基因页面:PSTPIP1
总结吗?
| GeneID | 9051年 |
| 象征 | PSTPIP1 |
| 同义词 | CD2BP1 | CD2BP1L | CD2BP1S | H-PIP |’| PSTPIP |
| 描述 | proline-serine-threonine磷酸酶蛋白1进行交互 |
| 参考 | MIM: 606347|HGNC: HGNC: 9580|运用:ENSG00000140368|HPRD: 05891|织女:OTTHUMG00000172594 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 15 q24.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.823 |
| 夏洛克假定值 | 0.004 |
| 胎儿β | -0.329 |
| eGene | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2044453 | chr15 | 77423512 | PSTPIP1 | 9051年 | 0.18 | 独联体 | ||
| rs17384809 | chr15 | 77622005 | PSTPIP1 | 9051年 | 0.02 | 独联体 | ||
| rs12912084 | chr15 | 77697702 | PSTPIP1 | 9051年 | 0.04 | 独联体 | ||
| rs17471480 | chr15 | 77755549 | PSTPIP1 | 9051年 | 0.05 | 独联体 | ||
| rs4886874 | chr15 | 77838085 | PSTPIP1 | 9051年 | 0.02 | 独联体 | ||
| rs7747217 | chr6 | 3576943 | PSTPIP1 | 9051年 | 0 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ARHGEF7 | 0.92 | 0.93 |
| UBN1 | 0.91 | 0.92 |
| LARP4B | 0.91 | 0.92 |
| MGAT5 | 0.90 | 0.92 |
| KPNA6 | 0.90 | 0.91 |
| 阿达尔月 | 0.89 | 0.91 |
| ATRN | 0.89 | 0.90 |
| SMCR8 | 0.89 | 0.90 |
| KIAA1409 | 0.89 | 0.91 |
| CEP68 | 0.88 | 0.91 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.69 | -0.73 |
| FXYD1 | -0.69 | -0.73 |
| MT-CO2 | -0.68 | -0.73 |
| AF347015.21 | -0.68 | -0.76 |
| HIGD1B | -0.68 | -0.74 |
| HSD17B14 | -0.66 | -0.69 |
| AF347015.8 | -0.66 | -0.71 |
| CST3 | -0.66 | -0.72 |
| MT-CYB | -0.65 | -0.68 |
| AF347015.33 | -0.65 | -0.67 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003824 | 催化活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003779 | 肌动蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17353931 | |
| 去:0019903 | 蛋白磷酸酶绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007155 | 细胞粘附 | 助教 | 9857189 | |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 9857189 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0042995 | 细胞投影 | 国际能源机构 | 轴突(术语级别:4) | - - - - - - |
| 去:0001725 | 应力纤维 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005826 | 收缩环 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005856 | 细胞骨架 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ABL1 | ABL | JTK7 | bcr / ABL | c-ABL | p150 | v-abl | c-abl致癌基因1受体酪氨酸激酶 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11163214 |
| ATIC | 爱卡| AICARFT | FLJ93545 | IMPCHASE | PURH | 5-aminoimidazole-4-carboxamide核苷酸formyltransferase / IMP cyclohydrolase | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| BZW1 | BZAP45 | KIAA0005 | Nbla10236 | 基本亮氨酸拉链和W2域1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| BZW2 | HSPC028 | MST017 | MSTP017 | 基本亮氨酸拉链和W2域2 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| 张 | 抗体生成| T11 | 张cd分子 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9857189 |
| DDX21 | DKFZp686F21172 |卦| GURDB | RH-II /顾| RH-II /卦 | 死(Asp-Glu-Ala-Asp)框多肽21 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| FDFT1 | DGPT | ERG9 | SQS |党卫军 | farnesyl-diphosphate批1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| PTPN12 | PTP-PEST | PTPG1 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,non-receptor类型12 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9422760|11971877 |
| PTPN18 | BDP1 | PTP-HSCF | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,non-receptor类型18(脑源性) | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 9265651 |
| RPL18A | - - - - - - | 核糖体蛋白L18a | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL21 | DKFZp686C06101 | FLJ27458 | L21 | MGC104274 | MGC104275 | MGC71252 | 核糖体蛋白L21 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL23A | FLJ27455 | MDA20 | 核糖体蛋白L23a | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL26 | - - - - - - | 核糖体蛋白L26 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL29 | 臀部| HUMRPL29 | MGC88589 | 核糖体蛋白气密性好 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL3 | MGC104284 | TARBP-B | 核糖体蛋白L3 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL31 | MGC88191 | 核糖体蛋白L31 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL32 | PP9932 | 核糖体蛋白L32 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL34 | MGC111005 | 核糖体蛋白吧 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL35 | - - - - - - | 核糖体蛋白胶卷 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL35A | - - - - - - | 核糖体蛋白L35a | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL36 | DKFZp566B023 | 核糖体蛋白L36 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL36A | L44L | MGC72020 | MIG6 | RPL44 | 核糖体蛋白L36a | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RPL37A | MGC74786 | 核糖体蛋白L37a | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RUVBL1 | ECP54 | INO80H | NMP238 |庞丁| Pontin52 | RVB1 | TIH1 | TIP49 | TIP49A | RuvB-like 1(大肠杆菌) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| 是 | IMD2 | THC |黄蜂 | Wiskott-Aldrich综合征(eczema-thrombocytopenia) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9488710 |
| 是 | IMD2 | THC |黄蜂 | Wiskott-Aldrich综合征(eczema-thrombocytopenia) | PSTPIP1与黄蜂。 | 绑定 | 11313252 |
| WASF1 | 波FLJ31482 | KIAA0269 | SCAR1 | | WAVE1 | 是蛋白质家族,成员1 | - - - - - - | HPRD | 9804817 |
| WASF2 | SCAR2 | WAVE2 | dJ393P12.2 | 是蛋白质家族,成员2 | - - - - - - | HPRD | 9804817 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG点头像受体信号通路 | 62年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME先天免疫系统 | 279年 | 178年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME免疫系统 | 933年 | 616年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME的NLRP3 INFLAMMASOME | 12 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME INFLAMMASOMES | 17 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME核苷酸结合域NLR富亮氨酸重复包含受体信号通路 | 46 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应生活的DN | 384年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应费马DN | 284年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHIARADONNA肿瘤转化喀斯特DN | 142年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARKEY RB1慢性LOF DN | 118年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 邓恩的目标AML1 MTG8融合起来 | 52 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ALCALA细胞凋亡 | 88年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 费雷拉尤因肉瘤不稳定和稳定 | 167年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 瑞士POSTRADIATION肿瘤逃避DN | 373年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里奇尤因肉瘤祖 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 气浆细胞瘤了 | 259年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUTELLA CSF2RB和IL4 DN | 315年 | 201年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUTELLA应对HGF | 418年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 | 408年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| POOLA浸润性乳腺癌 | 288年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 H3K4ME3连结控制协定 | 162年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森IPS H3K4ME3连结控制协定 | 174年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3连结控制协定 | 142年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |