基因页面:BAZ1B
总结吗?
GeneID | 9031年 |
象征 | BAZ1B |
同义词 | WBSCR10 | WBSCR9 | WSTF |
描述 | bromodomain毗邻锌指域1 b |
参考 | MIM: 605681|HGNC: HGNC: 961|运用:ENSG00000009954|HPRD: 10416|织女:OTTHUMG00000023847 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 7 q11.23 |
帕斯卡假定值 | 0.141 |
夏洛克假定值 | 0.046 |
胎儿β | 0.263 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异的研究 | 人工管理 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg06059318 | 7 | 72936700 | BAZ1B | 7.07 e-9 | -0.011 | 3.57 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BAZ1B_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ACTL6A | ACTL6 | Arp4 | BAF53A | INO80K | MGC5382 | actin-like 6 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12837248 |
ARID1A | B120 | BAF250 | BAF250a | BM029 | C1orf4 | P270 | SMARCF1 | 在丰富的交互式域1 (SWI-like) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12837248 |
BAZ1A | ACF1 | DKFZp586E0518 | FLJ14383 | WALp1 | WCRF180 | hACF1 | bromodomain毗邻锌指域,1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11980720 |
CHAF1A | CAF-1 | CAF1 | CAF1B | CAF1P150 | MGC71229 | P150 | 染色质组装因子1,亚基(p150) | - - - - - - | HPRD | 12837248 |
CHAF1B | CAF-1 | CAF-IP60 | CAF1 | CAF1A | CAF1P60 | MPHOSPH7 | MPP7 | 染色质组装因子1,B亚基(p60) | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western |
BioGRID | 12837248 |
ESR1 | ER DKFZp686N23123 | | ESR |将有关| |时代NR3A1 | 雌激素受体1 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12837248 |
PCNA | MGC8367 | 增殖细胞核抗原 | PCNA与WSTF | 绑定 | 15543136 |
SMARCA1 | DKFZp686D1623 | FLJ41547 | ISWI | NURF140 | SNF2L | SNF2L1 | SNF2LB |瑞士| SWI2 | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员1 | - - - - - - | HPRD | 11980720 |
SMARCA2 | BAF190 | BRM | FLJ36757 | MGC74511 | SNF2 | SNF2L2 | SNF2LA | SWI2 | Sth1p | hBRM | hSNF2a | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员2 | - - - - - - | HPRD | 12837248 |
SMARCA4 | BAF190 |缺失| FLJ39786 | SNF2 | SNF2-BETA | SNF2L4 | SNF2LB | SWI2 | hSNF2b | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员4 | - - - - - - | HPRD | 12837248 |
SMARCA5 | ISWI | SNF2H | WCRF135 | hISWI | hSNF2H | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员5 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11980720 |
SMARCB1 | BAF47 | INI1 | RDT | SNF5 | SNF5L1 | Sfh1p | Snr1 | hSNFS | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚b,成员1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12837248 |
SMARCC1 | BAF155 | CRACC1 | Rsc8 | SRG3 | SWI3 | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚c,成员1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12837248 |
SMARCC2 | BAF170 | CRACC2 | Rsc8 | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚c,成员2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12837248 |
SMARCD1 | BAF60A | CRACD1 | Rsc6p | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚d,成员1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12837248 |
SMARCE1 | BAF57 | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚e,成员1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12837248 |
SUPT16H | 事实CDC68 | | FACTP140 | FLJ10857 | FLJ14010 | FLJ34357 | SPT16 / CDC68 | 抑制的泰16同族体(酵母) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12837248 |
TOP2B | TOPIIB | top2beta | 拓扑异构酶(DNA) IIβ180 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12837248 |
TRNAG1 | TRG1 | 转移核糖核酸glycine1 (CCC)反密码子 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 12837248 |
论述 | NR1I1 | 维生素D (1,25 - dihydroxyvitamin D3)受体 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12837248 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 | 783年 | 507年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GINESTIER乳腺癌ZNF217放大DN | 335年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过小道HAMAI细胞凋亡 | 584年 | 356年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
胎儿肝脏DN MARTORIATI MDM4目标 | 514年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲 | 479年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN | 517年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BYSTROEM与IL5 DN | 64年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BYSTRYKH造血干细胞和大脑QTL反式 | 185年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李肿瘤对胎儿肾脏1 DN | 163年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DAZARD应对紫外线这些DN | 318年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标 | 824年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |