基因页面:PKD2L1
总结吗?
| GeneID | 9033年 |
| 象征 | PKD2L1 |
| 同义词 | PCL | PKD2L | PKDL | TRPP3 |
| 描述 | polycystin 2等1,瞬时受体电位阳离子通道 |
| 参考 | MIM: 604532|HGNC: HGNC: 9011|运用:ENSG00000107593|HPRD: 16063|织女:OTTHUMG00000018910 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 10抓起 |
| 帕斯卡假定值 | 2.133的军医 |
| 夏洛克假定值 | 0.295 |
| 胎儿β | -3.08 |
| eGene | 皮质 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2371122 | chr3 | 27858222 | PKD2L1 | 9033年 | 0.04 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MELK | 0.99 | 0.76 |
| SGOL1 | 0.99 | 0.70 |
| CDCA2 | 0.98 | 0.72 |
| BUB1 | 0.98 | 0.78 |
| DLGAP5 | 0.98 | 0.76 |
| TPX2 | 0.98 | 0.87 |
| KIF23 | 0.98 | 0.79 |
| BUB1B | 0.98 | 0.78 |
| KIF11 | 0.98 | 0.85 |
| CCNB2 | 0.98 | 0.70 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC9A3R2 | -0.37 | -0.47 |
| HLA-F | -0.36 | -0.71 |
| PTH1R | -0.36 | -0.63 |
| C5orf53 | -0.36 | -0.61 |
| FBXO2 | -0.35 | -0.55 |
| TNFSF12 | -0.35 | -0.56 |
| AIFM3 | -0.35 | -0.65 |
| AF347015.27 | -0.34 | -0.72 |
| S100B | -0.34 | -0.69 |
| AF347015.31 | -0.34 | -0.72 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 蔡对电离辐射的反应 | 149年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 福斯特KDM1A目标了 | 266年 | 142年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |