概括
基因 9043
象征 意大利面9
同义词 CT89 | HLC-6 | HLC4 | HLC6 | JIP-4 | JIP4 | JLP | PHET | PIG6
描述 精子相关的抗原9
参考 MIM:605430|HGNC:HGNC:14524|Ensembl:ENSG00000008294|HPRD:10398|Vega:Otthumg00000162316
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17Q21.33
Pascal P值 0.006
Sherlock P值 0.005
胎儿β 1.624
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
意大利面9 CHR17 49048133 C t NM_001130527
NM_001130528
NM_001251971
NM_003971
p.1252s> n
p.1262s> n
p.1118s> n
p.1248s> n
错过
错过
错过
错过
精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS693742 CHR3 127494235 意大利面9 9043 0.18 反式
RS9289452 CHR3 133429642 意大利面9 9043 0.15 反式
RS3926389 CHR5 150677805 意大利面9 9043 0.17 反式
RS2068673 CHR12 60333402 意大利面9 9043 0.01 反式
RS12876724 CHR13 67078988 意大利面9 9043 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
COPS3 0.89 0.86
RSL24D1 0.88 0.85
DRG1 0.88 0.84
txnl1 0.88 0.81
PPA1 0.88 0.80
GLRX3 0.86 0.85
CHMP5 0.86 0.87
mmadhc 0.86 0.84
C1QBP 0.86 0.90
OLA1 0.86 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.26 -0.60 -0.64
AF347015.2 -0.57 -0.59
mt-cyb -0.56 -0.58
AF347015.8 -0.56 -0.58
AF347015.33 -0.56 -0.60
AF347015.15 -0.56 -0.59
GPT -0.55 -0.60
MT-CO2 -0.55 -0.54
AF347015.18 -0.53 -0.64
FAM38A -0.53 -0.58

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID ARF6贩运途径 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与导管正常 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1靶向DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
仅通过ELK3的高缺氧 33 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath NOS目标 179 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sana tnf发出信号 83 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园HSC标记 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 114 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康拉德种系干细胞 13 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dormoy Elavl1目标 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因