概括
基因 8991
象征 Selenbp1
同义词 HEL-S-134P | LPSB | SBP56 | SP56 | HSBP
描述 硒结合蛋白1
参考 MIM:604188|HGNC:HGNC:10719|ENSEMBL:ENSG00000143416|HPRD:05007|Vega:Otthumg0000000012498
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21.3
Sherlock P值 0.547
胎儿β -1.577
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10858568 CHR12 87625390 Selenbp1 8991 0.15 反式
RS17070904 CHR18 60917055 Selenbp1 8991 0.17 反式
RS4501739 Chrx 35960848 Selenbp1 8991 0.01 反式
RS4465127 Chrx 75360522 Selenbp1 8991 0.1 反式
RS192069 Chrx 76053555 Selenbp1 8991 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
OTUB1 0.93 0.94
mtch1 0.92 0.93
MAPRE3 0.90 0.89
AP2M1 0.90 0.88
鼻烟 0.88 0.89
BSCL2 0.88 0.87
ATP6V0C 0.88 0.90
GPI 0.87 0.85
PEBP1 0.87 0.86
FAM134A 0.87 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.18 -0.54 -0.37
NSBP1 -0.52 -0.49
AC010300.1 -0.51 -0.55
AF347015.21 -0.47 -0.22
AF347015.26 -0.46 -0.25
AF347015.2 -0.46 -0.21
EIF5B -0.46 -0.51
AC005921.3 -0.45 -0.59
AF347015.8 -0.44 -0.24
MT-ATP8 -0.44 -0.25

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008430 硒结合 IEA -
去:0008430 硒结合 塔斯 9027582
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0015031 蛋白质运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0016020 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corre多发性骨髓瘤DN 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane乳腺癌ESR1 UP 112 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola sezary综合征 98 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lucas HNF4A靶向 58 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hwang前列腺癌标记 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee肝癌电纤维酸DN 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee肝癌ACOX1 DN 65 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对雌二醇DN的反应 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Dena DN 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Radmacher AML预后 78 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF Troglitazone DN的反应 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF DN的反应 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HNE和TBH的Weigel氧化应激 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脑DN中的乳腺癌复发 85 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer肿瘤发生DN 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI炎症反应LPS DN 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC目标 153 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集7 28 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集8 26 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 DN 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖DN 179 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn颞TGFB1签名DN 138 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存DN 113 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信号24小时 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA2 DN 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruan对Troglitazone DN的反应 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC目标DN 116 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 106 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因