的乳腺癌复发 | 85 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer肿瘤发生DN | 51 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEKI炎症反应LPS DN | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ruiz TNC目标 | 153 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集7 | 28 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集8 | 26 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 DN | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Coulouarn颞TGFB1签名DN | 138 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kobayashi EGFR信号24小时 | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA2 DN | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ruan对Troglitazone DN的反应 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acosta增殖独立MYC目标DN | 116 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 | 106 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roessler肝癌转移 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |