SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因ID	9021
Symbol	SOCS3
同义词	atod4 \| cis3 \| cish3 \| socs-3 \| ssi-3 \| ssi3
描述	抑制细胞因子信号3
参考	MIM：604176\|HGNC:HGNC:19391\|Ensembl:ENSG00000184557\|HPRD:05006\|Vega：Otthumg00000177513
基因type	protein-coding
地图位置	17q25.3
Pascal P值	0.784
Fetal beta	-0.295
eGene	迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
PMID:cooccur	高通量文献搜索	系统的烤焦ch in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

EQTL注释

SNP ID	Chromosome	Position	eGene	基因Entrez ID	PVALUE	qvalue	TSS distance	eQTL type
rs10994209	chr10	61877705	SOCS3	9021		0.04		trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
PLLP	0.91	0.86
RNASE1	0.90	0.84
DBNDD2	0.90	0.85
PPAP2C	0.90	0.83
GJB1	0.89	0.82
NINJ2	0.89	0.82
TSPAN15	0.89	0.86
CMTM5	0.89	0.82
ELOVL1	0.89	0.84
MAL	0.88	0.81

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
CCAR1	-0.54	-0.68
SLC24A5	-0.53	-0.64
ZBTB8A	-0.51	-0.56
TIGD7	-0.51	-0.58
AIM2	-0.51	-0.65
NOP58	-0.51	-0.60
ZNF300	-0.50	-0.57
HMGB3	-0.50	-0.60
THOC2	-0.50	-0.59
nkiras2	-0.50	-0.50

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
CSF1R	C-FMS \|CD115 \|CSFR \|fim2 \|FMS	菌落刺激因子1受体	-	HPRD，Biogrid	12133942
CXCR4	CD184 \| D2S201E \| FB22 \| HM89 \| HSY3RR \| LAP3 \| LCR1 \| LESTR \| NPY3R \| NPYR \| NPYRL \| NPYY3R \| WHIM	chemokine (C-X-C motif) receptor 4	-	HPRD，Biogrid	12163560
EGFR	ERBB \| ERBB1 \| HER1 \| PIG61 \| mENA	epidermal growth factor receptor (erythroblastic leukemia viral (v-erb-b) oncogene homolog, avian)	-	HPRD，Biogrid	12070153
epor	MGC138358	erythropoietin receptor	-	HPRD，Biogrid	10882725\|12027890
GHR	GHBP	growth hormone receptor	-	HPRD，Biogrid	10585430
IGF1R	CD221 \| IGFIR \| JTK13 \| MGC142170 \| MGC142172 \| MGC18216	胰岛素样生长因子1受体	细胞因子信号传导（SOCS）-3蛋白的抑制剂与胰岛素样生长因子I受体相互作用。	BIND	11071852
IGF1R	CD221 \| IGFIR \| JTK13 \| MGC142170 \| MGC142172 \| MGC18216	胰岛素样生长因子1受体	in vitro 体内	BioGRID	11071852
IL6ST	CD130 \| CDw130 \| GP130 \| GP130-RAPS \| IL6R-beta	白介素6信号传感器（GP130，oncostatin M受体）	-	HPRD，Biogrid	10946280\|12403768
insr	CD220 \| HHF5	insulin receptor	-	HPRD，Biogrid	11071852\|12560330
IRS1	hirs-1	胰岛素受体底物1	-	HPRD	12228220
JAK2	JTK10	Janus激酶2（蛋白酪氨酸激酶）	-	HPRD，Biogrid	9344848\|10421843
LEPR	CD295 \|OBR	leptin receptor	-	HPRD，Biogrid	11018044
PIN1	DOD \| UBL5	peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1	两个杂交	BioGRID	16169070
PPP3CB	CALNA2 \| CALNB	蛋白质磷酸酶3（以前为2B），催化亚基，β同工型	-	HPRD	11970967
prlr	hPRLrI	prolactin receptor	-	HPRD，Biogrid	11713228
PTPN11	BPTP3 \| CFC \| MGC14433 \| NS1 \| PTP-1D \| PTP2C \| SH-PTP2 \| SH-PTP3 \| SHP2	蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体11型	Affinity Capture-Western Reconstituted Complex	BioGRID	12403768
rasa1	CM-AVM \|cmavm \|DKFZP434N071 \|差距\|pkws \|拉萨\|rasgap \|P120GAP \|P120RASGAP	RAS p21 protein activator (GTPase activating protein) 1	-	HPRD，Biogrid	11331873
TCEB1	siii	transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 1 (15kDa, elongin C)	-	HPRD	10051596
TCEB2	Elob \|siii	transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 2 (18kDa, elongin B)	-	HPRD	10051596

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
KEGG泛素介导的蛋白水解	138	98	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG JAK STAT SIGNALING PATHWAY	155	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路	137	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG脂肪细胞信号传导途径	67	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TYPE II DIABETES MELLITUS	47	41	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL2RB途径	38	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL22BP途径	16	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL4 2 Pathway	65	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PTP1B PATHWAY	52	40	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 1 Pathway	55	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ATF2途径	59	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL6 7途径	47	40	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL23 PATHWAY	37	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPO PATHWAY	34	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组生长激素受体信号传导	24	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY ILS	107	86	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFNG信号的Reactome调节	14	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素伽马信号传导	63	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTERFERON ALPHA BETA SIGNALING	64	50	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF IFNA SIGNALING	24	22	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTERFERON SIGNALING	159	116	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL 6信号传导	11	9	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统	933	616	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM	539	350	该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导	270	204	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION	251	156	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解	212	129	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN	634	384	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌	206	111	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN	463	290	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN	460	312	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN	162	116	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION ERYTHROCYTE UP	157	104	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION KRAS DN	142	95	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 2A DN	141	84	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 ACUTE LOF UP	215	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG ESOPHAGUS CANCER VS NORMAL UP	121	72	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL UP	584	356	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEREZ TP63 TARGETS	355	243	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B	392	251	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAUER STAT3 TARGETS UP	49	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YORDY RECIPROCAL REGULATION BY ETS1 AND SP100 DN	87	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM6	46	32	该途径中的所有SZGR 2.0基因
总ELK3靶向DN	32	17	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SAKAI CHRONIC HEPATITIS VS LIVER CANCER DN	36	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIN B CELL LYMPHOMA CLUSTER 5	18	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应	223	140	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon	335	181	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOLDRATH HOMEOSTATIC PROLIFERATION	171	102	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG POU5F1 TARGETS DN	8	5	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up	205	126	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6	144	98	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Galindo对肠毒素的免疫反应	85	67	该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分	475	313	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABBUD LIF SIGNALING 1 UP	46	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
AFFAR YY1 TARGETS DN	234	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP	1691年	1088	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR DN	504	323	该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素抵抗时的肉食正常	34	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN	245	144	该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液	222	139	该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏	487	303	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JACKSON DNMT1 TARGETS UP	77	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARTIPY BLUNTED BY INSULIN RESISTANCE UP	19	17	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向	280	183	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAN JNK SINGALING DN	39	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿	253	147	该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN	409	268	该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEARMAN TUMOR FIELD EFFECT UP	36	22	该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEARMAN LUNG CANCER EARLY VS LATE DN	61	39	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER SILENCED BY METHYLATION UP	282	183	该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSADA ASCL1靶向DN	24	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOQUE METHYLATED IN CANCER	56	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP	648	398	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING	510	309	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG BREAST CANCER PROGENITORS DN	145	93	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜DN	31	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1 TARGETS UP	93	56	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向	1305	895	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANASSE BCL2靶向	40	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯	491	316	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE RECENT THYMIC EMIGRANT	227	128	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA CHEMOTAXIS DN	457	302	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS CTNNB1 DN	170	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位	368	247	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONO AML1 TARGETS DN	41	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WORSCHECH TUMOR EVASION AND TOLEROGENICITY DN	14	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块	721	492	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Leiomomyosarcoma CNN1 DN	20	18	该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗HCMV感染30分钟	56	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAMBOLSKY RESPONSE TO VITAMIN D3 UP	84	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIRSCH CELLULAR TRANSFORMATION SIGNATURE UP	242	159	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN	918	550	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP C	92	60	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE EARLY LATE	317	190	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM GLIS2 TARGETS UP	84	61	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Duan PRDM5目标	79	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向	682	433	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN	1080	713	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RAR BOUND ES	462	273	该途径中的所有SZGR 2.0基因
因宗乳腺干细胞向上	146	75	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALTEMEIER RESPONSE TO LPS WITH MECHANICAL VENTILATION	128	81	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP	289	184	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF	222	159	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：SOCS3