基因页:Artn
概括?
基因 | 9048 |
象征 | Artn |
同义词 | enovin | evn | nbn |
描述 | Artemin |
参考 | MIM:603886|HGNC:HGNC:727|ENSEMBL:ENSG00000117407|HPRD:04863|Vega:Otthumg00000007705 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p34.1 |
Pascal P值 | 2.994E-4 |
胎儿β | 0.667 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 伏隔核基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21519202 | 1 | 44399534 | Artn | 1.588E-4 | -0.259 | 0.032 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ARTN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CACNB1 | 0.78 | 0.76 |
Aars | 0.78 | 0.79 |
PCMT1 | 0.77 | 0.77 |
IQWD1 | 0.76 | 0.77 |
ATP1A1 | 0.76 | 0.77 |
DCTN1 | 0.76 | 0.77 |
SCAMP5 | 0.76 | 0.74 |
是的 | 0.75 | 0.78 |
BECN1 | 0.75 | 0.78 |
STXBP1 | 0.75 | 0.75 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
IRF7 | -0.51 | -0.61 |
AF347015.21 | -0.50 | -0.37 |
AP002478.3 | -0.49 | -0.47 |
鼻孔 | -0.48 | -0.40 |
AF347015.18 | -0.47 | -0.35 |
C1orf54 | -0.45 | -0.40 |
IL32 | -0.45 | -0.39 |
GNG11 | -0.44 | -0.38 |
MT-CO2 | -0.44 | -0.37 |
C1orf61 | -0.44 | -0.49 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008083 | 生长因子活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007411 | 轴突指导 | IEA | Axon(GO期限:13) | - |
去:0007405 | 神经细胞增殖 | 塔斯 | 神经元(GO期限:8) | 9883723 |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 9883723 | |
去:0007422 | 周围神经系统发展 | IEA | - | |
去:0050930 | 诱导阳性趋化性 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NCAM1相互作用 | 39 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NCAM信号传导,用于神经突的生长 | 64 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村癌症微环境DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多恩乳腺癌类DN | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
埃尔维奇缺氧 | 171 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DMOG的Elvidge缺氧 | 130 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt 24小时DN的响应 | 33 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME2和H3K27ME3 | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由SALL4同工型绑定的RAO A | 182 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |