概括
基因 9048
象征 Artn
同义词 enovin | evn | nbn
描述 Artemin
参考 MIM:603886|HGNC:HGNC:727|ENSEMBL:ENSG00000117407|HPRD:04863|Vega:Otthumg00000007705
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p34.1
Pascal P值 2.994E-4
胎儿β 0.667
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21519202 1 44399534 Artn 1.588E-4 -0.259 0.032 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CACNB1 0.78 0.76
Aars 0.78 0.79
PCMT1 0.77 0.77
IQWD1 0.76 0.77
ATP1A1 0.76 0.77
DCTN1 0.76 0.77
SCAMP5 0.76 0.74
是的 0.75 0.78
BECN1 0.75 0.78
STXBP1 0.75 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
IRF7 -0.51 -0.61
AF347015.21 -0.50 -0.37
AP002478.3 -0.49 -0.47
鼻孔 -0.48 -0.40
AF347015.18 -0.47 -0.35
C1orf54 -0.45 -0.40
IL32 -0.45 -0.39
GNG11 -0.44 -0.38
MT-CO2 -0.44 -0.37
C1orf61 -0.44 -0.49

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008083 生长因子活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007411 轴突指导 IEA Axon(GO期限:13) -
去:0007405 神经细胞增殖 塔斯 神经元(GO期限:8) 9883723
去:0007165 信号转导 塔斯 9883723
去:0007422 周围神经系统发展 IEA -
去:0050930 诱导阳性趋化性 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005615 细胞外空间 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM1相互作用 39 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM信号传导,用于神经突的生长 64 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村癌症微环境DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多恩乳腺癌类DN 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG的Elvidge缺氧 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭葡萄糖剥夺DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江VHL目标 138 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 24小时DN的响应 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME2和H3K27ME3 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因