基因页:CCRL2
概括?
基因 | 9034 |
象征 | CCRL2 |
同义词 | ackr5 | ckrx | cram | cram-a | cram-b | hcr |
描述 | C-C基序趋化因子受体,例如2 |
参考 | MIM:608379|HGNC:HGNC:1612|ENSEMBL:ENSG00000121797|HPRD:16327|Vega:Otthumg00000156318 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21 |
Pascal P值 | 0.507 |
Sherlock P值 | 0.886 |
胎儿β | 0.884 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG10952220 | 3 | 46448671 | CCRL2 | 4.644e-4 | 0.397 | 0.046 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6588874 | 0 | CCRL2 | 9034 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CCRL2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ARF5 | 0.90 | 0.90 |
ASNA1 | 0.88 | 0.91 |
PSMD8 | 0.88 | 0.86 |
POP7 | 0.88 | 0.86 |
MCAT | 0.88 | 0.85 |
C19orf62 | 0.88 | 0.84 |
TSFM | 0.87 | 0.80 |
COPS6 | 0.87 | 0.84 |
yif1b | 0.87 | 0.85 |
MRPL37 | 0.86 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.26 | -0.68 | -0.60 |
AF347015.2 | -0.66 | -0.54 |
AF347015.8 | -0.64 | -0.53 |
AF347015.18 | -0.63 | -0.57 |
AF347015.33 | -0.63 | -0.55 |
mt-cyb | -0.63 | -0.54 |
MT-CO2 | -0.63 | -0.50 |
AF347015.15 | -0.62 | -0.53 |
AF347015.31 | -0.58 | -0.48 |
AF347015.9 | -0.57 | -0.53 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由EWS FLT1融合绑定的Siligan | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petrova内皮淋巴与血液DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dorsey GAB2目标 | 31 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤HP | 49 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Worschech肿瘤排斥 | 56 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞DN | 216 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEKI炎症反应LPS | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller AML融合DN的共同靶标 | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李最近的胸腺移民 | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村掺杂早期 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村脂肪形成晚期 | 104 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Altemeier对LPS具有机械通气的反应 | 128 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |