基因页:意大利面9
概括?
基因 | 9043 |
象征 | 意大利面9 |
同义词 | CT89 | HLC-6 | HLC4 | HLC6 | JIP-4 | JIP4 | JLP | PHET | PIG6 |
描述 | 精子相关的抗原9 |
参考 | MIM:605430|HGNC:HGNC:14524|Ensembl:ENSG00000008294|HPRD:10398|Vega:Otthumg00000162316 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17Q21.33 |
Pascal P值 | 0.006 |
Sherlock P值 | 0.005 |
胎儿β | 1.624 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
意大利面9 | CHR17 | 49048133 | C | t | NM_001130527 NM_001130528 NM_001251971 NM_003971 |
p.1252s> n p.1262s> n p.1118s> n p.1248s> n |
错过 错过 错过 错过 |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS693742 | CHR3 | 127494235 | 意大利面9 | 9043 | 0.18 | 反式 | ||
RS9289452 | CHR3 | 133429642 | 意大利面9 | 9043 | 0.15 | 反式 | ||
RS3926389 | CHR5 | 150677805 | 意大利面9 | 9043 | 0.17 | 反式 | ||
RS2068673 | CHR12 | 60333402 | 意大利面9 | 9043 | 0.01 | 反式 | ||
RS12876724 | CHR13 | 67078988 | 意大利面9 | 9043 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SPAG9_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
COPS3 | 0.89 | 0.86 |
RSL24D1 | 0.88 | 0.85 |
DRG1 | 0.88 | 0.84 |
txnl1 | 0.88 | 0.81 |
PPA1 | 0.88 | 0.80 |
GLRX3 | 0.86 | 0.85 |
CHMP5 | 0.86 | 0.87 |
mmadhc | 0.86 | 0.84 |
C1QBP | 0.86 | 0.90 |
OLA1 | 0.86 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.26 | -0.60 | -0.64 |
AF347015.2 | -0.57 | -0.59 |
mt-cyb | -0.56 | -0.58 |
AF347015.8 | -0.56 | -0.58 |
AF347015.33 | -0.56 | -0.60 |
AF347015.15 | -0.56 | -0.59 |
GPT | -0.55 | -0.60 |
MT-CO2 | -0.55 | -0.54 |
AF347015.18 | -0.53 | -0.64 |
FAM38A | -0.53 | -0.58 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID ARF6贩运途径 | 49 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房小叶癌与导管正常 | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues NTN1靶向DN | 158 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
仅通过ELK3的高缺氧 | 33 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath NOS目标 | 179 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭亮氨酸剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sana tnf发出信号 | 83 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园HSC标记 | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康拉德种系干细胞 | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dormoy Elavl1目标 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |